More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2910 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2910  acetylglutamate kinase  100 
 
 		 301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3297  acetylglutamate kinase  74.59 
 
 		 303 aa  446  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3095  acetylglutamate kinase  72.54 
 
 		 302 aa  410  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3341  acetylglutamate kinase  63.4 
 
 		 310 aa  364  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2342  acetylglutamate kinase  65.41 
 
 		 298 aa  364  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791434  normal  0.660777 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2621  acetylglutamate kinase  65.41 
 
 		 298 aa  364  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0678898 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2297  acetylglutamate kinase  65.07 
 
 		 298 aa  361  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  60.7 
 
 		 295 aa  360  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0075  acetylglutamate kinase  60.7 
 
 		 295 aa  359  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  60.35 
 
 		 295 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0464  acetylglutamate kinase  61.19 
 
 		 295 aa  358  7e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0868  acetylglutamate kinase  64.14 
 
 		 304 aa  358  7e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.990668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1384  acetylglutamate kinase  63.3 
 
 		 304 aa  358  8e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971931  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0297  acetylglutamate kinase  64.81 
 
 		 304 aa  355  5.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0380  acetylglutamate kinase  61.96 
 
 		 312 aa  355  6.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1358  acetylglutamate kinase  61.07 
 
 		 296 aa  352  5e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0966  acetylglutamate kinase  60.74 
 
 		 296 aa  351  8e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1025  acetylglutamate kinase  60.74 
 
 		 296 aa  351  8e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.977897  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1326  acetylglutamate kinase  59.17 
 
 		 301 aa  345  6e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0954  acetylglutamate kinase  63.14 
 
 		 297 aa  344  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.576098 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2143  acetylglutamate kinase  62.46 
 
 		 336 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1203  acetylglutamate kinase  61.05 
 
 		 294 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815716 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4558  acetylglutamate kinase  61.38 
 
 		 304 aa  335  5e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3700  acetylglutamate kinase  60.98 
 
 		 298 aa  332  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0633  acetylglutamate kinase  59.93 
 
 		 298 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7329  acetylglutamate kinase  60.63 
 
 		 298 aa  332  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3071  acetylglutamate kinase  60.28 
 
 		 298 aa  331  8e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0680  acetylglutamate kinase  59.93 
 
 		 298 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0814  acetylglutamate kinase  58.7 
 
 		 298 aa  328  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0072  acetylglutamate kinase  60 
 
 		 298 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00499393 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3330  acetylglutamate kinase  58.95 
 
 		 305 aa  326  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0352  acetylglutamate kinase  58.95 
 
 		 313 aa  322  4e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281091  normal  0.0894286 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0104  acetylglutamate kinase  55.99 
 
 		 295 aa  314  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2413  acetylglutamate kinase  55.36 
 
 		 296 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2995  acetylglutamate kinase  51 
 
 		 301 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3675  acetylglutamate kinase  52.61 
 
 		 300 aa  310  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0797606  normal  0.0933841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0225  acetylglutamate kinase  53.47 
 
 		 292 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21956  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0013  acetylglutamate kinase  60 
 
 		 302 aa  308  8e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0962097 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3682  N-acetylglutamate kinase  51.93 
 
 		 294 aa  306  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0182  acetylglutamate kinase  51.76 
 
 		 301 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0306646  hitchhiker  0.000000157401 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3560  acetylglutamate kinase  52.82 
 
 		 290 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02900  acetylglutamate kinase  52.46 
 
 		 300 aa  305  5.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0150  acetylglutamate kinase  53.12 
 
 		 292 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5543  acetylglutamate kinase  52.46 
 
 		 301 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5289  acetylglutamate kinase  51.41 
 
 		 301 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.92163 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4380  acetylglutamate kinase  52.11 
 
 		 301 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5339  acetylglutamate kinase  51.41 
 
 		 301 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.866501  hitchhiker  0.00605357 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5198  acetylglutamate kinase  51.41 
 
 		 301 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.934726  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1899  acetylglutamate kinase  51.76 
 
 		 304 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6099  acetylglutamate kinase  51.41 
 
 		 301 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780503  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0621  acetylglutamate kinase  50.87 
 
 		 302 aa  302  5.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000196007 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2984  N-acetylglutamate kinase  51.01 
 
 		 306 aa  302  5.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.492788  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2781  acetylglutamate kinase  54.93 
 
 		 300 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0084  acetylglutamate kinase  54.58 
 
 		 304 aa  301  7.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70280  acetylglutamate kinase  51.41 
 
 		 301 aa  301  9e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0203  acetylglutamate kinase  53.12 
 
 		 292 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512987 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3740  acetylglutamate kinase  50.69 
 
 		 292 aa  301  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3635  acetylglutamate kinase  50.69 
 
 		 292 aa  300  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  51.4 
 
 		 303 aa  299  4e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0082  acetylglutamate kinase  51.06 
 
 		 301 aa  299  5e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0218  acetylglutamate kinase  51.06 
 
 		 301 aa  299  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0064  acetylglutamate kinase  52.78 
 
 		 298 aa  296  3e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0256  acetylglutamate kinase  53.02 
 
 		 290 aa  296  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0433  acetylglutamate kinase  53.02 
 
 		 290 aa  296  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.394347  hitchhiker  0.0000000109203 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3479  acetylglutamate kinase  50.66 
 
 		 306 aa  295  8e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  0.537456 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0179  acetylglutamate kinase  51.35 
 
 		 295 aa  295  9e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.137233  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0579  acetylglutamate kinase  51.41 
 
 		 303 aa  292  4e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.503767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0659  acetylglutamate kinase  51.89 
 
 		 299 aa  291  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  51.58 
 
 		 294 aa  290  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0568  acetylglutamate kinase  51.06 
 
 		 299 aa  291  1e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1697  acetylglutamate kinase  51.03 
 
 		 299 aa  290  2e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3152  acetylglutamate kinase  50 
 
 		 292 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0588  acetylglutamate kinase  51.58 
 
 		 296 aa  290  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0568  acetylglutamate kinase  51.58 
 
 		 301 aa  289  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2865  acetylglutamate kinase  54.79 
 
 		 292 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1068  acetylglutamate kinase  55.14 
 
 		 293 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2729  acetylglutamate kinase  55.14 
 
 		 293 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0773  acetylglutamate kinase  51.58 
 
 		 297 aa  288  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1226  acetylglutamate kinase  51.36 
 
 		 296 aa  288  6e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  52.82 
 
 		 292 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3982  acetylglutamate kinase  50.53 
 
 		 305 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1321  acetylglutamate kinase  51.58 
 
 		 296 aa  286  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.463012 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1101  acetylglutamate kinase  53.33 
 
 		 293 aa  287  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.419485  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2296  acetylglutamate kinase  52.82 
 
 		 300 aa  286  4e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.576653  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0629  acetylglutamate kinase  51.4 
 
 		 295 aa  285  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.615358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3524  acetylglutamate kinase  49.82 
 
 		 296 aa  285  8e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4139  acetylglutamate kinase  50.18 
 
 		 296 aa  285  9e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9539  hitchhiker  0.00000200653 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0633  acetylglutamate kinase  52.26 
 
 		 285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3174  acetylglutamate kinase  48.26 
 
 		 292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.696563  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0273  acetylglutamate kinase  52.07 
 
 		 287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0444  acetylglutamate kinase  49.65 
 
 		 323 aa  281  1e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.646395  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0594  acetylglutamate kinase  49.31 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0675136  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1164  acetylglutamate kinase  49.83 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113745  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1116  acetylglutamate kinase  51.57 
 
 		 293 aa  280  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0880  acetylglutamate kinase  56.6 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00277635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0499  acetylglutamate kinase  50.88 
 
 		 304 aa  279  4e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.600707 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1906  acetylglutamate kinase  48.26 
 
 		 291 aa  278  6e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0488998  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0380  acetylglutamate kinase  48.77 
 
 		 351 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.734124  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3438  acetylglutamate kinase  48.77 
 
 		 299 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0185  acetylglutamate kinase  48.77 
 
 		 351 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.651482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>