More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1068 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2729  acetylglutamate kinase  100 
 
 
293 aa  579  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1068  acetylglutamate kinase  100 
 
 
293 aa  579  1e-164  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2865  acetylglutamate kinase  97.26 
 
 
292 aa  566  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0880  acetylglutamate kinase  84.83 
 
 
304 aa  482  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00277635  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0633  acetylglutamate kinase  69.86 
 
 
285 aa  394  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0324  acetylglutamate kinase  69.75 
 
 
287 aa  371  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.491958 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0301  acetylglutamate kinase  68.09 
 
 
286 aa  368  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.84379  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1203  acetylglutamate kinase  55.23 
 
 
294 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815716 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3330  acetylglutamate kinase  55.6 
 
 
305 aa  301  7.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3297  acetylglutamate kinase  53.16 
 
 
303 aa  294  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0352  acetylglutamate kinase  54.39 
 
 
313 aa  287  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281091  normal  0.0894286 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3095  acetylglutamate kinase  57.73 
 
 
302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0150  acetylglutamate kinase  50.35 
 
 
292 aa  285  7e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5289  acetylglutamate kinase  50.52 
 
 
301 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.92163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5198  acetylglutamate kinase  50.52 
 
 
301 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.934726  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5339  acetylglutamate kinase  50.52 
 
 
301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.866501  hitchhiker  0.00605357 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2143  acetylglutamate kinase  55.14 
 
 
336 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0203  acetylglutamate kinase  50.35 
 
 
292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512987 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0464  acetylglutamate kinase  52.63 
 
 
295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0182  acetylglutamate kinase  50.86 
 
 
301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0306646  hitchhiker  0.000000157401 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3675  acetylglutamate kinase  51.57 
 
 
300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0797606  normal  0.0933841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0072  acetylglutamate kinase  53.61 
 
 
298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00499393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0633  acetylglutamate kinase  52.92 
 
 
298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0297  acetylglutamate kinase  55.05 
 
 
304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3071  acetylglutamate kinase  52.41 
 
 
298 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0075  acetylglutamate kinase  52.28 
 
 
295 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6099  acetylglutamate kinase  49.66 
 
 
301 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780503  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0814  acetylglutamate kinase  52.41 
 
 
298 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5543  acetylglutamate kinase  50.68 
 
 
301 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0680  acetylglutamate kinase  52.58 
 
 
298 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3700  acetylglutamate kinase  52.76 
 
 
298 aa  280  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0868  acetylglutamate kinase  54.14 
 
 
304 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.990668  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  50.53 
 
 
303 aa  279  3e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1326  acetylglutamate kinase  52.26 
 
 
301 aa  280  3e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70280  acetylglutamate kinase  49.66 
 
 
301 aa  279  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0256  acetylglutamate kinase  51.76 
 
 
290 aa  278  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0433  acetylglutamate kinase  51.76 
 
 
290 aa  278  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.394347  hitchhiker  0.0000000109203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7329  acetylglutamate kinase  51.7 
 
 
298 aa  278  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3740  acetylglutamate kinase  49.48 
 
 
292 aa  278  9e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1384  acetylglutamate kinase  54.17 
 
 
304 aa  278  9e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971931  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0621  acetylglutamate kinase  47.77 
 
 
302 aa  276  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000196007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3341  acetylglutamate kinase  53.95 
 
 
310 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0954  acetylglutamate kinase  55.59 
 
 
297 aa  276  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.576098 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3635  acetylglutamate kinase  49.48 
 
 
292 aa  276  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  51.23 
 
 
295 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2995  acetylglutamate kinase  48.44 
 
 
301 aa  276  3e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4380  acetylglutamate kinase  50 
 
 
301 aa  275  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3560  acetylglutamate kinase  50.18 
 
 
290 aa  276  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1697  acetylglutamate kinase  50 
 
 
299 aa  275  5e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  50.88 
 
 
295 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2910  acetylglutamate kinase  55.14 
 
 
301 aa  275  6e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872032  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0225  acetylglutamate kinase  49.82 
 
 
292 aa  275  8e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21956  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0380  acetylglutamate kinase  51.99 
 
 
312 aa  275  8e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2342  acetylglutamate kinase  53.82 
 
 
298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791434  normal  0.660777 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2621  acetylglutamate kinase  53.82 
 
 
298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0678898 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2413  acetylglutamate kinase  49.65 
 
 
296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0659  acetylglutamate kinase  50.53 
 
 
299 aa  273  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0104  acetylglutamate kinase  51.74 
 
 
295 aa  271  6e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0013  acetylglutamate kinase  55.52 
 
 
302 aa  271  7e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0962097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2297  acetylglutamate kinase  53.47 
 
 
298 aa  270  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0084  acetylglutamate kinase  50 
 
 
304 aa  271  1e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0629  acetylglutamate kinase  50 
 
 
295 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.615358  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2984  N-acetylglutamate kinase  47.84 
 
 
306 aa  269  5e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.492788  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0082  acetylglutamate kinase  50.53 
 
 
301 aa  268  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0218  acetylglutamate kinase  50.53 
 
 
301 aa  268  7e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0579  acetylglutamate kinase  49.83 
 
 
303 aa  268  7e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.503767  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0179  acetylglutamate kinase  49.83 
 
 
295 aa  268  8.999999999999999e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.137233  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0568  acetylglutamate kinase  50.18 
 
 
299 aa  267  2e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02900  acetylglutamate kinase  48.32 
 
 
300 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1081  acetylglutamate kinase  46.76 
 
 
280 aa  266  4e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0152417  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3479  acetylglutamate kinase  47.92 
 
 
306 aa  265  8.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  0.537456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3982  acetylglutamate kinase  47.57 
 
 
305 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3174  acetylglutamate kinase  47.06 
 
 
292 aa  264  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.696563  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2296  acetylglutamate kinase  50.86 
 
 
300 aa  263  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.576653  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3682  N-acetylglutamate kinase  47.26 
 
 
294 aa  263  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  48.24 
 
 
294 aa  263  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1899  acetylglutamate kinase  48.08 
 
 
304 aa  262  4e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  48.63 
 
 
292 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1358  acetylglutamate kinase  51.2 
 
 
296 aa  260  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0966  acetylglutamate kinase  51.2 
 
 
296 aa  259  4e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1025  acetylglutamate kinase  51.2 
 
 
296 aa  259  4e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.977897  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0064  acetylglutamate kinase  49.31 
 
 
298 aa  259  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2781  acetylglutamate kinase  49.47 
 
 
300 aa  258  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1906  acetylglutamate kinase  46.13 
 
 
291 aa  258  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0488998  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2494  acetylglutamate kinase  47.92 
 
 
291 aa  256  4e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1164  acetylglutamate kinase  47.4 
 
 
300 aa  255  5e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0771  acetylglutamate kinase  48.63 
 
 
298 aa  255  6e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0539  acetylglutamate kinase  46.83 
 
 
303 aa  254  8e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0773  acetylglutamate kinase  47.22 
 
 
297 aa  254  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4558  acetylglutamate kinase  49.83 
 
 
304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2686  N-acetylglutamate kinase  46.32 
 
 
293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1321  acetylglutamate kinase  47.22 
 
 
296 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.463012 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0499  acetylglutamate kinase  47.22 
 
 
304 aa  253  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.600707 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0588  acetylglutamate kinase  46.53 
 
 
296 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0568  acetylglutamate kinase  46.53 
 
 
301 aa  251  7e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1041  acetylglutamate kinase  46.62 
 
 
282 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0274311  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0341  acetylglutamate kinase  47.04 
 
 
305 aa  251  8.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0128  acetylglutamate kinase  46.07 
 
 
281 aa  251  1e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4139  acetylglutamate kinase  45.49 
 
 
296 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9539  hitchhiker  0.00000200653 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3152  acetylglutamate kinase  44.14 
 
 
292 aa  250  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>