More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0072 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0072  acetylglutamate kinase  100 
 
 		 298 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00499393 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0680  acetylglutamate kinase  97.32 
 
 		 298 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0633  acetylglutamate kinase  95.64 
 
 		 298 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0814  acetylglutamate kinase  93.96 
 
 		 298 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7329  acetylglutamate kinase  91.95 
 
 		 298 aa  528  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3700  acetylglutamate kinase  91.61 
 
 		 298 aa  526  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3071  acetylglutamate kinase  90.6 
 
 		 298 aa  521  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0868  acetylglutamate kinase  72.47 
 
 		 304 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.990668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1384  acetylglutamate kinase  73.87 
 
 		 304 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971931  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0013  acetylglutamate kinase  73.87 
 
 		 302 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0962097 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3330  acetylglutamate kinase  69.44 
 
 		 305 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1203  acetylglutamate kinase  70.14 
 
 		 294 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815716 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2621  acetylglutamate kinase  69.8 
 
 		 298 aa  401  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0678898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2342  acetylglutamate kinase  69.8 
 
 		 298 aa  401  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791434  normal  0.660777 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0954  acetylglutamate kinase  68.12 
 
 		 297 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.576098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2297  acetylglutamate kinase  69.13 
 
 		 298 aa  397  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0075  acetylglutamate kinase  65.61 
 
 		 295 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0464  acetylglutamate kinase  65.96 
 
 		 295 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  67.02 
 
 		 295 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0380  acetylglutamate kinase  68.48 
 
 		 312 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  66.67 
 
 		 295 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1358  acetylglutamate kinase  67.13 
 
 		 296 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1025  acetylglutamate kinase  67.13 
 
 		 296 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.977897  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0966  acetylglutamate kinase  67.13 
 
 		 296 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1326  acetylglutamate kinase  64.21 
 
 		 301 aa  377  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0297  acetylglutamate kinase  64.95 
 
 		 304 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2143  acetylglutamate kinase  63.07 
 
 		 336 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3341  acetylglutamate kinase  60.78 
 
 		 310 aa  339  4e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3297  acetylglutamate kinase  57.39 
 
 		 303 aa  336  2.9999999999999997e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2910  acetylglutamate kinase  60 
 
 		 301 aa  330  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3095  acetylglutamate kinase  60.28 
 
 		 302 aa  329  3e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0352  acetylglutamate kinase  56.79 
 
 		 313 aa  328  5.0000000000000004e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281091  normal  0.0894286 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4558  acetylglutamate kinase  58.22 
 
 		 304 aa  323  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0633  acetylglutamate kinase  52.63 
 
 		 285 aa  305  5.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0064  acetylglutamate kinase  52.96 
 
 		 298 aa  304  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0150  acetylglutamate kinase  52.25 
 
 		 292 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2729  acetylglutamate kinase  53.61 
 
 		 293 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1068  acetylglutamate kinase  53.61 
 
 		 293 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3682  N-acetylglutamate kinase  48.12 
 
 		 294 aa  302  5.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0203  acetylglutamate kinase  52.6 
 
 		 292 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512987 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2865  acetylglutamate kinase  53.26 
 
 		 292 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0225  acetylglutamate kinase  53.31 
 
 		 292 aa  299  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21956  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6099  acetylglutamate kinase  50.7 
 
 		 301 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780503  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70280  acetylglutamate kinase  50.7 
 
 		 301 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5289  acetylglutamate kinase  50.7 
 
 		 301 aa  295  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.92163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5198  acetylglutamate kinase  50.7 
 
 		 301 aa  295  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.934726  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0182  acetylglutamate kinase  50.7 
 
 		 301 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0306646  hitchhiker  0.000000157401 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5339  acetylglutamate kinase  50.7 
 
 		 301 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.866501  hitchhiker  0.00605357 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3152  acetylglutamate kinase  50.87 
 
 		 292 aa  295  9e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5543  acetylglutamate kinase  50.35 
 
 		 301 aa  294  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1899  acetylglutamate kinase  50.35 
 
 		 304 aa  294  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3675  acetylglutamate kinase  48.59 
 
 		 300 aa  292  5e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0797606  normal  0.0933841 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2413  acetylglutamate kinase  49.13 
 
 		 296 aa  291  6e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4380  acetylglutamate kinase  50.35 
 
 		 301 aa  290  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02900  acetylglutamate kinase  49.48 
 
 		 300 aa  289  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2995  acetylglutamate kinase  48.25 
 
 		 301 aa  288  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0104  acetylglutamate kinase  49.83 
 
 		 295 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0433  acetylglutamate kinase  50.17 
 
 		 290 aa  286  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.394347  hitchhiker  0.0000000109203 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0256  acetylglutamate kinase  50.17 
 
 		 290 aa  286  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2686  N-acetylglutamate kinase  50 
 
 		 293 aa  286  4e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3174  acetylglutamate kinase  49.13 
 
 		 292 aa  285  5.999999999999999e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.696563  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0324  acetylglutamate kinase  52.94 
 
 		 287 aa  285  9e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.491958 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  47.55 
 
 		 303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2781  acetylglutamate kinase  50 
 
 		 300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0082  acetylglutamate kinase  49.3 
 
 		 301 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0218  acetylglutamate kinase  49.3 
 
 		 301 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0629  acetylglutamate kinase  48.97 
 
 		 295 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.615358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1116  acetylglutamate kinase  50.17 
 
 		 293 aa  282  5.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4139  acetylglutamate kinase  49.16 
 
 		 296 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9539  hitchhiker  0.00000200653 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2984  N-acetylglutamate kinase  48.06 
 
 		 306 aa  281  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.492788  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0621  acetylglutamate kinase  49.13 
 
 		 302 aa  280  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000196007 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3479  acetylglutamate kinase  48.64 
 
 		 306 aa  280  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  0.537456 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3635  acetylglutamate kinase  49.31 
 
 		 292 aa  279  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0273  acetylglutamate kinase  48.98 
 
 		 287 aa  279  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0028  acetylglutamate kinase  48.61 
 
 		 297 aa  278  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1162  acetylglutamate kinase  47.92 
 
 		 309 aa  278  8e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.174929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1131  acetylglutamate kinase  47.92 
 
 		 309 aa  278  8e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2296  acetylglutamate kinase  47.65 
 
 		 300 aa  278  1e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.576653  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0579  acetylglutamate kinase  49.3 
 
 		 303 aa  277  1e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.503767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3740  acetylglutamate kinase  48.96 
 
 		 292 aa  277  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0301  acetylglutamate kinase  51.9 
 
 		 286 aa  277  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.84379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0179  acetylglutamate kinase  49.15 
 
 		 295 aa  277  2e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.137233  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3560  acetylglutamate kinase  46.5 
 
 		 290 aa  276  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  50.35 
 
 		 292 aa  276  4e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1496  acetylglutamate kinase  48.79 
 
 		 301 aa  276  4e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2015  acetylglutamate kinase  51.57 
 
 		 295 aa  275  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000238351  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0084  acetylglutamate kinase  45.97 
 
 		 304 aa  275  5e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1226  acetylglutamate kinase  48.99 
 
 		 296 aa  275  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0568  acetylglutamate kinase  48.95 
 
 		 299 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3982  acetylglutamate kinase  47.77 
 
 		 305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  49.47 
 
 		 294 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0554  acetylglutamate kinase  47.22 
 
 		 297 aa  272  6e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879034  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0594  acetylglutamate kinase  48.61 
 
 		 321 aa  272  6e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0675136  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0568  acetylglutamate kinase  49.32 
 
 		 295 aa  272  6e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00120396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1153  acetylglutamate kinase  46.31 
 
 		 292 aa  271  9e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0296435  hitchhiker  0.00582367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1164  acetylglutamate kinase  47.93 
 
 		 300 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113745  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1854  acetylglutamate kinase  47.06 
 
 		 296 aa  271  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0306  acetylglutamate kinase  53.33 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.531826 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0444  acetylglutamate kinase  47.92 
 
 		 323 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.646395  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1906  acetylglutamate kinase  47.06 
 
 		 291 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0488998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>