More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0306 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0306  acetylglutamate kinase  100 
 
 
320 aa  645    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.531826 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1613  acetylglutamate kinase  82.74 
 
 
308 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.778617  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2015  acetylglutamate kinase  79.65 
 
 
295 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000238351  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0550  acetylglutamate kinase  70.88 
 
 
292 aa  403  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1101  acetylglutamate kinase  68.07 
 
 
293 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.419485  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0064  acetylglutamate kinase  60.55 
 
 
298 aa  344  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1899  acetylglutamate kinase  58.28 
 
 
304 aa  342  5e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5289  acetylglutamate kinase  57.48 
 
 
301 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.92163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5198  acetylglutamate kinase  57.48 
 
 
301 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.934726  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0182  acetylglutamate kinase  57.99 
 
 
301 aa  338  5e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0306646  hitchhiker  0.000000157401 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5339  acetylglutamate kinase  57.14 
 
 
301 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.866501  hitchhiker  0.00605357 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0104  acetylglutamate kinase  59.15 
 
 
295 aa  338  8e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4380  acetylglutamate kinase  58.68 
 
 
301 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6099  acetylglutamate kinase  58.1 
 
 
301 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780503  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70280  acetylglutamate kinase  58.1 
 
 
301 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5543  acetylglutamate kinase  58.1 
 
 
301 aa  335  9e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0082  acetylglutamate kinase  56.94 
 
 
301 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0218  acetylglutamate kinase  56.94 
 
 
301 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0150  acetylglutamate kinase  58.1 
 
 
292 aa  331  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0203  acetylglutamate kinase  58.1 
 
 
292 aa  330  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512987 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0225  acetylglutamate kinase  57.69 
 
 
292 aa  331  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21956  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2413  acetylglutamate kinase  56.49 
 
 
296 aa  329  4e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3174  acetylglutamate kinase  58.21 
 
 
292 aa  328  9e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.696563  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2494  acetylglutamate kinase  57.89 
 
 
291 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3682  N-acetylglutamate kinase  57.65 
 
 
294 aa  327  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02900  acetylglutamate kinase  55.36 
 
 
300 aa  324  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0256  acetylglutamate kinase  53.33 
 
 
290 aa  323  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0433  acetylglutamate kinase  53.33 
 
 
290 aa  323  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.394347  hitchhiker  0.0000000109203 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3740  acetylglutamate kinase  56.34 
 
 
292 aa  322  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2781  acetylglutamate kinase  56.79 
 
 
300 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2995  acetylglutamate kinase  54.9 
 
 
301 aa  321  9.000000000000001e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3152  acetylglutamate kinase  57.75 
 
 
292 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3635  acetylglutamate kinase  55.99 
 
 
292 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0621  acetylglutamate kinase  54.58 
 
 
302 aa  318  5e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000196007 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2296  acetylglutamate kinase  55.59 
 
 
300 aa  318  7.999999999999999e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.576653  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3560  acetylglutamate kinase  55.28 
 
 
290 aa  316  3e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0084  acetylglutamate kinase  54.55 
 
 
304 aa  315  6e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3675  acetylglutamate kinase  53.29 
 
 
300 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0797606  normal  0.0933841 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  53.29 
 
 
295 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1116  acetylglutamate kinase  53.92 
 
 
293 aa  310  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0464  acetylglutamate kinase  51.37 
 
 
295 aa  310  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3297  acetylglutamate kinase  52.35 
 
 
303 aa  310  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2984  N-acetylglutamate kinase  53.42 
 
 
306 aa  309  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.492788  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0352  acetylglutamate kinase  52.76 
 
 
313 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281091  normal  0.0894286 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3341  acetylglutamate kinase  57.34 
 
 
310 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0075  acetylglutamate kinase  51.37 
 
 
295 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  51.9 
 
 
295 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  53.71 
 
 
292 aa  306  3e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1164  acetylglutamate kinase  53.5 
 
 
300 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113745  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3479  acetylglutamate kinase  48.68 
 
 
306 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  0.537456 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0179  acetylglutamate kinase  52.92 
 
 
295 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.137233  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  50.67 
 
 
303 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0629  acetylglutamate kinase  51.76 
 
 
295 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.615358  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0380  acetylglutamate kinase  54.15 
 
 
312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  51.22 
 
 
294 aa  301  1e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1864  acetylglutamate kinase  50.69 
 
 
304 aa  299  4e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1326  acetylglutamate kinase  51.05 
 
 
301 aa  296  2e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3717  acetylglutamate kinase  47.39 
 
 
308 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3394  acetylglutamate kinase  47.06 
 
 
308 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3330  acetylglutamate kinase  51.57 
 
 
305 aa  296  5e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0160  acetylglutamate kinase  50 
 
 
355 aa  295  9e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0415  acetylglutamate kinase  53.95 
 
 
299 aa  294  1e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0188997  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0297  acetylglutamate kinase  53.85 
 
 
304 aa  294  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2143  acetylglutamate kinase  53.95 
 
 
336 aa  294  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1384  acetylglutamate kinase  51.8 
 
 
304 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971931  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3982  acetylglutamate kinase  50.35 
 
 
305 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0033  acetylglutamate kinase  46.08 
 
 
310 aa  293  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1226  acetylglutamate kinase  48.81 
 
 
296 aa  293  3e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2179  acetylglutamate kinase  49.47 
 
 
351 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7329  acetylglutamate kinase  53.68 
 
 
298 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0380  acetylglutamate kinase  49.47 
 
 
351 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.734124  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1321  acetylglutamate kinase  50.18 
 
 
296 aa  293  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.463012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0338  acetylglutamate kinase  49.47 
 
 
299 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3524  acetylglutamate kinase  48.59 
 
 
296 aa  293  3e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4385  acetylglutamate kinase  49.47 
 
 
299 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614022  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2910  acetylglutamate kinase  49.47 
 
 
351 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.290051  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0185  acetylglutamate kinase  49.47 
 
 
351 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.651482  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0064  acetylglutamate kinase  49.47 
 
 
299 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207968  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3249  acetylglutamate kinase  49.47 
 
 
299 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219346  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0195  acetylglutamate kinase  49.47 
 
 
299 aa  292  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3438  acetylglutamate kinase  49.47 
 
 
299 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0499  acetylglutamate kinase  48.63 
 
 
304 aa  291  7e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.600707 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0868  acetylglutamate kinase  51.48 
 
 
304 aa  290  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.990668  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0954  acetylglutamate kinase  54.2 
 
 
297 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.576098 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0814  acetylglutamate kinase  53.68 
 
 
298 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3143  acetylglutamate kinase  49.47 
 
 
344 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.537624  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2686  N-acetylglutamate kinase  48.94 
 
 
293 aa  290  3e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3005  acetylglutamate kinase  49.47 
 
 
299 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.68107 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0588  acetylglutamate kinase  48.77 
 
 
296 aa  289  4e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0568  acetylglutamate kinase  48.77 
 
 
301 aa  289  4e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0273  acetylglutamate kinase  51.72 
 
 
287 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3092  acetylglutamate kinase  49.47 
 
 
321 aa  288  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.144382 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1358  acetylglutamate kinase  53.47 
 
 
296 aa  288  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0773  acetylglutamate kinase  48.24 
 
 
297 aa  288  7e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0579  acetylglutamate kinase  49.49 
 
 
303 aa  288  7e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.503767  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0180  acetylglutamate kinase  47.72 
 
 
309 aa  288  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1203  acetylglutamate kinase  49.48 
 
 
294 aa  288  8e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815716 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6447  acetylglutamate kinase  49.47 
 
 
299 aa  288  8e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.635335  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3112  acetylglutamate kinase  49.47 
 
 
299 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.421465 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2288  acetylglutamate kinase  53.12 
 
 
296 aa  288  8e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.574269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>