More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3341 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3341  acetylglutamate kinase  100 
 
 
310 aa  620  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0297  acetylglutamate kinase  67.36 
 
 
304 aa  371  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3297  acetylglutamate kinase  65.08 
 
 
303 aa  365  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2910  acetylglutamate kinase  63.4 
 
 
301 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872032  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0352  acetylglutamate kinase  64.11 
 
 
313 aa  358  7e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281091  normal  0.0894286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2143  acetylglutamate kinase  62.63 
 
 
336 aa  356  1.9999999999999998e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  62.11 
 
 
295 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  62.11 
 
 
295 aa  349  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3095  acetylglutamate kinase  61.81 
 
 
302 aa  349  3e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0380  acetylglutamate kinase  62.46 
 
 
312 aa  347  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0464  acetylglutamate kinase  61.4 
 
 
295 aa  345  5e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0075  acetylglutamate kinase  61.4 
 
 
295 aa  345  6e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1025  acetylglutamate kinase  63.86 
 
 
296 aa  343  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.977897  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0633  acetylglutamate kinase  62.5 
 
 
298 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0966  acetylglutamate kinase  63.86 
 
 
296 aa  343  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0814  acetylglutamate kinase  62.85 
 
 
298 aa  342  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0868  acetylglutamate kinase  62.5 
 
 
304 aa  342  4e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.990668  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1358  acetylglutamate kinase  63.16 
 
 
296 aa  342  5.999999999999999e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1384  acetylglutamate kinase  62.15 
 
 
304 aa  341  8e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971931  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7329  acetylglutamate kinase  60.13 
 
 
298 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0072  acetylglutamate kinase  60.78 
 
 
298 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00499393 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3071  acetylglutamate kinase  61.81 
 
 
298 aa  338  5e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3700  acetylglutamate kinase  61.81 
 
 
298 aa  339  5e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0680  acetylglutamate kinase  62.5 
 
 
298 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2621  acetylglutamate kinase  59.42 
 
 
298 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0678898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2342  acetylglutamate kinase  59.42 
 
 
298 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791434  normal  0.660777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4558  acetylglutamate kinase  61.36 
 
 
304 aa  335  5e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2297  acetylglutamate kinase  59.15 
 
 
298 aa  334  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1326  acetylglutamate kinase  59.3 
 
 
301 aa  329  3e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3675  acetylglutamate kinase  55.75 
 
 
300 aa  327  1.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0797606  normal  0.0933841 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1203  acetylglutamate kinase  59.65 
 
 
294 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0954  acetylglutamate kinase  60.14 
 
 
297 aa  326  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.576098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5289  acetylglutamate kinase  55.94 
 
 
301 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.92163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5198  acetylglutamate kinase  55.94 
 
 
301 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.934726  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5339  acetylglutamate kinase  55.94 
 
 
301 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.866501  hitchhiker  0.00605357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0182  acetylglutamate kinase  55.59 
 
 
301 aa  321  8e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0306646  hitchhiker  0.000000157401 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6099  acetylglutamate kinase  56.69 
 
 
301 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780503  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70280  acetylglutamate kinase  56.69 
 
 
301 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5543  acetylglutamate kinase  54.9 
 
 
301 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4380  acetylglutamate kinase  56.34 
 
 
301 aa  317  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0433  acetylglutamate kinase  56.06 
 
 
290 aa  315  5e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.394347  hitchhiker  0.0000000109203 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0256  acetylglutamate kinase  56.06 
 
 
290 aa  315  5e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3330  acetylglutamate kinase  57.34 
 
 
305 aa  315  6e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3682  N-acetylglutamate kinase  55.56 
 
 
294 aa  315  7e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0104  acetylglutamate kinase  55.48 
 
 
295 aa  314  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0064  acetylglutamate kinase  55.29 
 
 
298 aa  313  2.9999999999999996e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2781  acetylglutamate kinase  57.39 
 
 
300 aa  311  9e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0633  acetylglutamate kinase  57.09 
 
 
285 aa  311  9e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0225  acetylglutamate kinase  55.56 
 
 
292 aa  310  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21956  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2413  acetylglutamate kinase  54.83 
 
 
296 aa  311  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0013  acetylglutamate kinase  56.39 
 
 
302 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0962097 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2995  acetylglutamate kinase  54.01 
 
 
301 aa  310  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0203  acetylglutamate kinase  55.36 
 
 
292 aa  310  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512987 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02900  acetylglutamate kinase  53.79 
 
 
300 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0621  acetylglutamate kinase  52.72 
 
 
302 aa  309  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000196007 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0150  acetylglutamate kinase  53.98 
 
 
292 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0082  acetylglutamate kinase  54.58 
 
 
301 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0218  acetylglutamate kinase  54.58 
 
 
301 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0579  acetylglutamate kinase  54.23 
 
 
303 aa  305  5.0000000000000004e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.503767  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  53.87 
 
 
303 aa  305  7e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0324  acetylglutamate kinase  57.44 
 
 
287 aa  305  9.000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.491958 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1899  acetylglutamate kinase  52.8 
 
 
304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  56.4 
 
 
294 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0568  acetylglutamate kinase  53.87 
 
 
299 aa  302  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3560  acetylglutamate kinase  52.61 
 
 
290 aa  302  5.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0773  acetylglutamate kinase  56.25 
 
 
297 aa  301  8.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3740  acetylglutamate kinase  53.1 
 
 
292 aa  301  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3635  acetylglutamate kinase  53.1 
 
 
292 aa  300  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0444  acetylglutamate kinase  52.25 
 
 
323 aa  300  3e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.646395  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3479  acetylglutamate kinase  54.7 
 
 
306 aa  299  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  0.537456 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1116  acetylglutamate kinase  56.6 
 
 
293 aa  298  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0594  acetylglutamate kinase  51.21 
 
 
321 aa  298  1e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0675136  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0084  acetylglutamate kinase  53.68 
 
 
304 aa  297  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2015  acetylglutamate kinase  55.59 
 
 
295 aa  296  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000238351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3174  acetylglutamate kinase  52.05 
 
 
292 aa  296  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.696563  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4139  acetylglutamate kinase  56.25 
 
 
296 aa  296  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9539  hitchhiker  0.00000200653 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2494  acetylglutamate kinase  52.56 
 
 
291 aa  296  4e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2865  acetylglutamate kinase  54.86 
 
 
292 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0179  acetylglutamate kinase  53.5 
 
 
295 aa  294  1e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.137233  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0306  acetylglutamate kinase  57.34 
 
 
320 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.531826 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1164  acetylglutamate kinase  54.83 
 
 
300 aa  294  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113745  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3982  acetylglutamate kinase  54.17 
 
 
305 aa  294  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2686  N-acetylglutamate kinase  54.51 
 
 
293 aa  293  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1068  acetylglutamate kinase  53.95 
 
 
293 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2729  acetylglutamate kinase  53.95 
 
 
293 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0539  acetylglutamate kinase  54.86 
 
 
303 aa  291  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  54.93 
 
 
292 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2296  acetylglutamate kinase  53.68 
 
 
300 aa  290  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.576653  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1321  acetylglutamate kinase  54.36 
 
 
296 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.463012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1226  acetylglutamate kinase  54.01 
 
 
296 aa  289  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3005  acetylglutamate kinase  52.61 
 
 
299 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.68107 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3249  acetylglutamate kinase  52.26 
 
 
299 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219346  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3438  acetylglutamate kinase  52.26 
 
 
299 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3143  acetylglutamate kinase  52.61 
 
 
344 aa  289  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.537624  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0195  acetylglutamate kinase  52.26 
 
 
299 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2910  acetylglutamate kinase  52.26 
 
 
351 aa  288  6e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.290051  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0380  acetylglutamate kinase  52.26 
 
 
351 aa  288  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.734124  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2179  acetylglutamate kinase  52.26 
 
 
351 aa  288  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3152  acetylglutamate kinase  52.08 
 
 
292 aa  288  6e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0185  acetylglutamate kinase  52.26 
 
 
351 aa  288  6e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.651482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>