More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1899 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1899  acetylglutamate kinase  100 
 
 
304 aa  611  9.999999999999999e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2995  acetylglutamate kinase  73.74 
 
 
301 aa  448  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4380  acetylglutamate kinase  70.47 
 
 
301 aa  428  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5289  acetylglutamate kinase  69.8 
 
 
301 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.92163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5339  acetylglutamate kinase  69.8 
 
 
301 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.866501  hitchhiker  0.00605357 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02900  acetylglutamate kinase  69.13 
 
 
300 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5198  acetylglutamate kinase  69.8 
 
 
301 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.934726  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0084  acetylglutamate kinase  71.77 
 
 
304 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6099  acetylglutamate kinase  68.46 
 
 
301 aa  421  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780503  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0182  acetylglutamate kinase  69.46 
 
 
301 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0306646  hitchhiker  0.000000157401 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0082  acetylglutamate kinase  69.13 
 
 
301 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0218  acetylglutamate kinase  69.13 
 
 
301 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0104  acetylglutamate kinase  70.17 
 
 
295 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70280  acetylglutamate kinase  68.46 
 
 
301 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2781  acetylglutamate kinase  69.28 
 
 
300 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3675  acetylglutamate kinase  69.18 
 
 
300 aa  415  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0797606  normal  0.0933841 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5543  acetylglutamate kinase  67.79 
 
 
301 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3560  acetylglutamate kinase  69.1 
 
 
290 aa  412  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2296  acetylglutamate kinase  70.73 
 
 
300 aa  410  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.576653  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2984  N-acetylglutamate kinase  66.89 
 
 
306 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.492788  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0621  acetylglutamate kinase  64.65 
 
 
302 aa  398  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000196007 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0179  acetylglutamate kinase  66.43 
 
 
295 aa  391  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.137233  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1116  acetylglutamate kinase  66.44 
 
 
293 aa  389  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0579  acetylglutamate kinase  65.32 
 
 
303 aa  381  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.503767  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0629  acetylglutamate kinase  64.88 
 
 
295 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.615358  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0568  acetylglutamate kinase  65.32 
 
 
299 aa  381  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  64.19 
 
 
303 aa  382  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1164  acetylglutamate kinase  67.01 
 
 
300 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113745  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  65.2 
 
 
294 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  63.95 
 
 
292 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2686  N-acetylglutamate kinase  62.85 
 
 
293 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0160  acetylglutamate kinase  59.6 
 
 
355 aa  367  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3394  acetylglutamate kinase  62.15 
 
 
308 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0064  acetylglutamate kinase  60.98 
 
 
298 aa  368  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3717  acetylglutamate kinase  62.5 
 
 
308 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0033  acetylglutamate kinase  62.5 
 
 
310 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2179  acetylglutamate kinase  59.6 
 
 
351 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2910  acetylglutamate kinase  59.6 
 
 
351 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.290051  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3249  acetylglutamate kinase  59.6 
 
 
299 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219346  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3438  acetylglutamate kinase  59.6 
 
 
299 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0180  acetylglutamate kinase  62.02 
 
 
309 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0380  acetylglutamate kinase  59.6 
 
 
351 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.734124  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2413  acetylglutamate kinase  61.62 
 
 
296 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6447  acetylglutamate kinase  59.6 
 
 
299 aa  364  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.635335  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3112  acetylglutamate kinase  59.6 
 
 
299 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.421465 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0140  acetylglutamate kinase  62.37 
 
 
344 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2482  acetylglutamate kinase  59.6 
 
 
321 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0195  acetylglutamate kinase  59.6 
 
 
299 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3096  acetylglutamate kinase  59.6 
 
 
321 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0983385  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3092  acetylglutamate kinase  59.93 
 
 
321 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.144382 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0185  acetylglutamate kinase  59.6 
 
 
351 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.651482  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3143  acetylglutamate kinase  62.02 
 
 
344 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.537624  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3005  acetylglutamate kinase  62.02 
 
 
299 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.68107 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0064  acetylglutamate kinase  62.02 
 
 
299 aa  361  8e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207968  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0338  acetylglutamate kinase  61.67 
 
 
299 aa  359  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4385  acetylglutamate kinase  61.67 
 
 
299 aa  359  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614022  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1730  acetylglutamate kinase  62.37 
 
 
300 aa  355  5e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2013  acetylglutamate kinase  61.32 
 
 
300 aa  355  5e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0433  acetylglutamate kinase  61.75 
 
 
290 aa  351  8e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.394347  hitchhiker  0.0000000109203 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0256  acetylglutamate kinase  61.75 
 
 
290 aa  351  8e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0588  acetylglutamate kinase  60.34 
 
 
296 aa  350  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1321  acetylglutamate kinase  61.03 
 
 
296 aa  350  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.463012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0568  acetylglutamate kinase  60.34 
 
 
301 aa  349  3e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0499  acetylglutamate kinase  58 
 
 
304 aa  346  3e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.600707 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3982  acetylglutamate kinase  59.6 
 
 
305 aa  346  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0773  acetylglutamate kinase  59.45 
 
 
297 aa  342  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3479  acetylglutamate kinase  58.92 
 
 
306 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  0.537456 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3524  acetylglutamate kinase  59.58 
 
 
296 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1226  acetylglutamate kinase  59.58 
 
 
296 aa  340  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0539  acetylglutamate kinase  57.58 
 
 
303 aa  338  4e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0150  acetylglutamate kinase  58.45 
 
 
292 aa  338  7e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4139  acetylglutamate kinase  56.9 
 
 
296 aa  335  3.9999999999999995e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9539  hitchhiker  0.00000200653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0225  acetylglutamate kinase  57.75 
 
 
292 aa  334  9e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21956  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2015  acetylglutamate kinase  59.65 
 
 
295 aa  333  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000238351  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3682  N-acetylglutamate kinase  56.18 
 
 
294 aa  331  1e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3635  acetylglutamate kinase  56.29 
 
 
292 aa  329  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3740  acetylglutamate kinase  56.29 
 
 
292 aa  330  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2494  acetylglutamate kinase  55.28 
 
 
291 aa  328  7e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0203  acetylglutamate kinase  57.75 
 
 
292 aa  326  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512987 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1101  acetylglutamate kinase  57.34 
 
 
293 aa  324  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.419485  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3174  acetylglutamate kinase  55.99 
 
 
292 aa  324  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.696563  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3152  acetylglutamate kinase  56.64 
 
 
292 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2288  acetylglutamate kinase  54.36 
 
 
296 aa  313  2.9999999999999996e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3297  acetylglutamate kinase  51.89 
 
 
303 aa  311  5.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0550  acetylglutamate kinase  54.55 
 
 
292 aa  311  6.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0415  acetylglutamate kinase  52.92 
 
 
299 aa  311  9e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0188997  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0306  acetylglutamate kinase  58.28 
 
 
320 aa  310  1e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.531826 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0464  acetylglutamate kinase  50.85 
 
 
295 aa  306  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0297  acetylglutamate kinase  54.58 
 
 
304 aa  306  4.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0128  acetylglutamate kinase  50.88 
 
 
281 aa  304  1.0000000000000001e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0568  acetylglutamate kinase  52.25 
 
 
295 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00120396  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0273  acetylglutamate kinase  52.25 
 
 
287 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  50.85 
 
 
295 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1613  acetylglutamate kinase  56.64 
 
 
308 aa  300  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.778617  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0075  acetylglutamate kinase  50.17 
 
 
295 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0341  acetylglutamate kinase  51.2 
 
 
305 aa  299  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0659  acetylglutamate kinase  50.17 
 
 
299 aa  299  4e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  50.17 
 
 
295 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0352  acetylglutamate kinase  50.69 
 
 
313 aa  298  8e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281091  normal  0.0894286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0028  acetylglutamate kinase  49.16 
 
 
297 aa  297  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>