More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2289 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2289  acetylglutamate kinase  100 
 
 
287 aa  571  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.99529  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2288  acetylglutamate kinase  62.93 
 
 
296 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0659  acetylglutamate kinase  60.71 
 
 
299 aa  355  2.9999999999999997e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0341  acetylglutamate kinase  60.68 
 
 
305 aa  355  5.999999999999999e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0273  acetylglutamate kinase  59.72 
 
 
287 aa  354  1e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1831  acetylglutamate kinase  60.35 
 
 
284 aa  353  1e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.242164  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0568  acetylglutamate kinase  57.97 
 
 
295 aa  338  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00120396  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1697  acetylglutamate kinase  56.03 
 
 
299 aa  331  7.000000000000001e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1496  acetylglutamate kinase  56.23 
 
 
301 aa  325  6e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1864  acetylglutamate kinase  56.06 
 
 
304 aa  323  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0771  acetylglutamate kinase  54.51 
 
 
298 aa  322  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02840  acetylglutamate kinase  53.33 
 
 
290 aa  322  3e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00137776  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0256  acetylglutamate kinase  55.52 
 
 
290 aa  322  5e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0028  acetylglutamate kinase  55.52 
 
 
297 aa  322  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0433  acetylglutamate kinase  55.52 
 
 
290 aa  322  5e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.394347  hitchhiker  0.0000000109203 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1674  acetylglutamate kinase  53.41 
 
 
301 aa  317  1e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.437171  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1153  acetylglutamate kinase  53.9 
 
 
292 aa  317  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0296435  hitchhiker  0.00582367 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1152  acetylglutamate kinase  53.87 
 
 
289 aa  315  6e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.749063  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1162  acetylglutamate kinase  54.12 
 
 
309 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.174929  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1131  acetylglutamate kinase  54.12 
 
 
309 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1854  acetylglutamate kinase  53.96 
 
 
296 aa  312  3.9999999999999997e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1071  acetylglutamate kinase  55.91 
 
 
282 aa  311  4.999999999999999e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0437011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1041  acetylglutamate kinase  55.91 
 
 
282 aa  311  9e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0274311  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0554  acetylglutamate kinase  53.96 
 
 
297 aa  310  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879034  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2911  acetylglutamate kinase  54.51 
 
 
303 aa  310  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0684  acetylglutamate kinase  54.12 
 
 
293 aa  308  5e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3675  acetylglutamate kinase  52.04 
 
 
300 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0797606  normal  0.0933841 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07341  acetylglutamate kinase  53.96 
 
 
308 aa  306  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04991  acetylglutamate kinase  52.16 
 
 
300 aa  305  6e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05631  acetylglutamate kinase  53.07 
 
 
283 aa  302  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.231229  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0064  acetylglutamate kinase  54.45 
 
 
298 aa  301  8.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02900  acetylglutamate kinase  51.53 
 
 
300 aa  300  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2995  acetylglutamate kinase  50.34 
 
 
301 aa  300  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1078  acetylglutamate kinase  55.94 
 
 
293 aa  300  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2781  acetylglutamate kinase  52.08 
 
 
300 aa  298  5e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05561  acetylglutamate kinase  51.97 
 
 
283 aa  298  7e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.91798  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5543  acetylglutamate kinase  51.86 
 
 
301 aa  298  8e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3560  acetylglutamate kinase  52.76 
 
 
290 aa  298  9e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0182  acetylglutamate kinase  51.53 
 
 
301 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0306646  hitchhiker  0.000000157401 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1950  acetylglutamate kinase  51.6 
 
 
300 aa  297  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0084  acetylglutamate kinase  51.92 
 
 
304 aa  297  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0225  acetylglutamate kinase  51.72 
 
 
292 aa  296  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21956  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1899  acetylglutamate kinase  50.34 
 
 
304 aa  297  2e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0500  acetylglutamate kinase  51.25 
 
 
283 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52011  predicted protein  53.05 
 
 
334 aa  297  2e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.367344  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05261  acetylglutamate kinase  52.33 
 
 
283 aa  296  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.108747  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0539  acetylglutamate kinase  49.12 
 
 
288 aa  295  4e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000417739  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  51.03 
 
 
292 aa  295  5e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4380  acetylglutamate kinase  50.85 
 
 
301 aa  295  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5289  acetylglutamate kinase  50.85 
 
 
301 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.92163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5198  acetylglutamate kinase  50.85 
 
 
301 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.934726  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5339  acetylglutamate kinase  50.85 
 
 
301 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.866501  hitchhiker  0.00605357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6099  acetylglutamate kinase  51.02 
 
 
301 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0150  acetylglutamate kinase  51.92 
 
 
292 aa  292  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0203  acetylglutamate kinase  52.96 
 
 
292 aa  291  9e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512987 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0082  acetylglutamate kinase  50.85 
 
 
301 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0218  acetylglutamate kinase  50.85 
 
 
301 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1906  acetylglutamate kinase  51.39 
 
 
291 aa  290  1e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0488998  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2413  acetylglutamate kinase  50.69 
 
 
296 aa  290  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70280  acetylglutamate kinase  50.68 
 
 
301 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3740  acetylglutamate kinase  49.83 
 
 
292 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1732  acetylglutamate kinase  51.92 
 
 
289 aa  289  3e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3635  acetylglutamate kinase  49.48 
 
 
292 aa  288  7e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1164  acetylglutamate kinase  50.86 
 
 
300 aa  288  8e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113745  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05571  acetylglutamate kinase  51.08 
 
 
304 aa  288  9e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0678457  normal  0.267137 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1832  acetylglutamate kinase  51.08 
 
 
304 aa  287  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.913533  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0588  acetylglutamate kinase  48.97 
 
 
296 aa  287  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0104  acetylglutamate kinase  50.68 
 
 
295 aa  287  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1321  acetylglutamate kinase  48.62 
 
 
296 aa  286  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.463012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0568  acetylglutamate kinase  48.97 
 
 
301 aa  287  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3479  acetylglutamate kinase  48.95 
 
 
306 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  0.537456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3982  acetylglutamate kinase  48.62 
 
 
305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2494  acetylglutamate kinase  49.83 
 
 
291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2296  acetylglutamate kinase  50.87 
 
 
300 aa  285  4e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.576653  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1078  acetylglutamate kinase  47.59 
 
 
294 aa  285  4e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0887  acetylglutamate kinase  48.1 
 
 
294 aa  285  5e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.380786  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1060  acetylglutamate kinase  48.79 
 
 
294 aa  285  5e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3682  N-acetylglutamate kinase  48.12 
 
 
294 aa  285  5e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0621  acetylglutamate kinase  50.34 
 
 
302 aa  285  7e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000196007 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  48.97 
 
 
294 aa  285  8e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  48.46 
 
 
303 aa  285  8e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0499  acetylglutamate kinase  47.93 
 
 
304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.600707 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0127  acetylglutamate kinase  47.75 
 
 
294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.303702  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1116  acetylglutamate kinase  50.17 
 
 
293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4139  acetylglutamate kinase  47.93 
 
 
296 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9539  hitchhiker  0.00000200653 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1081  acetylglutamate kinase  48.76 
 
 
280 aa  284  1.0000000000000001e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0152417  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1614  acetylglutamate kinase  47.4 
 
 
294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2984  N-acetylglutamate kinase  51.74 
 
 
306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.492788  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3524  acetylglutamate kinase  47.59 
 
 
296 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3174  acetylglutamate kinase  50.69 
 
 
292 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.696563  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0539  acetylglutamate kinase  48.28 
 
 
303 aa  282  4.0000000000000003e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0629  acetylglutamate kinase  50.34 
 
 
295 aa  282  6.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.615358  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0773  acetylglutamate kinase  48.6 
 
 
297 aa  281  7.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0064  acetylglutamate kinase  49.47 
 
 
299 aa  281  9e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207968  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2179  acetylglutamate kinase  48.28 
 
 
351 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0380  acetylglutamate kinase  48.28 
 
 
351 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.734124  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3297  acetylglutamate kinase  48.81 
 
 
303 aa  281  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4385  acetylglutamate kinase  49.47 
 
 
299 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614022  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0338  acetylglutamate kinase  49.47 
 
 
299 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2910  acetylglutamate kinase  48.28 
 
 
351 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.290051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>