More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_2013 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_2013  acetylglutamate kinase  100 
 
 
300 aa  600  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1730  acetylglutamate kinase  94.67 
 
 
300 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0033  acetylglutamate kinase  86.78 
 
 
310 aa  517  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3394  acetylglutamate kinase  86.44 
 
 
308 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3717  acetylglutamate kinase  86.78 
 
 
308 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0338  acetylglutamate kinase  84.8 
 
 
299 aa  510  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4385  acetylglutamate kinase  84.8 
 
 
299 aa  510  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614022  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0140  acetylglutamate kinase  86.35 
 
 
344 aa  511  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0380  acetylglutamate kinase  85.27 
 
 
351 aa  507  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.734124  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2179  acetylglutamate kinase  85.27 
 
 
351 aa  507  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0064  acetylglutamate kinase  85.08 
 
 
299 aa  510  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207968  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2482  acetylglutamate kinase  84.98 
 
 
321 aa  507  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753356  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2910  acetylglutamate kinase  85.27 
 
 
351 aa  507  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.290051  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3096  acetylglutamate kinase  84.98 
 
 
321 aa  507  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0983385  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0185  acetylglutamate kinase  85.27 
 
 
351 aa  507  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.651482  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3249  acetylglutamate kinase  84.98 
 
 
299 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219346  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6447  acetylglutamate kinase  84.98 
 
 
299 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.635335  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0160  acetylglutamate kinase  84.93 
 
 
355 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3005  acetylglutamate kinase  84.64 
 
 
299 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.68107 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3112  acetylglutamate kinase  84.98 
 
 
299 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.421465 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3092  acetylglutamate kinase  84.98 
 
 
321 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.144382 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3143  acetylglutamate kinase  84.93 
 
 
344 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.537624  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0195  acetylglutamate kinase  84.98 
 
 
299 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3438  acetylglutamate kinase  84.98 
 
 
299 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0180  acetylglutamate kinase  87.41 
 
 
309 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0539  acetylglutamate kinase  74.83 
 
 
303 aa  447  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0568  acetylglutamate kinase  72.88 
 
 
301 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3982  acetylglutamate kinase  72 
 
 
305 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0588  acetylglutamate kinase  73.79 
 
 
296 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0499  acetylglutamate kinase  72.01 
 
 
304 aa  437  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.600707 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3479  acetylglutamate kinase  72.54 
 
 
306 aa  436  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  0.537456 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0773  acetylglutamate kinase  72.16 
 
 
297 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1321  acetylglutamate kinase  72.26 
 
 
296 aa  431  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.463012 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3524  acetylglutamate kinase  71.19 
 
 
296 aa  430  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4139  acetylglutamate kinase  71.23 
 
 
296 aa  425  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9539  hitchhiker  0.00000200653 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1226  acetylglutamate kinase  70.93 
 
 
296 aa  420  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1164  acetylglutamate kinase  66.89 
 
 
300 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113745  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0629  acetylglutamate kinase  64.97 
 
 
295 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.615358  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  66.32 
 
 
294 aa  388  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1116  acetylglutamate kinase  65.73 
 
 
293 aa  380  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2686  N-acetylglutamate kinase  64.66 
 
 
293 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0084  acetylglutamate kinase  61.77 
 
 
304 aa  363  3e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0104  acetylglutamate kinase  62.24 
 
 
295 aa  362  3e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2781  acetylglutamate kinase  61.67 
 
 
300 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1899  acetylglutamate kinase  61.32 
 
 
304 aa  355  5e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0179  acetylglutamate kinase  58.45 
 
 
295 aa  352  4e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.137233  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2995  acetylglutamate kinase  58.82 
 
 
301 aa  352  5e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3675  acetylglutamate kinase  58.89 
 
 
300 aa  347  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0797606  normal  0.0933841 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  59.07 
 
 
292 aa  345  5e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2296  acetylglutamate kinase  59.12 
 
 
300 aa  345  8e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.576653  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02900  acetylglutamate kinase  57.72 
 
 
300 aa  343  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5289  acetylglutamate kinase  59.38 
 
 
301 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.92163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5198  acetylglutamate kinase  59.38 
 
 
301 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.934726  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5339  acetylglutamate kinase  59.38 
 
 
301 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.866501  hitchhiker  0.00605357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0182  acetylglutamate kinase  59.38 
 
 
301 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0306646  hitchhiker  0.000000157401 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0082  acetylglutamate kinase  58.68 
 
 
301 aa  332  4e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0218  acetylglutamate kinase  58.68 
 
 
301 aa  332  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4380  acetylglutamate kinase  57.99 
 
 
301 aa  332  4e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70280  acetylglutamate kinase  58.33 
 
 
301 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6099  acetylglutamate kinase  58.33 
 
 
301 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780503  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5543  acetylglutamate kinase  58.33 
 
 
301 aa  328  8e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  56.89 
 
 
303 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0433  acetylglutamate kinase  56.49 
 
 
290 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.394347  hitchhiker  0.0000000109203 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0256  acetylglutamate kinase  56.49 
 
 
290 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0621  acetylglutamate kinase  54.98 
 
 
302 aa  324  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000196007 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0579  acetylglutamate kinase  56.14 
 
 
303 aa  321  7e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.503767  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2413  acetylglutamate kinase  54.39 
 
 
296 aa  321  8e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3560  acetylglutamate kinase  56.34 
 
 
290 aa  321  9.000000000000001e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2984  N-acetylglutamate kinase  57.09 
 
 
306 aa  321  9.999999999999999e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.492788  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0568  acetylglutamate kinase  56.14 
 
 
299 aa  321  9.999999999999999e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3740  acetylglutamate kinase  53.85 
 
 
292 aa  318  5e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0064  acetylglutamate kinase  54.67 
 
 
298 aa  318  7.999999999999999e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3635  acetylglutamate kinase  53.5 
 
 
292 aa  317  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0225  acetylglutamate kinase  54.58 
 
 
292 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21956  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0150  acetylglutamate kinase  52.11 
 
 
292 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3174  acetylglutamate kinase  50.88 
 
 
292 aa  299  3e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.696563  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2494  acetylglutamate kinase  52.13 
 
 
291 aa  298  5e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3682  N-acetylglutamate kinase  51.05 
 
 
294 aa  298  8e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0415  acetylglutamate kinase  52.23 
 
 
299 aa  296  2e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0188997  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0203  acetylglutamate kinase  51.58 
 
 
292 aa  295  7e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512987 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1906  acetylglutamate kinase  50.52 
 
 
291 aa  295  9e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0488998  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3152  acetylglutamate kinase  52.11 
 
 
292 aa  294  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2288  acetylglutamate kinase  49.66 
 
 
296 aa  292  4e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0341  acetylglutamate kinase  49.15 
 
 
305 aa  291  7e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0568  acetylglutamate kinase  48.31 
 
 
295 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00120396  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02840  acetylglutamate kinase  50.53 
 
 
290 aa  289  5.0000000000000004e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00137776  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0352  acetylglutamate kinase  48.07 
 
 
313 aa  285  5.999999999999999e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281091  normal  0.0894286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2143  acetylglutamate kinase  51.22 
 
 
336 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3297  acetylglutamate kinase  48.32 
 
 
303 aa  285  9e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2015  acetylglutamate kinase  50.53 
 
 
295 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000238351  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1101  acetylglutamate kinase  50.35 
 
 
293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.419485  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0771  acetylglutamate kinase  49.31 
 
 
298 aa  281  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0633  acetylglutamate kinase  48.25 
 
 
285 aa  280  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0273  acetylglutamate kinase  48.29 
 
 
287 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1864  acetylglutamate kinase  50.35 
 
 
304 aa  278  9e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0127  acetylglutamate kinase  48.43 
 
 
294 aa  278  1e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.303702  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2289  acetylglutamate kinase  47.24 
 
 
287 aa  276  4e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.99529  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0297  acetylglutamate kinase  48.81 
 
 
304 aa  275  8e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3095  acetylglutamate kinase  50.35 
 
 
302 aa  275  9e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1078  acetylglutamate kinase  49.13 
 
 
294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>