More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3708 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3708  acetylglutamate kinase  100 
 
 
260 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0237  acetylglutamate kinase  98.85 
 
 
260 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3904  acetylglutamate kinase  98.85 
 
 
260 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.285866 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0276  acetylglutamate kinase  98.08 
 
 
260 aa  501  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3716  acetylglutamate kinase  96.15 
 
 
260 aa  493  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4094  acetylglutamate kinase  96.15 
 
 
260 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4212  acetylglutamate kinase  96.15 
 
 
260 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4013  acetylglutamate kinase  96.15 
 
 
260 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.673186 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4123  acetylglutamate kinase  96.15 
 
 
260 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0251  acetylglutamate kinase  81.15 
 
 
260 aa  413  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4275  acetylglutamate kinase  79.62 
 
 
263 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000930353  normal  0.309255 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0192  acetylglutamate kinase  81.71 
 
 
259 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0257  acetylglutamate kinase  80.77 
 
 
262 aa  396  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0330  acetylglutamate kinase  74.62 
 
 
261 aa  391  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0203  acetylglutamate kinase  75 
 
 
261 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.515278  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0228  acetylglutamate kinase  74.41 
 
 
267 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.636422  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002313  acetylglutamate kinase  52.12 
 
 
263 aa  243  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824681  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00042  acetylglutamate kinase  50.97 
 
 
263 aa  239  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2219  acetylglutamate kinase  51.56 
 
 
262 aa  236  4e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.448521  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2757  acetylglutamate kinase  49.04 
 
 
263 aa  222  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4250  acetylglutamate kinase  47.62 
 
 
257 aa  218  7e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.531386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4059  acetylglutamate kinase  47.22 
 
 
257 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0229  acetylglutamate kinase  46.03 
 
 
260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0059376  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3918  acetylglutamate kinase  47.66 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4088  acetylglutamate kinase  48.81 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0128  acetylglutamate kinase  48.81 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3897  acetylglutamate kinase  48.81 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0196  acetylglutamate kinase  45.88 
 
 
257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4450  acetylglutamate kinase  48.22 
 
 
257 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000178281 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4453  acetylglutamate kinase  48.22 
 
 
257 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116052 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4527  acetylglutamate kinase  48.22 
 
 
257 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4332  acetylglutamate kinase  48.22 
 
 
257 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4780  acetylglutamate kinase  48.81 
 
 
257 aa  210  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4363  acetylglutamate kinase  47.83 
 
 
257 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4406  acetylglutamate kinase  47.22 
 
 
257 aa  205  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0773031 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03844  acetylglutamate kinase  47.22 
 
 
257 aa  205  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4027  acetylglutamate kinase  47.22 
 
 
258 aa  205  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03793  hypothetical protein  47.22 
 
 
257 aa  205  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4027  acetylglutamate kinase  47.22 
 
 
257 aa  205  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4193  acetylglutamate kinase  47.22 
 
 
257 aa  205  6e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4057  acetylglutamate kinase  47.22 
 
 
257 aa  205  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.650697 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4498  acetylglutamate kinase  47.22 
 
 
257 aa  205  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.890825  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4445  acetylglutamate kinase  47.22 
 
 
257 aa  205  6e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5419  acetylglutamate kinase  47.22 
 
 
257 aa  205  6e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0461  acetylglutamate kinase  44.23 
 
 
260 aa  202  6e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0981  acetylglutamate kinase  47.04 
 
 
257 aa  196  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.71344  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00531  acetylglutamate kinase  47.27 
 
 
267 aa  194  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0190  acetylglutamate kinase  39.29 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0128  acetylglutamate kinase  32.05 
 
 
281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  34.19 
 
 
294 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1496  acetylglutamate kinase  33.47 
 
 
301 aa  112  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4240  acetylglutamate kinase  33.33 
 
 
255 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4154  acetylglutamate kinase  34.11 
 
 
255 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1081  acetylglutamate kinase  30.62 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0152417  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52011  predicted protein  35.75 
 
 
334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.367344  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3059  acetylglutamate kinase  33.9 
 
 
333 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2494  acetylglutamate kinase  30.48 
 
 
291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4038  acetylglutamate kinase  33.72 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0554  acetylglutamate kinase  33.89 
 
 
297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879034  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4353  acetylglutamate kinase  33.72 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.783439  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0854  acetylglutamate kinase  31.4 
 
 
283 aa  108  7.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.277534  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  30.8 
 
 
292 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04991  acetylglutamate kinase  33.94 
 
 
300 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05571  acetylglutamate kinase  30.77 
 
 
304 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0678457  normal  0.267137 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4264  acetylglutamate kinase  33.73 
 
 
255 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3963  acetylglutamate kinase  32.94 
 
 
255 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00282124  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3479  acetylglutamate kinase  29.85 
 
 
306 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  0.537456 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3885  acetylglutamate kinase  32.42 
 
 
255 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1832  acetylglutamate kinase  30.38 
 
 
304 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.913533  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  34.56 
 
 
295 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0539  acetylglutamate kinase  29.85 
 
 
303 aa  105  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1162  acetylglutamate kinase  32.22 
 
 
309 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.174929  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1131  acetylglutamate kinase  32.22 
 
 
309 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0629  acetylglutamate kinase  31.91 
 
 
295 aa  105  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.615358  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4201  acetylglutamate kinase  32.94 
 
 
255 aa  105  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1351  acetylglutamate kinase  30.15 
 
 
283 aa  105  8e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1854  acetylglutamate kinase  33.05 
 
 
296 aa  105  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0180  acetylglutamate kinase  29.89 
 
 
309 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  33.82 
 
 
295 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2153  acetylglutamate kinase  30.86 
 
 
298 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0140  acetylglutamate kinase  30.64 
 
 
344 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3877  acetylglutamate kinase  34.39 
 
 
236 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2288  acetylglutamate kinase  31.11 
 
 
296 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4160  acetylglutamate kinase  31.37 
 
 
261 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.03818  normal  0.261646 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0539  acetylglutamate kinase  30.5 
 
 
288 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000417739  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3717  acetylglutamate kinase  27.99 
 
 
308 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3394  acetylglutamate kinase  27.99 
 
 
308 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1203  acetylglutamate kinase  35.9 
 
 
294 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815716 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0179  acetylglutamate kinase  30.66 
 
 
295 aa  102  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.137233  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0033  acetylglutamate kinase  28.78 
 
 
310 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0028  acetylglutamate kinase  31.15 
 
 
297 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0104  acetylglutamate kinase  31.51 
 
 
295 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0996  acetylglutamate kinase  31.75 
 
 
255 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22020  N-acetylglutamate kinase  34.82 
 
 
330 aa  102  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.869961  decreased coverage  0.00246187 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2778  acetylglutamate kinase  34.55 
 
 
254 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.616506  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2865  acetylglutamate kinase  31.52 
 
 
292 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4139  acetylglutamate kinase  27.99 
 
 
296 aa  102  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9539  hitchhiker  0.00000200653 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2729  acetylglutamate kinase  31.13 
 
 
293 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1068  acetylglutamate kinase  31.13 
 
 
293 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1226  acetylglutamate kinase  29.48 
 
 
296 aa  102  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>