More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0257 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0257  acetylglutamate kinase  100 
 
 
262 aa  508  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3708  acetylglutamate kinase  80.77 
 
 
260 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0237  acetylglutamate kinase  80.77 
 
 
260 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3904  acetylglutamate kinase  80.38 
 
 
260 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.285866 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0276  acetylglutamate kinase  80 
 
 
260 aa  413  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4013  acetylglutamate kinase  79.62 
 
 
260 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.673186 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4123  acetylglutamate kinase  79.62 
 
 
260 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4094  acetylglutamate kinase  79.62 
 
 
260 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4212  acetylglutamate kinase  79.62 
 
 
260 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3716  acetylglutamate kinase  78.85 
 
 
260 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0203  acetylglutamate kinase  71.65 
 
 
261 aa  381  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.515278  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0330  acetylglutamate kinase  72.8 
 
 
261 aa  378  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0251  acetylglutamate kinase  74.23 
 
 
260 aa  378  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0192  acetylglutamate kinase  76.26 
 
 
259 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4275  acetylglutamate kinase  72.69 
 
 
263 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000930353  normal  0.309255 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0228  acetylglutamate kinase  70.47 
 
 
267 aa  359  3e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.636422  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00042  acetylglutamate kinase  50.95 
 
 
263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002313  acetylglutamate kinase  50.95 
 
 
263 aa  239  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824681  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2219  acetylglutamate kinase  50 
 
 
262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.448521  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2757  acetylglutamate kinase  50.39 
 
 
263 aa  226  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0128  acetylglutamate kinase  50 
 
 
258 aa  221  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4088  acetylglutamate kinase  50 
 
 
258 aa  221  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3897  acetylglutamate kinase  50 
 
 
258 aa  221  6e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4250  acetylglutamate kinase  47.24 
 
 
257 aa  219  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.531386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4059  acetylglutamate kinase  46.85 
 
 
257 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4780  acetylglutamate kinase  49.21 
 
 
257 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865282 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3918  acetylglutamate kinase  46.46 
 
 
257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0196  acetylglutamate kinase  45.24 
 
 
257 aa  216  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0229  acetylglutamate kinase  45.67 
 
 
260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0059376  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4363  acetylglutamate kinase  48.02 
 
 
257 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4453  acetylglutamate kinase  47.62 
 
 
257 aa  211  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116052 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4527  acetylglutamate kinase  47.62 
 
 
257 aa  211  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4450  acetylglutamate kinase  47.62 
 
 
257 aa  211  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000178281 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4332  acetylglutamate kinase  47.62 
 
 
257 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4027  acetylglutamate kinase  47.22 
 
 
257 aa  208  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0768978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03844  acetylglutamate kinase  46.43 
 
 
257 aa  205  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4027  acetylglutamate kinase  46.43 
 
 
258 aa  205  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4445  acetylglutamate kinase  46.43 
 
 
257 aa  205  6e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4498  acetylglutamate kinase  46.43 
 
 
257 aa  205  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.890825  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4057  acetylglutamate kinase  46.43 
 
 
257 aa  205  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.650697 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03793  hypothetical protein  46.43 
 
 
257 aa  205  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5419  acetylglutamate kinase  46.43 
 
 
257 aa  205  6e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4193  acetylglutamate kinase  46.43 
 
 
257 aa  205  6e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0461  acetylglutamate kinase  46.09 
 
 
260 aa  203  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4406  acetylglutamate kinase  46.03 
 
 
257 aa  203  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0773031 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0981  acetylglutamate kinase  47.24 
 
 
257 aa  198  7e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.71344  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00531  acetylglutamate kinase  48.08 
 
 
267 aa  195  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0190  acetylglutamate kinase  38.67 
 
 
260 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3059  acetylglutamate kinase  36.75 
 
 
333 aa  119  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3963  acetylglutamate kinase  36.11 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00282124  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1081  acetylglutamate kinase  36.16 
 
 
280 aa  119  6e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0152417  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4240  acetylglutamate kinase  34.9 
 
 
255 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0633  acetylglutamate kinase  33.04 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0104  acetylglutamate kinase  32.36 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0128  acetylglutamate kinase  33.33 
 
 
281 aa  116  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52011  predicted protein  37.67 
 
 
334 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.367344  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4154  acetylglutamate kinase  35.27 
 
 
255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04991  acetylglutamate kinase  35 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4264  acetylglutamate kinase  35.32 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4038  acetylglutamate kinase  37.05 
 
 
255 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0554  acetylglutamate kinase  35.27 
 
 
297 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879034  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2494  acetylglutamate kinase  30.48 
 
 
291 aa  113  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4353  acetylglutamate kinase  37.05 
 
 
255 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.783439  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  31.32 
 
 
292 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4160  acetylglutamate kinase  34.86 
 
 
261 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.03818  normal  0.261646 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1162  acetylglutamate kinase  34.02 
 
 
309 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.174929  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1203  acetylglutamate kinase  38.03 
 
 
294 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815716 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1131  acetylglutamate kinase  34.02 
 
 
309 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3885  acetylglutamate kinase  34.92 
 
 
255 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0996  acetylglutamate kinase  35.32 
 
 
255 aa  112  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1041  acetylglutamate kinase  33.63 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0274311  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0352  acetylglutamate kinase  36.59 
 
 
313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281091  normal  0.0894286 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1496  acetylglutamate kinase  33.73 
 
 
301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3479  acetylglutamate kinase  31.72 
 
 
306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  0.537456 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4139  acetylglutamate kinase  31.72 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9539  hitchhiker  0.00000200653 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4201  acetylglutamate kinase  35.32 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0854  acetylglutamate kinase  31.54 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.277534  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0179  acetylglutamate kinase  31.87 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.137233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0350  acetylglutamate kinase  35.08 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000201879 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1071  acetylglutamate kinase  33.19 
 
 
282 aa  109  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0437011  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1854  acetylglutamate kinase  35.39 
 
 
296 aa  109  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1226  acetylglutamate kinase  32.46 
 
 
296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2153  acetylglutamate kinase  35.04 
 
 
298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  33.95 
 
 
294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  29.45 
 
 
303 aa  109  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0075  acetylglutamate kinase  36.44 
 
 
295 aa  109  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0771  acetylglutamate kinase  36.6 
 
 
298 aa  108  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22020  N-acetylglutamate kinase  34.93 
 
 
330 aa  108  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.869961  decreased coverage  0.00246187 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  34.56 
 
 
295 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1831  acetylglutamate kinase  32.71 
 
 
284 aa  108  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.242164  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0499  acetylglutamate kinase  32.33 
 
 
304 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.600707 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0273  acetylglutamate kinase  34.19 
 
 
287 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2143  acetylglutamate kinase  35.24 
 
 
336 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3877  acetylglutamate kinase  35.04 
 
 
236 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0539  acetylglutamate kinase  31.17 
 
 
288 aa  107  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000417739  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1832  acetylglutamate kinase  34.57 
 
 
304 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.913533  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  33.82 
 
 
295 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0588  acetylglutamate kinase  32.46 
 
 
296 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05571  acetylglutamate kinase  34.57 
 
 
304 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0678457  normal  0.267137 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0568  acetylglutamate kinase  32.71 
 
 
301 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>