More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002313 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002313  acetylglutamate kinase  100 
 
 
263 aa  518  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824681  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00042  acetylglutamate kinase  96.58 
 
 
263 aa  499  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2219  acetylglutamate kinase  83.59 
 
 
262 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.448521  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2757  acetylglutamate kinase  66.67 
 
 
263 aa  342  5e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3918  acetylglutamate kinase  58.66 
 
 
257 aa  285  5.999999999999999e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4780  acetylglutamate kinase  60.24 
 
 
257 aa  282  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865282 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0196  acetylglutamate kinase  57.48 
 
 
257 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4250  acetylglutamate kinase  57.48 
 
 
257 aa  278  8e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.531386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4059  acetylglutamate kinase  57.09 
 
 
257 aa  276  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3897  acetylglutamate kinase  58.1 
 
 
258 aa  275  7e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4088  acetylglutamate kinase  58.1 
 
 
258 aa  275  7e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0128  acetylglutamate kinase  58.1 
 
 
258 aa  275  7e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0229  acetylglutamate kinase  52.9 
 
 
260 aa  260  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0059376  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4027  acetylglutamate kinase  55.91 
 
 
258 aa  258  6e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03844  acetylglutamate kinase  55.91 
 
 
257 aa  258  7e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03793  hypothetical protein  55.91 
 
 
257 aa  258  7e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4498  acetylglutamate kinase  55.91 
 
 
257 aa  258  7e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.890825  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4445  acetylglutamate kinase  55.91 
 
 
257 aa  258  7e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4057  acetylglutamate kinase  55.91 
 
 
257 aa  258  7e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.650697 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4193  acetylglutamate kinase  55.91 
 
 
257 aa  258  7e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5419  acetylglutamate kinase  55.91 
 
 
257 aa  258  7e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4027  acetylglutamate kinase  55.91 
 
 
257 aa  257  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4406  acetylglutamate kinase  55.91 
 
 
257 aa  257  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0773031 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4332  acetylglutamate kinase  55.51 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4363  acetylglutamate kinase  55.51 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4527  acetylglutamate kinase  55.51 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4450  acetylglutamate kinase  55.51 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000178281 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4453  acetylglutamate kinase  55.51 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116052 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0203  acetylglutamate kinase  52.12 
 
 
261 aa  246  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.515278  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0251  acetylglutamate kinase  51.94 
 
 
260 aa  247  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4275  acetylglutamate kinase  50 
 
 
263 aa  245  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000930353  normal  0.309255 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0237  acetylglutamate kinase  52.51 
 
 
260 aa  245  6e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3708  acetylglutamate kinase  52.12 
 
 
260 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3904  acetylglutamate kinase  51.74 
 
 
260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.285866 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3716  acetylglutamate kinase  51.35 
 
 
260 aa  241  7e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4013  acetylglutamate kinase  51.35 
 
 
260 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.673186 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0276  acetylglutamate kinase  51.74 
 
 
260 aa  240  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4212  acetylglutamate kinase  51.35 
 
 
260 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4123  acetylglutamate kinase  51.35 
 
 
260 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4094  acetylglutamate kinase  51.35 
 
 
260 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0330  acetylglutamate kinase  50.57 
 
 
261 aa  238  8e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0228  acetylglutamate kinase  49.43 
 
 
267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.636422  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0192  acetylglutamate kinase  50 
 
 
259 aa  230  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0257  acetylglutamate kinase  50.95 
 
 
262 aa  229  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0981  acetylglutamate kinase  49.61 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.71344  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00531  acetylglutamate kinase  47.27 
 
 
267 aa  193  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0461  acetylglutamate kinase  46.48 
 
 
260 aa  192  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0058  acetylglutamate kinase  37.14 
 
 
244 aa  126  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0633  acetylglutamate kinase  32.95 
 
 
285 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0352  acetylglutamate kinase  35.98 
 
 
313 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281091  normal  0.0894286 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1203  acetylglutamate kinase  33.21 
 
 
294 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815716 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0539  acetylglutamate kinase  31.85 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000417739  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3330  acetylglutamate kinase  33.58 
 
 
305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1068  acetylglutamate kinase  33.59 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2729  acetylglutamate kinase  33.59 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0464  acetylglutamate kinase  32.85 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2865  acetylglutamate kinase  33.98 
 
 
292 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1326  acetylglutamate kinase  36.36 
 
 
301 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0190  acetylglutamate kinase  37.75 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  32.85 
 
 
295 aa  118  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0075  acetylglutamate kinase  35.54 
 
 
295 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  32.49 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2143  acetylglutamate kinase  35.58 
 
 
336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1071  acetylglutamate kinase  33.2 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0437011  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0327  acetylglutamate kinase  31.92 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4240  acetylglutamate kinase  35.57 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1041  acetylglutamate kinase  35.56 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0274311  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0550  acetylglutamate kinase  37.34 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1674  acetylglutamate kinase  34.34 
 
 
301 aa  113  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.437171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4380  acetylglutamate kinase  32.08 
 
 
301 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2296  acetylglutamate kinase  33.08 
 
 
300 aa  113  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.576653  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0500  acetylglutamate kinase  31.66 
 
 
283 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0380  acetylglutamate kinase  31.77 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0880  acetylglutamate kinase  32.44 
 
 
304 aa  112  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00277635  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4154  acetylglutamate kinase  36.99 
 
 
255 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4038  acetylglutamate kinase  36.99 
 
 
255 aa  112  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4353  acetylglutamate kinase  36.99 
 
 
255 aa  112  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.783439  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1697  acetylglutamate kinase  33.98 
 
 
299 aa  112  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43249  predicted protein  33.33 
 
 
330 aa  112  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22020  N-acetylglutamate kinase  35.56 
 
 
330 aa  112  6e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.869961  decreased coverage  0.00246187 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3963  acetylglutamate kinase  35.62 
 
 
255 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00282124  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04991  acetylglutamate kinase  33.72 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1358  acetylglutamate kinase  31.77 
 
 
296 aa  112  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0225  acetylglutamate kinase  34.08 
 
 
292 aa  111  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21956  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1090  acetylglutamate kinase  34.53 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.171552  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1595  acetylglutamate kinase  36 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05261  acetylglutamate kinase  32.2 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.108747  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1496  acetylglutamate kinase  31.66 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02900  acetylglutamate kinase  31.7 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4201  acetylglutamate kinase  36.07 
 
 
255 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  29.55 
 
 
303 aa  110  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4264  acetylglutamate kinase  35.62 
 
 
255 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1025  acetylglutamate kinase  31.05 
 
 
296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.977897  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0554  acetylglutamate kinase  35.14 
 
 
297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879034  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0203  acetylglutamate kinase  33.83 
 
 
292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512987 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0966  acetylglutamate kinase  31.05 
 
 
296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  32.44 
 
 
292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0064  acetylglutamate kinase  31.34 
 
 
298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0128  acetylglutamate kinase  30.83 
 
 
281 aa  109  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0621  acetylglutamate kinase  31.84 
 
 
302 aa  108  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000196007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>