More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1090 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1090  acetylglutamate kinase  100 
 
 
245 aa  481  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.171552  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0502  acetylglutamate kinase  44.77 
 
 
245 aa  214  9e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0471681  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0058  acetylglutamate kinase  38.49 
 
 
244 aa  166  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1071  acetylglutamate kinase  38.03 
 
 
282 aa  141  8e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0437011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1041  acetylglutamate kinase  38.03 
 
 
282 aa  141  9e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0274311  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0738  acetylglutamate kinase  31.47 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0640766  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1081  acetylglutamate kinase  33.48 
 
 
280 aa  128  9.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0152417  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1595  acetylglutamate kinase  31.47 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0128  acetylglutamate kinase  31.58 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3330  acetylglutamate kinase  31.38 
 
 
305 aa  125  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0327  acetylglutamate kinase  35.48 
 
 
287 aa  125  8.000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0352  acetylglutamate kinase  30.37 
 
 
313 aa  125  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281091  normal  0.0894286 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1899  acetylglutamate kinase  33.33 
 
 
304 aa  123  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3885  acetylglutamate kinase  34.29 
 
 
255 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1203  acetylglutamate kinase  31.93 
 
 
294 aa  123  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815716 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1381  acetylglutamate kinase  34.06 
 
 
304 aa  123  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2219  acetylglutamate kinase  34.82 
 
 
262 aa  122  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.448521  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1326  acetylglutamate kinase  32.52 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4264  acetylglutamate kinase  34.29 
 
 
255 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0064  acetylglutamate kinase  32.11 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1131  acetylglutamate kinase  31.17 
 
 
309 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1162  acetylglutamate kinase  31.17 
 
 
309 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.174929  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1496  acetylglutamate kinase  30.74 
 
 
301 aa  119  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4201  acetylglutamate kinase  34.29 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04991  acetylglutamate kinase  33.62 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0579  acetylglutamate kinase  32.26 
 
 
303 aa  119  6e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.503767  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0380  acetylglutamate kinase  30.08 
 
 
312 aa  119  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3963  acetylglutamate kinase  35.04 
 
 
255 aa  118  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00282124  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0568  acetylglutamate kinase  32.66 
 
 
299 aa  118  7e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0028  acetylglutamate kinase  31.22 
 
 
297 aa  118  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1074  acetylglutamate kinase  33.19 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0464  acetylglutamate kinase  30.89 
 
 
295 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1116  acetylglutamate kinase  32.51 
 
 
293 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  31.71 
 
 
295 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4240  acetylglutamate kinase  33.88 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2995  acetylglutamate kinase  32.23 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0774  acetylglutamate kinase  33.63 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74078  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0179  acetylglutamate kinase  33.74 
 
 
295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.137233  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1047  acetylglutamate kinase  31.62 
 
 
305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1355  acetylglutamate kinase  33.99 
 
 
256 aa  115  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4154  acetylglutamate kinase  34.17 
 
 
255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4038  acetylglutamate kinase  34.17 
 
 
255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4353  acetylglutamate kinase  34.17 
 
 
255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.783439  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00042  acetylglutamate kinase  35.43 
 
 
263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1322  acetylglutamate kinase  33.19 
 
 
308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2781  acetylglutamate kinase  30.67 
 
 
300 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0075  acetylglutamate kinase  30.89 
 
 
295 aa  115  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0297  acetylglutamate kinase  32.13 
 
 
304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0013  acetylglutamate kinase  33.33 
 
 
302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0962097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1153  acetylglutamate kinase  30.3 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0296435  hitchhiker  0.00582367 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05561  acetylglutamate kinase  32.9 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.91798  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2686  N-acetylglutamate kinase  32.65 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3675  acetylglutamate kinase  32.5 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0797606  normal  0.0933841 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1060  acetylglutamate kinase  35.05 
 
 
294 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0632  arginine biosynthesis bifunctional protein ArgJ  31.08 
 
 
698 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0325581  normal  0.946734 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0814  acetylglutamate kinase  31.69 
 
 
298 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1854  acetylglutamate kinase  30.74 
 
 
296 aa  113  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1674  acetylglutamate kinase  30.6 
 
 
301 aa  112  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.437171  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0500  acetylglutamate kinase  32.9 
 
 
283 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0341  acetylglutamate kinase  28.79 
 
 
305 aa  112  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2288  acetylglutamate kinase  30.42 
 
 
296 aa  112  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0072  acetylglutamate kinase  32.1 
 
 
298 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00499393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  30.89 
 
 
295 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1384  acetylglutamate kinase  31.33 
 
 
304 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971931  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0887  acetylglutamate kinase  34.58 
 
 
294 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.380786  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0539  acetylglutamate kinase  30.51 
 
 
288 aa  112  7.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000417739  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  30.61 
 
 
303 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0633  acetylglutamate kinase  31.28 
 
 
298 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1641  acetylglutamate kinase  31.45 
 
 
295 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0771  acetylglutamate kinase  30.65 
 
 
298 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1864  acetylglutamate kinase  33.61 
 
 
304 aa  111  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1247  acetylglutamate kinase  32.75 
 
 
304 aa  111  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1614  acetylglutamate kinase  32.14 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1730  acetylglutamate kinase  33.33 
 
 
300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0554  acetylglutamate kinase  29.87 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879034  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2342  acetylglutamate kinase  33.19 
 
 
328 aa  110  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07341  acetylglutamate kinase  31 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1078  acetylglutamate kinase  35.06 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05261  acetylglutamate kinase  32.47 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.108747  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1164  acetylglutamate kinase  33.2 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113745  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002313  acetylglutamate kinase  34.53 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824681  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1831  acetylglutamate kinase  31.82 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.242164  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3297  acetylglutamate kinase  29.44 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4059  acetylglutamate kinase  31.6 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3394  acetylglutamate kinase  32.11 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0140  acetylglutamate kinase  32.5 
 
 
344 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2289  acetylglutamate kinase  30 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.99529  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3560  acetylglutamate kinase  31.67 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2013  acetylglutamate kinase  32.51 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0180  acetylglutamate kinase  32.08 
 
 
309 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0680  acetylglutamate kinase  31.28 
 
 
298 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1022  acetylglutamate kinase  31.93 
 
 
283 aa  110  3e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4250  acetylglutamate kinase  31.6 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.531386  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3005  acetylglutamate kinase  33.33 
 
 
299 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.68107 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0996  acetylglutamate kinase  33.47 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3717  acetylglutamate kinase  31.71 
 
 
308 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0277  acetylglutamate kinase  32.92 
 
 
279 aa  109  5e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3112  acetylglutamate kinase  33.33 
 
 
299 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.421465 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02840  acetylglutamate kinase  31.4 
 
 
290 aa  109  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00137776  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3143  acetylglutamate kinase  33.33 
 
 
344 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.537624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>