More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2219 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2219  acetylglutamate kinase  100 
 
 		 262 aa  514  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.448521  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00042  acetylglutamate kinase  83.21 
 
 		 263 aa  442  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002313  acetylglutamate kinase  83.59 
 
 		 263 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824681  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2757  acetylglutamate kinase  69.8 
 
 		 263 aa  352  2.9999999999999997e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0196  acetylglutamate kinase  61.33 
 
 		 257 aa  305  6e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3918  acetylglutamate kinase  62.11 
 
 		 257 aa  303  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4059  acetylglutamate kinase  60.55 
 
 		 257 aa  296  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4780  acetylglutamate kinase  62.5 
 
 		 257 aa  295  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865282 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4250  acetylglutamate kinase  60.16 
 
 		 257 aa  295  7e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.531386  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3897  acetylglutamate kinase  61.18 
 
 		 258 aa  292  4e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0128  acetylglutamate kinase  61.18 
 
 		 258 aa  292  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4088  acetylglutamate kinase  61.18 
 
 		 258 aa  292  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4027  acetylglutamate kinase  57.42 
 
 		 257 aa  270  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03844  acetylglutamate kinase  57.42 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4027  acetylglutamate kinase  57.42 
 
 		 258 aa  270  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4057  acetylglutamate kinase  57.42 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.650697 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03793  hypothetical protein  57.42 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4445  acetylglutamate kinase  57.42 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4498  acetylglutamate kinase  57.42 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.890825  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5419  acetylglutamate kinase  57.42 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4193  acetylglutamate kinase  57.42 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4406  acetylglutamate kinase  57.42 
 
 		 257 aa  268  5e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0773031 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4363  acetylglutamate kinase  57.42 
 
 		 257 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4527  acetylglutamate kinase  57.42 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4450  acetylglutamate kinase  57.42 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178281 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4453  acetylglutamate kinase  57.42 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116052 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4332  acetylglutamate kinase  57.42 
 
 		 257 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0229  acetylglutamate kinase  51.57 
 
 		 260 aa  261  8.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0059376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0251  acetylglutamate kinase  52.67 
 
 		 260 aa  249  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0203  acetylglutamate kinase  51.97 
 
 		 261 aa  248  9e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.515278  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4275  acetylglutamate kinase  49.61 
 
 		 263 aa  246  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000930353  normal  0.309255 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3716  acetylglutamate kinase  52.34 
 
 		 260 aa  237  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0192  acetylglutamate kinase  51.95 
 
 		 259 aa  237  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4094  acetylglutamate kinase  52.34 
 
 		 260 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4013  acetylglutamate kinase  52.34 
 
 		 260 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.673186 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4123  acetylglutamate kinase  52.34 
 
 		 260 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4212  acetylglutamate kinase  52.34 
 
 		 260 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3708  acetylglutamate kinase  51.56 
 
 		 260 aa  236  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0228  acetylglutamate kinase  49.61 
 
 		 267 aa  235  6e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.636422  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3904  acetylglutamate kinase  51.17 
 
 		 260 aa  235  6e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.285866 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0330  acetylglutamate kinase  50 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0237  acetylglutamate kinase  51.17 
 
 		 260 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0276  acetylglutamate kinase  50.78 
 
 		 260 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0257  acetylglutamate kinase  50 
 
 		 262 aa  223  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0981  acetylglutamate kinase  49.03 
 
 		 257 aa  214  9e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.71344  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00531  acetylglutamate kinase  51.26 
 
 		 267 aa  208  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0461  acetylglutamate kinase  45.8 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0352  acetylglutamate kinase  37.35 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281091  normal  0.0894286 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0633  acetylglutamate kinase  36.84 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1090  acetylglutamate kinase  34.82 
 
 		 245 aa  122  8e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.171552  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0539  acetylglutamate kinase  32.43 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000417739  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2143  acetylglutamate kinase  36.6 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0500  acetylglutamate kinase  33.98 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0190  acetylglutamate kinase  36.48 
 
 		 260 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1203  acetylglutamate kinase  36.96 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815716 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4380  acetylglutamate kinase  33.58 
 
 		 301 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0550  acetylglutamate kinase  38.3 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3330  acetylglutamate kinase  36.84 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05261  acetylglutamate kinase  34.38 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.108747  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1595  acetylglutamate kinase  36.89 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02900  acetylglutamate kinase  33.21 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3963  acetylglutamate kinase  36.68 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00282124  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05561  acetylglutamate kinase  36.44 
 
 		 283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.91798  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2995  acetylglutamate kinase  32.96 
 
 		 301 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2729  acetylglutamate kinase  34.65 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1068  acetylglutamate kinase  34.65 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0128  acetylglutamate kinase  32.41 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  31.06 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0075  acetylglutamate kinase  35.12 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2865  acetylglutamate kinase  36.08 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  32.49 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1081  acetylglutamate kinase  32.81 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0152417  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0464  acetylglutamate kinase  34.71 
 
 		 295 aa  112  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4240  acetylglutamate kinase  34.1 
 
 		 255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0058  acetylglutamate kinase  34.75 
 
 		 244 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  32.13 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0064  acetylglutamate kinase  32.84 
 
 		 298 aa  112  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0104  acetylglutamate kinase  34.34 
 
 		 295 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0859  acetylglutamate kinase  37.5 
 
 		 283 aa  112  7.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0182  acetylglutamate kinase  32.83 
 
 		 301 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0306646  hitchhiker  0.000000157401 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04991  acetylglutamate kinase  35.02 
 
 		 300 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2778  acetylglutamate kinase  34.53 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.616506  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2296  acetylglutamate kinase  32.08 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.576653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0028  acetylglutamate kinase  33.59 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5289  acetylglutamate kinase  32.45 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.92163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0225  acetylglutamate kinase  35.32 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21956  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4264  acetylglutamate kinase  37 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5543  acetylglutamate kinase  34.32 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1162  acetylglutamate kinase  33.2 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.174929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6099  acetylglutamate kinase  32.45 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780503  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1131  acetylglutamate kinase  33.2 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5198  acetylglutamate kinase  32.45 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.934726  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0082  acetylglutamate kinase  31.84 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0218  acetylglutamate kinase  31.84 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70280  acetylglutamate kinase  32.45 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2494  acetylglutamate kinase  31.72 
 
 		 291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5339  acetylglutamate kinase  32.08 
 
 		 301 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.866501  hitchhiker  0.00605357 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4201  acetylglutamate kinase  37.89 
 
 		 255 aa  109  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0380  acetylglutamate kinase  34.29 
 
 		 312 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  32.8 
 
 		 294 aa  108  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>