More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0203 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0203  acetylglutamate kinase  100 
 
 		 261 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.515278  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4275  acetylglutamate kinase  76.15 
 
 		 263 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000930353  normal  0.309255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0330  acetylglutamate kinase  72.41 
 
 		 261 aa  391  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0251  acetylglutamate kinase  75.38 
 
 		 260 aa  390  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3708  acetylglutamate kinase  75 
 
 		 260 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0237  acetylglutamate kinase  75 
 
 		 260 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3904  acetylglutamate kinase  74.23 
 
 		 260 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.285866 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4094  acetylglutamate kinase  73.46 
 
 		 260 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0276  acetylglutamate kinase  73.85 
 
 		 260 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4123  acetylglutamate kinase  73.46 
 
 		 260 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4013  acetylglutamate kinase  73.46 
 
 		 260 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.673186 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4212  acetylglutamate kinase  73.46 
 
 		 260 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3716  acetylglutamate kinase  73.46 
 
 		 260 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0192  acetylglutamate kinase  75.58 
 
 		 259 aa  377  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0228  acetylglutamate kinase  69.88 
 
 		 267 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.636422  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0257  acetylglutamate kinase  71.65 
 
 		 262 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00042  acetylglutamate kinase  52.12 
 
 		 263 aa  252  6e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2219  acetylglutamate kinase  51.97 
 
 		 262 aa  248  8e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.448521  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002313  acetylglutamate kinase  52.12 
 
 		 263 aa  246  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824681  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3918  acetylglutamate kinase  47.43 
 
 		 257 aa  229  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4527  acetylglutamate kinase  50.99 
 
 		 257 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4450  acetylglutamate kinase  50.99 
 
 		 257 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178281 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4453  acetylglutamate kinase  50.99 
 
 		 257 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116052 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4250  acetylglutamate kinase  48.22 
 
 		 257 aa  228  7e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.531386  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4363  acetylglutamate kinase  50.59 
 
 		 257 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4332  acetylglutamate kinase  50.59 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4059  acetylglutamate kinase  47.83 
 
 		 257 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0196  acetylglutamate kinase  47.43 
 
 		 257 aa  226  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03844  acetylglutamate kinase  49.8 
 
 		 257 aa  224  8e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4027  acetylglutamate kinase  49.8 
 
 		 258 aa  224  8e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5419  acetylglutamate kinase  49.8 
 
 		 257 aa  224  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4498  acetylglutamate kinase  49.8 
 
 		 257 aa  224  8e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.890825  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4193  acetylglutamate kinase  49.8 
 
 		 257 aa  224  8e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4057  acetylglutamate kinase  49.8 
 
 		 257 aa  224  8e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.650697 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03793  hypothetical protein  49.8 
 
 		 257 aa  224  8e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4445  acetylglutamate kinase  49.8 
 
 		 257 aa  224  8e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4780  acetylglutamate kinase  49.41 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865282 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4406  acetylglutamate kinase  49.8 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0773031 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4027  acetylglutamate kinase  49.41 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2757  acetylglutamate kinase  47.31 
 
 		 263 aa  221  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0229  acetylglutamate kinase  46.15 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0059376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0128  acetylglutamate kinase  48.41 
 
 		 258 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3897  acetylglutamate kinase  48.41 
 
 		 258 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4088  acetylglutamate kinase  48.41 
 
 		 258 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0981  acetylglutamate kinase  49.21 
 
 		 257 aa  215  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.71344  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00531  acetylglutamate kinase  46.25 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0461  acetylglutamate kinase  43.02 
 
 		 260 aa  188  9e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0539  acetylglutamate kinase  35.37 
 
 		 288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000417739  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0128  acetylglutamate kinase  37.63 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0071  acetylglutamate kinase  36.29 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.945463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0190  acetylglutamate kinase  36.32 
 
 		 260 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4154  acetylglutamate kinase  34.52 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0075  acetylglutamate kinase  38.56 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3963  acetylglutamate kinase  33.6 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00282124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4240  acetylglutamate kinase  32.02 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  35.79 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4264  acetylglutamate kinase  33.6 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04991  acetylglutamate kinase  34.55 
 
 		 300 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1041  acetylglutamate kinase  34.07 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0274311  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  35.79 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2653  acetylglutamate kinase  31.85 
 
 		 289 aa  109  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.485023 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4201  acetylglutamate kinase  33.6 
 
 		 255 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4038  acetylglutamate kinase  34.13 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4353  acetylglutamate kinase  34.13 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.783439  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1071  acetylglutamate kinase  33.63 
 
 		 282 aa  107  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0437011  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52011  predicted protein  36.32 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.367344  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3885  acetylglutamate kinase  32.81 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  30.96 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0774  acetylglutamate kinase  33.63 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74078  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1326  acetylglutamate kinase  36.55 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0464  acetylglutamate kinase  37.45 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0996  acetylglutamate kinase  34.38 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3877  acetylglutamate kinase  36.65 
 
 		 236 aa  106  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1641  acetylglutamate kinase  34.58 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0945  acetylglutamate kinase  31.47 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0376196  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0633  acetylglutamate kinase  32.6 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3059  acetylglutamate kinase  34.62 
 
 		 333 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  31.2 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0154  acetylglutamate kinase  34.6 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1047  acetylglutamate kinase  33.18 
 
 		 305 aa  103  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1381  acetylglutamate kinase  33.04 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3717  acetylglutamate kinase  29.37 
 
 		 308 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0380  acetylglutamate kinase  36.55 
 
 		 312 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3394  acetylglutamate kinase  29.37 
 
 		 308 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0554  acetylglutamate kinase  35.08 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879034  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1496  acetylglutamate kinase  31.85 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2494  acetylglutamate kinase  31.23 
 
 		 291 aa  102  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0568  acetylglutamate kinase  31.78 
 
 		 295 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00120396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0352  acetylglutamate kinase  34.32 
 
 		 313 aa  102  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281091  normal  0.0894286 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  32.39 
 
 		 294 aa  102  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0568  acetylglutamate kinase  31.22 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22020  N-acetylglutamate kinase  34.51 
 
 		 330 aa  102  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.869961  decreased coverage  0.00246187 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0659  acetylglutamate kinase  31.3 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0028  acetylglutamate kinase  32.32 
 
 		 297 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1131  acetylglutamate kinase  32.66 
 
 		 309 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1162  acetylglutamate kinase  32.66 
 
 		 309 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.174929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0579  acetylglutamate kinase  30.8 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.503767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1247  acetylglutamate kinase  29.46 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0859  acetylglutamate kinase  31.8 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0033  acetylglutamate kinase  29 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>