More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0945 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0945  acetylglutamate kinase  100 
 
 
262 aa  513  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0376196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0172  N-acetylglutamate kinase  46.74 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0181  acetylglutamate kinase  46.22 
 
 
271 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.540246  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0192  acetylglutamate kinase  46.74 
 
 
272 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.248714  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0181  acetylglutamate kinase  46.74 
 
 
272 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1732  acetylglutamate kinase  38.27 
 
 
289 aa  169  6e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4935  acetylglutamate kinase  43.5 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3717  acetylglutamate kinase  36.59 
 
 
308 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3394  acetylglutamate kinase  36.59 
 
 
308 aa  158  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4174  acetylglutamate kinase  39.22 
 
 
261 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000373666  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0539  acetylglutamate kinase  33.2 
 
 
288 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000417739  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1950  acetylglutamate kinase  34.84 
 
 
300 aa  155  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0033  acetylglutamate kinase  35.77 
 
 
310 aa  155  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2288  acetylglutamate kinase  36.25 
 
 
296 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3086  N-acetylglutamate kinase  36.95 
 
 
264 aa  154  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0180  acetylglutamate kinase  36.59 
 
 
309 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0140  acetylglutamate kinase  36.18 
 
 
344 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0568  acetylglutamate kinase  40.19 
 
 
295 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00120396  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0179  acetylglutamate kinase  37.75 
 
 
295 aa  151  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.137233  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1164  acetylglutamate kinase  36.03 
 
 
300 aa  151  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113745  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1906  acetylglutamate kinase  31.84 
 
 
291 aa  149  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0488998  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0659  acetylglutamate kinase  36.36 
 
 
299 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6552  acetylglutamate kinase  35.63 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1899  acetylglutamate kinase  34.94 
 
 
304 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0127  acetylglutamate kinase  34.01 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.303702  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1078  acetylglutamate kinase  32.39 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0629  acetylglutamate kinase  35.22 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.615358  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1730  acetylglutamate kinase  34.4 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1041  acetylglutamate kinase  35.25 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0274311  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02900  acetylglutamate kinase  35.2 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1071  acetylglutamate kinase  35.25 
 
 
282 aa  146  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0437011  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4380  acetylglutamate kinase  34.4 
 
 
301 aa  145  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2289  acetylglutamate kinase  34.69 
 
 
287 aa  145  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.99529  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2013  acetylglutamate kinase  34.55 
 
 
300 aa  145  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0771  acetylglutamate kinase  36.9 
 
 
298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2781  acetylglutamate kinase  36.84 
 
 
300 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1321  acetylglutamate kinase  35.77 
 
 
296 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.463012 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  35.37 
 
 
294 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0064  acetylglutamate kinase  34.94 
 
 
298 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  34.94 
 
 
303 aa  143  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1153  acetylglutamate kinase  35.1 
 
 
292 aa  143  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0296435  hitchhiker  0.00582367 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1595  acetylglutamate kinase  40.32 
 
 
258 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  38.21 
 
 
292 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1060  acetylglutamate kinase  31.98 
 
 
294 aa  142  7e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0056  acetylglutamate kinase  33.2 
 
 
304 aa  142  7e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3438  acetylglutamate kinase  34.55 
 
 
299 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3249  acetylglutamate kinase  34.55 
 
 
299 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219346  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0160  acetylglutamate kinase  34.96 
 
 
355 aa  142  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0195  acetylglutamate kinase  34.55 
 
 
299 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0273  acetylglutamate kinase  36.29 
 
 
287 aa  141  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0150  acetylglutamate kinase  37.8 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1131  acetylglutamate kinase  35.22 
 
 
309 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0380  acetylglutamate kinase  34.55 
 
 
351 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.734124  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5543  acetylglutamate kinase  34.02 
 
 
301 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0433  acetylglutamate kinase  38.52 
 
 
290 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.394347  hitchhiker  0.0000000109203 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1162  acetylglutamate kinase  35.22 
 
 
309 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.174929  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1614  acetylglutamate kinase  33.96 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3524  acetylglutamate kinase  34.15 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0887  acetylglutamate kinase  33.49 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.380786  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0256  acetylglutamate kinase  38.52 
 
 
290 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0341  acetylglutamate kinase  37.56 
 
 
305 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2179  acetylglutamate kinase  34.55 
 
 
351 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0185  acetylglutamate kinase  34.55 
 
 
351 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.651482  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2910  acetylglutamate kinase  34.55 
 
 
351 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.290051  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0773  acetylglutamate kinase  35.77 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0182  acetylglutamate kinase  33.6 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0306646  hitchhiker  0.000000157401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3982  acetylglutamate kinase  34.55 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3682  N-acetylglutamate kinase  34.4 
 
 
294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3429  acetylglutamate kinase  35.1 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.163464  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0568  acetylglutamate kinase  35.37 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0588  acetylglutamate kinase  35.37 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1641  acetylglutamate kinase  34.68 
 
 
295 aa  140  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5289  acetylglutamate kinase  33.6 
 
 
301 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.92163 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6099  acetylglutamate kinase  34 
 
 
301 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780503  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5198  acetylglutamate kinase  33.6 
 
 
301 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.934726  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0738  acetylglutamate kinase  34.29 
 
 
257 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0640766  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70280  acetylglutamate kinase  34 
 
 
301 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4139  acetylglutamate kinase  34.55 
 
 
296 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9539  hitchhiker  0.00000200653 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2296  acetylglutamate kinase  38.8 
 
 
300 aa  139  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.576653  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3635  acetylglutamate kinase  35.86 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0579  acetylglutamate kinase  35.2 
 
 
303 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.503767  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0028  acetylglutamate kinase  36.03 
 
 
297 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5339  acetylglutamate kinase  33.6 
 
 
301 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.866501  hitchhiker  0.00605357 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0084  acetylglutamate kinase  35.02 
 
 
304 aa  139  7e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3005  acetylglutamate kinase  33.74 
 
 
299 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.68107 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3174  acetylglutamate kinase  35.74 
 
 
292 aa  138  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.696563  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0225  acetylglutamate kinase  37.01 
 
 
292 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21956  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0277  acetylglutamate kinase  31.43 
 
 
279 aa  138  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1831  acetylglutamate kinase  39.71 
 
 
284 aa  137  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.242164  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2995  acetylglutamate kinase  33.47 
 
 
301 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6447  acetylglutamate kinase  33.74 
 
 
299 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.635335  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3740  acetylglutamate kinase  35.83 
 
 
292 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3112  acetylglutamate kinase  33.74 
 
 
299 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.421465 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1381  acetylglutamate kinase  33.61 
 
 
304 aa  137  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0064  acetylglutamate kinase  33.74 
 
 
299 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207968  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0568  acetylglutamate kinase  35.2 
 
 
299 aa  138  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3092  acetylglutamate kinase  33.74 
 
 
321 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.144382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3675  acetylglutamate kinase  31.73 
 
 
300 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0797606  normal  0.0933841 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2494  acetylglutamate kinase  34.26 
 
 
291 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4385  acetylglutamate kinase  33.74 
 
 
299 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614022  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>