More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6552 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6552  acetylglutamate kinase  100 
 
 
262 aa  522  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4174  acetylglutamate kinase  58.14 
 
 
261 aa  302  5.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000373666  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3086  N-acetylglutamate kinase  56.82 
 
 
264 aa  296  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4205  acetylglutamate kinase  56.73 
 
 
263 aa  286  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000043069  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1157  acetylglutamate kinase  54.44 
 
 
260 aa  275  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3429  acetylglutamate kinase  52.61 
 
 
257 aa  268  7e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.163464  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0945  acetylglutamate kinase  35.63 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0376196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0172  N-acetylglutamate kinase  36.29 
 
 
270 aa  141  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0181  acetylglutamate kinase  36.29 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0181  acetylglutamate kinase  34.55 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.540246  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0192  acetylglutamate kinase  36.29 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.248714  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0190  acetylglutamate kinase  38.33 
 
 
260 aa  136  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0273  acetylglutamate kinase  37.08 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0539  acetylglutamate kinase  36.1 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000417739  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4160  acetylglutamate kinase  40.74 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.03818  normal  0.261646 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1381  acetylglutamate kinase  34.31 
 
 
304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0056  acetylglutamate kinase  33.86 
 
 
304 aa  132  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0659  acetylglutamate kinase  35.86 
 
 
299 aa  132  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0868  acetylglutamate kinase  37.72 
 
 
304 aa  132  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.990668  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0633  acetylglutamate kinase  34.3 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0954  acetylglutamate kinase  36.56 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.576098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2297  acetylglutamate kinase  36.65 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4935  acetylglutamate kinase  35.37 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0128  acetylglutamate kinase  34.71 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3330  acetylglutamate kinase  36.53 
 
 
305 aa  129  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1203  acetylglutamate kinase  37.08 
 
 
294 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815716 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3173  acetylglutamate kinase  36.8 
 
 
362 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0759623  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2621  acetylglutamate kinase  35.94 
 
 
298 aa  129  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0678898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1384  acetylglutamate kinase  36.69 
 
 
304 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971931  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2342  acetylglutamate kinase  35.94 
 
 
298 aa  129  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791434  normal  0.660777 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2494  acetylglutamate kinase  36.76 
 
 
291 aa  129  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1247  acetylglutamate kinase  36.59 
 
 
304 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0554  acetylglutamate kinase  35.74 
 
 
297 aa  126  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879034  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1831  acetylglutamate kinase  36.82 
 
 
284 aa  126  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.242164  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0774  acetylglutamate kinase  33.89 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74078  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1641  acetylglutamate kinase  32.03 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1322  acetylglutamate kinase  34.41 
 
 
308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1041  acetylglutamate kinase  36.21 
 
 
282 aa  125  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0274311  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3560  acetylglutamate kinase  35.08 
 
 
290 aa  125  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1047  acetylglutamate kinase  35.02 
 
 
305 aa  125  9e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1071  acetylglutamate kinase  36.21 
 
 
282 aa  124  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0437011  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3297  acetylglutamate kinase  33.1 
 
 
303 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0579  acetylglutamate kinase  34.26 
 
 
303 aa  123  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.503767  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2153  acetylglutamate kinase  35.25 
 
 
298 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1496  acetylglutamate kinase  32.34 
 
 
301 aa  123  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  35.83 
 
 
295 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0301  acetylglutamate kinase  34.7 
 
 
286 aa  123  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.84379  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1351  acetylglutamate kinase  34.3 
 
 
283 aa  122  5e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1153  acetylglutamate kinase  33.83 
 
 
292 aa  122  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0296435  hitchhiker  0.00582367 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0327  acetylglutamate kinase  34.55 
 
 
287 aa  122  6e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1854  acetylglutamate kinase  35.17 
 
 
296 aa  122  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  35.43 
 
 
295 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0621  acetylglutamate kinase  36.69 
 
 
302 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000196007 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3059  acetylglutamate kinase  34.29 
 
 
333 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1181  acetylglutamate kinase  32.41 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0075  acetylglutamate kinase  33.58 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0028  acetylglutamate kinase  34.47 
 
 
297 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0341  acetylglutamate kinase  33.06 
 
 
305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1152  acetylglutamate kinase  36.02 
 
 
289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.749063  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  35.86 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4143  acetylglutamate kinase  34.52 
 
 
248 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1131  acetylglutamate kinase  32.77 
 
 
309 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2288  acetylglutamate kinase  31.45 
 
 
296 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0568  acetylglutamate kinase  33.82 
 
 
299 aa  120  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2289  acetylglutamate kinase  31.69 
 
 
287 aa  119  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.99529  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1162  acetylglutamate kinase  32.77 
 
 
309 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.174929  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0738  acetylglutamate kinase  33.47 
 
 
257 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0640766  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1595  acetylglutamate kinase  37.59 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3095  acetylglutamate kinase  35.14 
 
 
302 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2995  acetylglutamate kinase  32.73 
 
 
301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0814  acetylglutamate kinase  35.43 
 
 
298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0771  acetylglutamate kinase  30.92 
 
 
298 aa  119  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1068  acetylglutamate kinase  34.07 
 
 
293 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2729  acetylglutamate kinase  34.07 
 
 
293 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1074  acetylglutamate kinase  34.41 
 
 
302 aa  118  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0568  acetylglutamate kinase  33.47 
 
 
295 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00120396  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04991  acetylglutamate kinase  32.49 
 
 
300 aa  118  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52011  predicted protein  33.84 
 
 
334 aa  118  9e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.367344  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  31.87 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1906  acetylglutamate kinase  31.71 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0488998  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0854  acetylglutamate kinase  33.61 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.277534  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0633  acetylglutamate kinase  33.6 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2371  acetylglutamate kinase  35.19 
 
 
312 aa  116  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0310065 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1358  acetylglutamate kinase  35.16 
 
 
296 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1739  acetylglutamate kinase  33.7 
 
 
344 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1025  acetylglutamate kinase  34.8 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.977897  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0966  acetylglutamate kinase  34.8 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2686  N-acetylglutamate kinase  34.07 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1081  acetylglutamate kinase  30.67 
 
 
280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0152417  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7329  acetylglutamate kinase  35.83 
 
 
298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3675  acetylglutamate kinase  35.06 
 
 
300 aa  115  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0797606  normal  0.0933841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0072  acetylglutamate kinase  35.04 
 
 
298 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00499393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0064  acetylglutamate kinase  33.73 
 
 
298 aa  115  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5543  acetylglutamate kinase  34.05 
 
 
301 aa  115  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2865  acetylglutamate kinase  33.7 
 
 
292 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1116  acetylglutamate kinase  32.35 
 
 
293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  33.06 
 
 
292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0380  acetylglutamate kinase  34.06 
 
 
312 aa  115  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6099  acetylglutamate kinase  33.57 
 
 
301 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780503  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1732  acetylglutamate kinase  32.38 
 
 
289 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>