More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4174 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4174  acetylglutamate kinase  100 
 
 
261 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000373666  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1157  acetylglutamate kinase  66.67 
 
 
260 aa  344  7e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3086  N-acetylglutamate kinase  62.15 
 
 
264 aa  318  3.9999999999999996e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6552  acetylglutamate kinase  58.14 
 
 
262 aa  302  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4205  acetylglutamate kinase  53.05 
 
 
263 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000043069  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3429  acetylglutamate kinase  51.85 
 
 
257 aa  268  5.9999999999999995e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.163464  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0945  acetylglutamate kinase  39.22 
 
 
262 aa  158  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0376196  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0190  acetylglutamate kinase  36.48 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0181  acetylglutamate kinase  36.06 
 
 
271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.540246  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0539  acetylglutamate kinase  33.2 
 
 
288 aa  136  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000417739  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0350  acetylglutamate kinase  35.95 
 
 
254 aa  135  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000201879 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0181  acetylglutamate kinase  34.57 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  35.2 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0579  acetylglutamate kinase  34.93 
 
 
303 aa  133  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.503767  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0172  N-acetylglutamate kinase  34.69 
 
 
270 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3297  acetylglutamate kinase  34.3 
 
 
303 aa  133  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1081  acetylglutamate kinase  36.13 
 
 
280 aa  133  3e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0152417  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0192  acetylglutamate kinase  34.69 
 
 
272 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.248714  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1950  acetylglutamate kinase  33.97 
 
 
300 aa  132  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2621  acetylglutamate kinase  35.51 
 
 
298 aa  132  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0678898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2342  acetylglutamate kinase  35.51 
 
 
298 aa  132  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791434  normal  0.660777 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0568  acetylglutamate kinase  34.56 
 
 
299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0128  acetylglutamate kinase  34.84 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2297  acetylglutamate kinase  35.02 
 
 
298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1732  acetylglutamate kinase  33.09 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2288  acetylglutamate kinase  33.33 
 
 
296 aa  129  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0179  acetylglutamate kinase  34.32 
 
 
295 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.137233  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  34.44 
 
 
292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1257  acetylglutamate kinase  34.02 
 
 
272 aa  129  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0659  acetylglutamate kinase  36.41 
 
 
299 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1247  acetylglutamate kinase  33.47 
 
 
304 aa  128  8.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  34.19 
 
 
295 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0954  acetylglutamate kinase  33.94 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.576098 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1068  N-acetylglutamate kinase  34.58 
 
 
272 aa  126  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.179639  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  34.56 
 
 
295 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3560  acetylglutamate kinase  34.19 
 
 
290 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0633  acetylglutamate kinase  35.83 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3330  acetylglutamate kinase  34.34 
 
 
305 aa  125  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1831  acetylglutamate kinase  33.71 
 
 
284 aa  126  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.242164  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0104  acetylglutamate kinase  33.95 
 
 
295 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2289  acetylglutamate kinase  32.32 
 
 
287 aa  125  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.99529  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2143  acetylglutamate kinase  35.42 
 
 
336 aa  125  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3675  acetylglutamate kinase  33.95 
 
 
300 aa  125  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0797606  normal  0.0933841 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02900  acetylglutamate kinase  34.5 
 
 
300 aa  125  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02840  acetylglutamate kinase  30.57 
 
 
290 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00137776  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1496  acetylglutamate kinase  33.21 
 
 
301 aa  124  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4160  acetylglutamate kinase  38.59 
 
 
261 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.03818  normal  0.261646 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1047  acetylglutamate kinase  32.65 
 
 
305 aa  124  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1203  acetylglutamate kinase  34.22 
 
 
294 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815716 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1322  acetylglutamate kinase  31.67 
 
 
308 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0075  acetylglutamate kinase  33.82 
 
 
295 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0327  acetylglutamate kinase  34.57 
 
 
287 aa  122  4e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1381  acetylglutamate kinase  31.67 
 
 
304 aa  123  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1351  acetylglutamate kinase  35.25 
 
 
283 aa  123  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4143  acetylglutamate kinase  36.95 
 
 
248 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2494  acetylglutamate kinase  33.09 
 
 
291 aa  122  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2729  acetylglutamate kinase  34.85 
 
 
293 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1068  acetylglutamate kinase  34.85 
 
 
293 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2296  acetylglutamate kinase  34.32 
 
 
300 aa  122  6e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.576653  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2865  acetylglutamate kinase  34.44 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1025  acetylglutamate kinase  35.66 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.977897  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0256  acetylglutamate kinase  33.84 
 
 
290 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1041  acetylglutamate kinase  33.46 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0274311  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5543  acetylglutamate kinase  34.57 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0273  acetylglutamate kinase  33.46 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0433  acetylglutamate kinase  33.84 
 
 
290 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.394347  hitchhiker  0.0000000109203 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2013  acetylglutamate kinase  33.33 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1358  acetylglutamate kinase  35.66 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0966  acetylglutamate kinase  35.66 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04991  acetylglutamate kinase  32.18 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2686  N-acetylglutamate kinase  33.21 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3717  acetylglutamate kinase  32.52 
 
 
308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2910  acetylglutamate kinase  34.19 
 
 
301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872032  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  32.46 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1384  acetylglutamate kinase  33.09 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971931  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0633  acetylglutamate kinase  33.95 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0297  acetylglutamate kinase  36.16 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5289  acetylglutamate kinase  34.11 
 
 
301 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.92163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5198  acetylglutamate kinase  34.11 
 
 
301 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.934726  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0352  acetylglutamate kinase  33.7 
 
 
313 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281091  normal  0.0894286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0182  acetylglutamate kinase  34.11 
 
 
301 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0306646  hitchhiker  0.000000157401 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4935  acetylglutamate kinase  33.6 
 
 
279 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0774  acetylglutamate kinase  31.38 
 
 
286 aa  120  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74078  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0500  acetylglutamate kinase  30.53 
 
 
283 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4380  acetylglutamate kinase  33.72 
 
 
301 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1071  acetylglutamate kinase  33.08 
 
 
282 aa  120  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0437011  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5339  acetylglutamate kinase  34.11 
 
 
301 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.866501  hitchhiker  0.00605357 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3394  acetylglutamate kinase  32.11 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1730  acetylglutamate kinase  32.93 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1040  acetylglutamate kinase  31.25 
 
 
272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07341  acetylglutamate kinase  33.59 
 
 
308 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0464  acetylglutamate kinase  33.46 
 
 
295 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0013  acetylglutamate kinase  35.32 
 
 
302 aa  118  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0962097 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0301  acetylglutamate kinase  33.86 
 
 
286 aa  118  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.84379  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0084  acetylglutamate kinase  33.09 
 
 
304 aa  118  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0868  acetylglutamate kinase  32.73 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.990668  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05561  acetylglutamate kinase  30.92 
 
 
283 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.91798  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1697  acetylglutamate kinase  31.09 
 
 
299 aa  117  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0621  acetylglutamate kinase  34.69 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000196007 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1614  acetylglutamate kinase  30.63 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>