More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4205 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4205  acetylglutamate kinase  100 
 
 
263 aa  533  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000043069  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6552  acetylglutamate kinase  56.73 
 
 
262 aa  286  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3086  N-acetylglutamate kinase  52.85 
 
 
264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4174  acetylglutamate kinase  53.05 
 
 
261 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000373666  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3429  acetylglutamate kinase  55.42 
 
 
257 aa  272  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.163464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1157  acetylglutamate kinase  49.81 
 
 
260 aa  245  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0539  acetylglutamate kinase  36.67 
 
 
288 aa  152  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000417739  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0172  N-acetylglutamate kinase  38.31 
 
 
270 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0181  acetylglutamate kinase  38.31 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0192  acetylglutamate kinase  38.31 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.248714  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0771  acetylglutamate kinase  34.94 
 
 
298 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0181  acetylglutamate kinase  36.4 
 
 
271 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.540246  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3330  acetylglutamate kinase  35.54 
 
 
305 aa  136  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0945  acetylglutamate kinase  34.4 
 
 
262 aa  136  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0376196  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0554  acetylglutamate kinase  36.25 
 
 
297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879034  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04991  acetylglutamate kinase  34.44 
 
 
300 aa  135  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1732  acetylglutamate kinase  35.89 
 
 
289 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0273  acetylglutamate kinase  34.02 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0128  acetylglutamate kinase  35.22 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1203  acetylglutamate kinase  35.54 
 
 
294 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815716 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1854  acetylglutamate kinase  35.27 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1153  acetylglutamate kinase  35.95 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0296435  hitchhiker  0.00582367 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1181  acetylglutamate kinase  33.33 
 
 
322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1496  acetylglutamate kinase  32.92 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1950  acetylglutamate kinase  36.06 
 
 
300 aa  129  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1641  acetylglutamate kinase  35.04 
 
 
295 aa  130  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52011  predicted protein  35.83 
 
 
334 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.367344  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0341  acetylglutamate kinase  32.94 
 
 
305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1674  acetylglutamate kinase  34.85 
 
 
301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.437171  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4935  acetylglutamate kinase  34.94 
 
 
279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1081  acetylglutamate kinase  34.17 
 
 
280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0152417  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0774  acetylglutamate kinase  34.58 
 
 
286 aa  129  6e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74078  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1906  acetylglutamate kinase  32.38 
 
 
291 aa  129  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0488998  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0633  acetylglutamate kinase  32.5 
 
 
285 aa  128  9.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02840  acetylglutamate kinase  33.06 
 
 
290 aa  128  9.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00137776  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2289  acetylglutamate kinase  33.74 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.99529  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1131  acetylglutamate kinase  32.92 
 
 
309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1162  acetylglutamate kinase  32.92 
 
 
309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.174929  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0568  acetylglutamate kinase  32.94 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00120396  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1322  acetylglutamate kinase  32.78 
 
 
308 aa  125  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0056  acetylglutamate kinase  33.33 
 
 
304 aa  125  6e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07341  acetylglutamate kinase  38.05 
 
 
308 aa  125  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0659  acetylglutamate kinase  33.06 
 
 
299 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0028  acetylglutamate kinase  32.5 
 
 
297 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1247  acetylglutamate kinase  32.5 
 
 
304 aa  123  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2288  acetylglutamate kinase  31.85 
 
 
296 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3297  acetylglutamate kinase  31.37 
 
 
303 aa  123  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1381  acetylglutamate kinase  33.47 
 
 
304 aa  123  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3717  acetylglutamate kinase  31.98 
 
 
308 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0127  acetylglutamate kinase  34 
 
 
294 aa  122  6e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.303702  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3394  acetylglutamate kinase  31.58 
 
 
308 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1831  acetylglutamate kinase  36.25 
 
 
284 aa  122  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.242164  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0190  acetylglutamate kinase  34.58 
 
 
260 aa  121  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0854  acetylglutamate kinase  33.74 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.277534  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  34.8 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1152  acetylglutamate kinase  33.75 
 
 
289 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.749063  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  35.2 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0033  acetylglutamate kinase  31.98 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2778  acetylglutamate kinase  34.09 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.616506  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02900  acetylglutamate kinase  33.46 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1351  acetylglutamate kinase  34.82 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0954  acetylglutamate kinase  34.66 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.576098 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3173  acetylglutamate kinase  32.38 
 
 
362 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0759623  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0075  acetylglutamate kinase  34.4 
 
 
295 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2297  acetylglutamate kinase  35.2 
 
 
298 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2413  acetylglutamate kinase  33.33 
 
 
296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2910  acetylglutamate kinase  33.99 
 
 
301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872032  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2729  acetylglutamate kinase  33.2 
 
 
293 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0154  acetylglutamate kinase  34.54 
 
 
289 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2621  acetylglutamate kinase  34.4 
 
 
298 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0678898 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1068  acetylglutamate kinase  33.2 
 
 
293 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2342  acetylglutamate kinase  34.4 
 
 
298 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791434  normal  0.660777 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0684  acetylglutamate kinase  34.71 
 
 
293 aa  118  9e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1071  acetylglutamate kinase  33.07 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0437011  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1047  acetylglutamate kinase  32.52 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1041  acetylglutamate kinase  33.07 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0274311  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05561  acetylglutamate kinase  32.08 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.91798  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2781  acetylglutamate kinase  33.73 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  31.73 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0868  acetylglutamate kinase  34 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.990668  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0738  acetylglutamate kinase  34.02 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0640766  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4160  acetylglutamate kinase  34.47 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.03818  normal  0.261646 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2494  acetylglutamate kinase  33.6 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1384  acetylglutamate kinase  34.4 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971931  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1068  N-acetylglutamate kinase  32.44 
 
 
272 aa  116  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.179639  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0180  acetylglutamate kinase  31.17 
 
 
309 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05261  acetylglutamate kinase  32.08 
 
 
283 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.108747  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1078  acetylglutamate kinase  31.45 
 
 
294 aa  116  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3560  acetylglutamate kinase  33.47 
 
 
290 aa  116  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0887  acetylglutamate kinase  32.26 
 
 
294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.380786  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0633  acetylglutamate kinase  33.73 
 
 
298 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0380  acetylglutamate kinase  34.8 
 
 
312 aa  115  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2865  acetylglutamate kinase  32.78 
 
 
292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0140  acetylglutamate kinase  30.77 
 
 
344 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1614  acetylglutamate kinase  32.26 
 
 
294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7329  acetylglutamate kinase  33.73 
 
 
298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0224  acetylglutamate kinase  34.17 
 
 
279 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4380  acetylglutamate kinase  32.28 
 
 
301 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0464  acetylglutamate kinase  33.6 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  31.73 
 
 
303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>