More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3173 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3173  acetylglutamate kinase  100 
 
 
362 aa  706    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0759623  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1739  acetylglutamate kinase  83.84 
 
 
344 aa  481  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2153  acetylglutamate kinase  68.28 
 
 
298 aa  412  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6075  Acetylglutamate kinase  68.58 
 
 
322 aa  401  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733512  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3059  acetylglutamate kinase  66.11 
 
 
333 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2055  acetylglutamate kinase  68.53 
 
 
302 aa  391  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.340401  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5469  acetylglutamate kinase  70.59 
 
 
304 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0752137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2029  acetylglutamate kinase  67.11 
 
 
305 aa  383  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.475963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3064  acetylglutamate kinase  65.14 
 
 
297 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0126783  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1261  acetylglutamate kinase  70.24 
 
 
296 aa  373  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.101538 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5454  acetylglutamate kinase  64.31 
 
 
300 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0243823  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1883  acetylglutamate kinase  64.79 
 
 
295 aa  360  3e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0336877  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1329  acetylglutamate kinase  58.9 
 
 
355 aa  359  4e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2371  acetylglutamate kinase  60.73 
 
 
312 aa  356  2.9999999999999997e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0310065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1890  acetylglutamate kinase  62.88 
 
 
310 aa  355  5.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.259504 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25610  acetylglutamate kinase  62.03 
 
 
308 aa  353  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4129  acetylglutamate kinase  63.82 
 
 
309 aa  348  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0223345  hitchhiker  0.000007027 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1113  acetylglutamate kinase  59.26 
 
 
320 aa  344  2e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.736746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2470  acetylglutamate kinase  63.12 
 
 
312 aa  343  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2401  acetylglutamate kinase  61.97 
 
 
301 aa  338  9.999999999999999e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1643  acetylglutamate kinase  62.5 
 
 
335 aa  325  9e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3159  acetylglutamate kinase  61.46 
 
 
300 aa  325  1e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.553724  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2985  acetylglutamate kinase  58.6 
 
 
290 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0890532 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3312  acetylglutamate kinase  57.04 
 
 
291 aa  323  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0257108  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1498  acetylglutamate kinase  59.12 
 
 
310 aa  323  4e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3026  acetylglutamate kinase  62.2 
 
 
336 aa  322  5e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00309896  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2839  acetylglutamate kinase  57.69 
 
 
302 aa  322  5e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0122631  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0814  acetylglutamate kinase  56.58 
 
 
314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11672  acetylglutamate kinase  59.07 
 
 
294 aa  319  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000816294  normal  0.866365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3528  acetylglutamate kinase  56.94 
 
 
290 aa  318  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21720  N-acetylglutamate kinase  58.82 
 
 
341 aa  318  1e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22310  N-acetylglutamate kinase  62.94 
 
 
338 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0338675  normal  0.745589 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1499  acetylglutamate kinase  56.39 
 
 
319 aa  311  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000529185 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2970  acetylglutamate kinase  58.6 
 
 
290 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.335314  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3014  acetylglutamate kinase  58.6 
 
 
290 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  0.626822 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14400  acetylglutamate kinase  60.19 
 
 
328 aa  295  8e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0568  acetylglutamate kinase  49.66 
 
 
295 aa  288  8e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00120396  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0659  acetylglutamate kinase  47.22 
 
 
299 aa  279  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0771  acetylglutamate kinase  48.11 
 
 
298 aa  271  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1697  acetylglutamate kinase  46.34 
 
 
299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0341  acetylglutamate kinase  47.62 
 
 
305 aa  266  5e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3740  acetylglutamate kinase  48.11 
 
 
292 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3174  acetylglutamate kinase  47.75 
 
 
292 aa  265  8e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.696563  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2288  acetylglutamate kinase  46.37 
 
 
296 aa  264  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3635  acetylglutamate kinase  47.77 
 
 
292 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0273  acetylglutamate kinase  45.64 
 
 
287 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0554  acetylglutamate kinase  47.57 
 
 
297 aa  261  8.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879034  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22020  N-acetylglutamate kinase  47.16 
 
 
330 aa  260  3e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.869961  decreased coverage  0.00246187 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0225  acetylglutamate kinase  47.78 
 
 
292 aa  259  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21956  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3613  acetylglutamate kinase  48.91 
 
 
288 aa  259  5.0000000000000005e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.522961  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02900  acetylglutamate kinase  47.47 
 
 
300 aa  259  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1864  acetylglutamate kinase  42.96 
 
 
304 aa  258  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0203  acetylglutamate kinase  49.83 
 
 
292 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0028  acetylglutamate kinase  46.44 
 
 
297 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3682  N-acetylglutamate kinase  45.86 
 
 
294 aa  258  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3152  acetylglutamate kinase  46.71 
 
 
292 aa  256  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0352  acetylglutamate kinase  49.35 
 
 
313 aa  256  5e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281091  normal  0.0894286 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0064  acetylglutamate kinase  46.74 
 
 
298 aa  256  5e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1831  acetylglutamate kinase  46.34 
 
 
284 aa  255  7e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.242164  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1854  acetylglutamate kinase  46.18 
 
 
296 aa  255  1.0000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1732  acetylglutamate kinase  47.02 
 
 
289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0154  acetylglutamate kinase  46.9 
 
 
289 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2289  acetylglutamate kinase  44.64 
 
 
287 aa  253  5.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.99529  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3675  acetylglutamate kinase  45.58 
 
 
300 aa  252  6e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0797606  normal  0.0933841 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3560  acetylglutamate kinase  47.02 
 
 
290 aa  252  8.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1153  acetylglutamate kinase  44.33 
 
 
292 aa  252  8.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0296435  hitchhiker  0.00582367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0182  acetylglutamate kinase  46.15 
 
 
301 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0306646  hitchhiker  0.000000157401 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0150  acetylglutamate kinase  49.83 
 
 
292 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5289  acetylglutamate kinase  46.15 
 
 
301 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.92163 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6099  acetylglutamate kinase  47.2 
 
 
301 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780503  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5198  acetylglutamate kinase  46.15 
 
 
301 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.934726  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1162  acetylglutamate kinase  45.14 
 
 
309 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.174929  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1131  acetylglutamate kinase  45.14 
 
 
309 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  45.67 
 
 
295 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1351  acetylglutamate kinase  43.6 
 
 
283 aa  251  2e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  45.67 
 
 
295 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  45.55 
 
 
294 aa  250  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1078  acetylglutamate kinase  45.1 
 
 
293 aa  250  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5339  acetylglutamate kinase  46.15 
 
 
301 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.866501  hitchhiker  0.00605357 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0082  acetylglutamate kinase  46.13 
 
 
301 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0218  acetylglutamate kinase  46.13 
 
 
301 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1906  acetylglutamate kinase  40.35 
 
 
291 aa  249  5e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0488998  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4380  acetylglutamate kinase  46.58 
 
 
301 aa  249  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2781  acetylglutamate kinase  47.72 
 
 
300 aa  249  6e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0179  acetylglutamate kinase  46.5 
 
 
295 aa  249  6e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.137233  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0104  acetylglutamate kinase  46.92 
 
 
295 aa  249  6e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  45.48 
 
 
303 aa  248  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2995  acetylglutamate kinase  44.71 
 
 
301 aa  248  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70280  acetylglutamate kinase  46.85 
 
 
301 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0127  acetylglutamate kinase  41.26 
 
 
294 aa  248  2e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.303702  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2413  acetylglutamate kinase  47.22 
 
 
296 aa  247  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3982  acetylglutamate kinase  45.8 
 
 
305 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2984  N-acetylglutamate kinase  46.28 
 
 
306 aa  247  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.492788  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02840  acetylglutamate kinase  41.46 
 
 
290 aa  246  4e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00137776  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1496  acetylglutamate kinase  47.7 
 
 
301 aa  246  4e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04991  acetylglutamate kinase  45.96 
 
 
300 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0256  acetylglutamate kinase  48.58 
 
 
290 aa  246  6e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0433  acetylglutamate kinase  48.58 
 
 
290 aa  246  6e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.394347  hitchhiker  0.0000000109203 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1674  acetylglutamate kinase  47.95 
 
 
301 aa  245  6.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.437171  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0568  acetylglutamate kinase  46.55 
 
 
299 aa  245  6.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>