More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1890 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1890  acetylglutamate kinase  100 
 
 		 310 aa  616  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.259504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1883  acetylglutamate kinase  88.44 
 
 		 295 aa  497  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0336877  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3064  acetylglutamate kinase  73.72 
 
 		 297 aa  415  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0126783  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1329  acetylglutamate kinase  72.89 
 
 		 355 aa  407  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5454  acetylglutamate kinase  71.83 
 
 		 300 aa  407  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0243823  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25610  acetylglutamate kinase  72.22 
 
 		 308 aa  395  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2401  acetylglutamate kinase  72.6 
 
 		 301 aa  389  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2153  acetylglutamate kinase  66.9 
 
 		 298 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4129  acetylglutamate kinase  70.69 
 
 		 309 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0223345  hitchhiker  0.000007027 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3159  acetylglutamate kinase  70.76 
 
 		 300 aa  386  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.553724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1113  acetylglutamate kinase  68.66 
 
 		 320 aa  381  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.736746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2371  acetylglutamate kinase  66.22 
 
 		 312 aa  382  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0310065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6075  Acetylglutamate kinase  68.62 
 
 		 322 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2839  acetylglutamate kinase  67.24 
 
 		 302 aa  375  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0122631  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3173  acetylglutamate kinase  62.88 
 
 		 362 aa  371  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0759623  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1499  acetylglutamate kinase  64.38 
 
 		 319 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000529185 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11672  acetylglutamate kinase  67.84 
 
 		 294 aa  368  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000816294  normal  0.866365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3059  acetylglutamate kinase  65.36 
 
 		 333 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3312  acetylglutamate kinase  67.5 
 
 		 291 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0257108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3528  acetylglutamate kinase  66.43 
 
 		 290 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3026  acetylglutamate kinase  69.42 
 
 		 336 aa  364  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00309896  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22310  N-acetylglutamate kinase  71.48 
 
 		 338 aa  366  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0338675  normal  0.745589 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1498  acetylglutamate kinase  65.66 
 
 		 310 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1261  acetylglutamate kinase  67.92 
 
 		 296 aa  367  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.101538 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1739  acetylglutamate kinase  64.85 
 
 		 344 aa  363  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2985  acetylglutamate kinase  68.09 
 
 		 290 aa  361  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0890532 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0814  acetylglutamate kinase  64.88 
 
 		 314 aa  360  2e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2055  acetylglutamate kinase  67.38 
 
 		 302 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.340401  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2470  acetylglutamate kinase  67.25 
 
 		 312 aa  357  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1643  acetylglutamate kinase  70.73 
 
 		 335 aa  356  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5469  acetylglutamate kinase  65.73 
 
 		 304 aa  356  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0752137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2029  acetylglutamate kinase  66.1 
 
 		 305 aa  353  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.475963 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2970  acetylglutamate kinase  68.44 
 
 		 290 aa  348  6e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.335314  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3014  acetylglutamate kinase  68.44 
 
 		 290 aa  348  6e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  0.626822 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21720  N-acetylglutamate kinase  62.54 
 
 		 341 aa  341  8e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14400  acetylglutamate kinase  66.22 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0659  acetylglutamate kinase  48.41 
 
 		 299 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0568  acetylglutamate kinase  47.59 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00120396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3613  acetylglutamate kinase  49.64 
 
 		 288 aa  268  8.999999999999999e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.522961  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1906  acetylglutamate kinase  43.31 
 
 		 291 aa  260  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0488998  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0028  acetylglutamate kinase  48.07 
 
 		 297 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0273  acetylglutamate kinase  45.04 
 
 		 287 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0341  acetylglutamate kinase  46.71 
 
 		 305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0225  acetylglutamate kinase  48.08 
 
 		 292 aa  255  7e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21956  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  48.45 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1697  acetylglutamate kinase  44.17 
 
 		 299 aa  253  2.0000000000000002e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2289  acetylglutamate kinase  45.39 
 
 		 287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.99529  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0127  acetylglutamate kinase  41.46 
 
 		 294 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.303702  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0771  acetylglutamate kinase  45.49 
 
 		 298 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0554  acetylglutamate kinase  47.52 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879034  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1162  acetylglutamate kinase  44.97 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.174929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1131  acetylglutamate kinase  44.97 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22020  N-acetylglutamate kinase  45.58 
 
 		 330 aa  250  2e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.869961  decreased coverage  0.00246187 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2288  acetylglutamate kinase  43.94 
 
 		 296 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1152  acetylglutamate kinase  48.23 
 
 		 289 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.749063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1899  acetylglutamate kinase  43.33 
 
 		 304 aa  248  7e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0064  acetylglutamate kinase  46.88 
 
 		 298 aa  248  7e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1101  acetylglutamate kinase  47.22 
 
 		 293 aa  248  9e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.419485  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3560  acetylglutamate kinase  44.29 
 
 		 290 aa  248  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2995  acetylglutamate kinase  43.05 
 
 		 301 aa  247  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0104  acetylglutamate kinase  46.58 
 
 		 295 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1854  acetylglutamate kinase  46.45 
 
 		 296 aa  246  4e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02900  acetylglutamate kinase  46.18 
 
 		 300 aa  246  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  45.39 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0056  acetylglutamate kinase  43.9 
 
 		 304 aa  246  4e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3740  acetylglutamate kinase  47.39 
 
 		 292 aa  245  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1864  acetylglutamate kinase  41.84 
 
 		 304 aa  245  9e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3682  N-acetylglutamate kinase  43.25 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3635  acetylglutamate kinase  47.04 
 
 		 292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  42.71 
 
 		 295 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0464  acetylglutamate kinase  43.34 
 
 		 295 aa  241  7.999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1321  acetylglutamate kinase  45.99 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.463012 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1164  acetylglutamate kinase  44.71 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113745  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02840  acetylglutamate kinase  41.84 
 
 		 290 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00137776  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1351  acetylglutamate kinase  40.28 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4139  acetylglutamate kinase  45.8 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9539  hitchhiker  0.00000200653 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3152  acetylglutamate kinase  44.29 
 
 		 292 aa  240  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1831  acetylglutamate kinase  44.6 
 
 		 284 aa  241  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.242164  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0182  acetylglutamate kinase  44.15 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0306646  hitchhiker  0.000000157401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  41.98 
 
 		 295 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0629  acetylglutamate kinase  44.76 
 
 		 295 aa  239  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.615358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1732  acetylglutamate kinase  45.07 
 
 		 289 aa  239  4e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4380  acetylglutamate kinase  45.49 
 
 		 301 aa  239  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0352  acetylglutamate kinase  46.9 
 
 		 313 aa  239  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281091  normal  0.0894286 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1674  acetylglutamate kinase  47.7 
 
 		 301 aa  239  5.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.437171  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3982  acetylglutamate kinase  44.52 
 
 		 305 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1078  acetylglutamate kinase  42.2 
 
 		 293 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1614  acetylglutamate kinase  41.81 
 
 		 294 aa  238  8e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0568  acetylglutamate kinase  43.62 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0588  acetylglutamate kinase  44.56 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0539  acetylglutamate kinase  39.5 
 
 		 288 aa  238  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000417739  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1203  acetylglutamate kinase  44.95 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815716 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0075  acetylglutamate kinase  41.64 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0084  acetylglutamate kinase  45.08 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1078  acetylglutamate kinase  41.26 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1226  acetylglutamate kinase  45.45 
 
 		 296 aa  237  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0887  acetylglutamate kinase  41.46 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.380786  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5198  acetylglutamate kinase  43.81 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.934726  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52011  predicted protein  44.56 
 
 		 334 aa  236  2e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.367344  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2413  acetylglutamate kinase  45.33 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>