More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5454 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5454  acetylglutamate kinase  100 
 
 		 300 aa  589  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0243823  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25610  acetylglutamate kinase  77.15 
 
 		 308 aa  437  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2401  acetylglutamate kinase  75.27 
 
 		 301 aa  417  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3064  acetylglutamate kinase  76.14 
 
 		 297 aa  412  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0126783  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2371  acetylglutamate kinase  71.03 
 
 		 312 aa  399  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0310065 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1329  acetylglutamate kinase  72.79 
 
 		 355 aa  398  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4129  acetylglutamate kinase  72.32 
 
 		 309 aa  399  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0223345  hitchhiker  0.000007027 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2839  acetylglutamate kinase  68.15 
 
 		 302 aa  393  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0122631  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1883  acetylglutamate kinase  73.59 
 
 		 295 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0336877  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1890  acetylglutamate kinase  71.83 
 
 		 310 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.259504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3059  acetylglutamate kinase  65.75 
 
 		 333 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1498  acetylglutamate kinase  66.56 
 
 		 310 aa  386  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1113  acetylglutamate kinase  69.86 
 
 		 320 aa  384  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.736746 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3159  acetylglutamate kinase  71.48 
 
 		 300 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.553724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2153  acetylglutamate kinase  67.36 
 
 		 298 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1499  acetylglutamate kinase  64.4 
 
 		 319 aa  378  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000529185 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2470  acetylglutamate kinase  70 
 
 		 312 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3528  acetylglutamate kinase  65.64 
 
 		 290 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22310  N-acetylglutamate kinase  72.66 
 
 		 338 aa  373  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0338675  normal  0.745589 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3312  acetylglutamate kinase  66.08 
 
 		 291 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0257108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1643  acetylglutamate kinase  72.7 
 
 		 335 aa  370  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3173  acetylglutamate kinase  64.31 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0759623  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2055  acetylglutamate kinase  65.29 
 
 		 302 aa  363  2e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.340401  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0814  acetylglutamate kinase  65.05 
 
 		 314 aa  363  2e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3026  acetylglutamate kinase  69.64 
 
 		 336 aa  362  6e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00309896  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2985  acetylglutamate kinase  67.14 
 
 		 290 aa  360  1e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0890532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6075  Acetylglutamate kinase  65.97 
 
 		 322 aa  358  7e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11672  acetylglutamate kinase  65.71 
 
 		 294 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000816294  normal  0.866365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5469  acetylglutamate kinase  66.32 
 
 		 304 aa  355  5.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0752137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2029  acetylglutamate kinase  65.99 
 
 		 305 aa  354  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.475963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1739  acetylglutamate kinase  63.96 
 
 		 344 aa  349  4e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2970  acetylglutamate kinase  67.5 
 
 		 290 aa  348  5e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.335314  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3014  acetylglutamate kinase  67.5 
 
 		 290 aa  348  5e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  0.626822 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1261  acetylglutamate kinase  65.49 
 
 		 296 aa  347  2e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.101538 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21720  N-acetylglutamate kinase  63.14 
 
 		 341 aa  345  5e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14400  acetylglutamate kinase  68.14 
 
 		 328 aa  337  9.999999999999999e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0659  acetylglutamate kinase  49.16 
 
 		 299 aa  297  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0568  acetylglutamate kinase  52.41 
 
 		 295 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00120396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0273  acetylglutamate kinase  47.18 
 
 		 287 aa  278  6e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2288  acetylglutamate kinase  49.31 
 
 		 296 aa  276  3e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0341  acetylglutamate kinase  49.83 
 
 		 305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1697  acetylglutamate kinase  45.39 
 
 		 299 aa  268  8e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1831  acetylglutamate kinase  49.12 
 
 		 284 aa  262  4e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.242164  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0771  acetylglutamate kinase  47.81 
 
 		 298 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3152  acetylglutamate kinase  47.8 
 
 		 292 aa  260  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3740  acetylglutamate kinase  47.6 
 
 		 292 aa  259  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3635  acetylglutamate kinase  47.6 
 
 		 292 aa  258  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1864  acetylglutamate kinase  42.81 
 
 		 304 aa  258  8e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0064  acetylglutamate kinase  46.62 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3560  acetylglutamate kinase  46.26 
 
 		 290 aa  256  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05261  acetylglutamate kinase  42.4 
 
 		 283 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.108747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0225  acetylglutamate kinase  47.44 
 
 		 292 aa  256  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21956  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1854  acetylglutamate kinase  46.24 
 
 		 296 aa  255  5e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0500  acetylglutamate kinase  41.7 
 
 		 283 aa  255  6e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2995  acetylglutamate kinase  45.08 
 
 		 301 aa  255  7e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2289  acetylglutamate kinase  45.83 
 
 		 287 aa  255  7e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.99529  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05561  acetylglutamate kinase  42.05 
 
 		 283 aa  254  8e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.91798  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0056  acetylglutamate kinase  46.21 
 
 		 304 aa  254  9e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3682  N-acetylglutamate kinase  45.76 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1162  acetylglutamate kinase  46.15 
 
 		 309 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.174929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0028  acetylglutamate kinase  44.79 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1131  acetylglutamate kinase  46.15 
 
 		 309 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02840  acetylglutamate kinase  43.31 
 
 		 290 aa  253  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00137776  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1906  acetylglutamate kinase  41.7 
 
 		 291 aa  252  5.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0488998  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0127  acetylglutamate kinase  42.86 
 
 		 294 aa  252  6e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.303702  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0554  acetylglutamate kinase  46.59 
 
 		 297 aa  252  7e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879034  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0150  acetylglutamate kinase  47.32 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02900  acetylglutamate kinase  45.18 
 
 		 300 aa  249  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0203  acetylglutamate kinase  48.63 
 
 		 292 aa  249  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512987 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2781  acetylglutamate kinase  47.55 
 
 		 300 aa  249  5e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2911  acetylglutamate kinase  41.58 
 
 		 303 aa  249  5e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1732  acetylglutamate kinase  45.1 
 
 		 289 aa  249  5e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3174  acetylglutamate kinase  46.58 
 
 		 292 aa  248  8e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.696563  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1899  acetylglutamate kinase  45.52 
 
 		 304 aa  248  9e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2413  acetylglutamate kinase  46.21 
 
 		 296 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1078  acetylglutamate kinase  42.96 
 
 		 293 aa  247  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3613  acetylglutamate kinase  48.91 
 
 		 288 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.522961  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22020  N-acetylglutamate kinase  44.11 
 
 		 330 aa  246  2e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.869961  decreased coverage  0.00246187 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1674  acetylglutamate kinase  46.58 
 
 		 301 aa  246  3e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.437171  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0251  acetylglutamate kinase  41.4 
 
 		 279 aa  246  4.9999999999999997e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  43.84 
 
 		 303 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1153  acetylglutamate kinase  42.81 
 
 		 292 aa  245  6e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0296435  hitchhiker  0.00582367 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05631  acetylglutamate kinase  42.76 
 
 		 283 aa  245  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.231229  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0224  acetylglutamate kinase  41.4 
 
 		 279 aa  245  6.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0629  acetylglutamate kinase  45.83 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.615358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0182  acetylglutamate kinase  44.67 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0306646  hitchhiker  0.000000157401 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0277  acetylglutamate kinase  41.05 
 
 		 279 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  44.14 
 
 		 295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1081  acetylglutamate kinase  41.46 
 
 		 280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0152417  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5289  acetylglutamate kinase  44.67 
 
 		 301 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.92163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5198  acetylglutamate kinase  44.67 
 
 		 301 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.934726  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2015  acetylglutamate kinase  47.75 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000238351  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1496  acetylglutamate kinase  44.56 
 
 		 301 aa  243  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1351  acetylglutamate kinase  42.81 
 
 		 283 aa  243  3e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  44.14 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1041  acetylglutamate kinase  42.71 
 
 		 282 aa  242  5e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0274311  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5339  acetylglutamate kinase  44.67 
 
 		 301 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.866501  hitchhiker  0.00605357 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1152  acetylglutamate kinase  46.69 
 
 		 289 aa  242  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.749063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1071  acetylglutamate kinase  42.71 
 
 		 282 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0437011  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3675  acetylglutamate kinase  43.29 
 
 		 300 aa  241  9e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0797606  normal  0.0933841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>