More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0228 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0228  acetylglutamate kinase  100 
 
 
267 aa  530  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.636422  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4275  acetylglutamate kinase  79.69 
 
 
263 aa  412  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000930353  normal  0.309255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0330  acetylglutamate kinase  74.9 
 
 
261 aa  388  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3716  acetylglutamate kinase  72.59 
 
 
260 aa  371  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4094  acetylglutamate kinase  72.97 
 
 
260 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4123  acetylglutamate kinase  72.97 
 
 
260 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4013  acetylglutamate kinase  72.97 
 
 
260 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.673186 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3708  acetylglutamate kinase  74.41 
 
 
260 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4212  acetylglutamate kinase  72.97 
 
 
260 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3904  acetylglutamate kinase  72.59 
 
 
260 aa  371  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.285866 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0276  acetylglutamate kinase  72.2 
 
 
260 aa  368  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0203  acetylglutamate kinase  69.88 
 
 
261 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.515278  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0237  acetylglutamate kinase  74.02 
 
 
260 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0251  acetylglutamate kinase  71.81 
 
 
260 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0192  acetylglutamate kinase  74.22 
 
 
259 aa  361  6e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0257  acetylglutamate kinase  70.47 
 
 
262 aa  343  2e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00042  acetylglutamate kinase  49.43 
 
 
263 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2219  acetylglutamate kinase  49.61 
 
 
262 aa  235  6e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.448521  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002313  acetylglutamate kinase  49.43 
 
 
263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824681  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4250  acetylglutamate kinase  48.41 
 
 
257 aa  227  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.531386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4059  acetylglutamate kinase  48.02 
 
 
257 aa  226  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0196  acetylglutamate kinase  48.41 
 
 
257 aa  226  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4780  acetylglutamate kinase  49.21 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865282 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3918  acetylglutamate kinase  47.22 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0128  acetylglutamate kinase  48.41 
 
 
258 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3897  acetylglutamate kinase  48.41 
 
 
258 aa  218  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4088  acetylglutamate kinase  48.41 
 
 
258 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4363  acetylglutamate kinase  48.02 
 
 
257 aa  214  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4527  acetylglutamate kinase  47.62 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4453  acetylglutamate kinase  47.62 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116052 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4450  acetylglutamate kinase  47.62 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000178281 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4332  acetylglutamate kinase  47.22 
 
 
257 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2757  acetylglutamate kinase  47.24 
 
 
263 aa  210  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4027  acetylglutamate kinase  46.83 
 
 
257 aa  209  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4406  acetylglutamate kinase  46.83 
 
 
257 aa  208  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0773031 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03844  acetylglutamate kinase  46.83 
 
 
257 aa  208  8e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4027  acetylglutamate kinase  46.83 
 
 
258 aa  208  8e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4193  acetylglutamate kinase  46.83 
 
 
257 aa  208  8e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4498  acetylglutamate kinase  46.83 
 
 
257 aa  208  8e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.890825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03793  hypothetical protein  46.83 
 
 
257 aa  208  8e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5419  acetylglutamate kinase  46.83 
 
 
257 aa  208  8e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4057  acetylglutamate kinase  46.83 
 
 
257 aa  208  8e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.650697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4445  acetylglutamate kinase  46.83 
 
 
257 aa  208  8e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0229  acetylglutamate kinase  43.92 
 
 
260 aa  207  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0059376  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0981  acetylglutamate kinase  45.85 
 
 
257 aa  202  7e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.71344  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00531  acetylglutamate kinase  46.88 
 
 
267 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0461  acetylglutamate kinase  40.46 
 
 
260 aa  186  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1081  acetylglutamate kinase  32.7 
 
 
280 aa  120  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0152417  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0128  acetylglutamate kinase  30.5 
 
 
281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0539  acetylglutamate kinase  32.05 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000417739  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2494  acetylglutamate kinase  31.49 
 
 
291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0190  acetylglutamate kinase  35.15 
 
 
260 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04991  acetylglutamate kinase  30.74 
 
 
300 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  31.58 
 
 
292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0256  acetylglutamate kinase  34.51 
 
 
290 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0433  acetylglutamate kinase  34.51 
 
 
290 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.394347  hitchhiker  0.0000000109203 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0579  acetylglutamate kinase  28.46 
 
 
303 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.503767  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0539  acetylglutamate kinase  32.47 
 
 
303 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  33.33 
 
 
295 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  32.61 
 
 
295 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  27.78 
 
 
303 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3479  acetylglutamate kinase  32.47 
 
 
306 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  0.537456 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0568  acetylglutamate kinase  28.46 
 
 
299 aa  106  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0140  acetylglutamate kinase  30.3 
 
 
344 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2865  acetylglutamate kinase  33.2 
 
 
292 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0180  acetylglutamate kinase  30.3 
 
 
309 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3394  acetylglutamate kinase  30.3 
 
 
308 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3297  acetylglutamate kinase  32.25 
 
 
303 aa  106  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0588  acetylglutamate kinase  30.68 
 
 
296 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3717  acetylglutamate kinase  30.3 
 
 
308 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0568  acetylglutamate kinase  30.68 
 
 
301 aa  105  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1730  acetylglutamate kinase  30.11 
 
 
300 aa  105  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0033  acetylglutamate kinase  29.87 
 
 
310 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22020  N-acetylglutamate kinase  31.4 
 
 
330 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.869961  decreased coverage  0.00246187 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2778  acetylglutamate kinase  34.78 
 
 
254 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.616506  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1068  acetylglutamate kinase  32.81 
 
 
293 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0499  acetylglutamate kinase  33.33 
 
 
304 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.600707 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0659  acetylglutamate kinase  30.77 
 
 
299 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1022  acetylglutamate kinase  30.73 
 
 
283 aa  104  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2729  acetylglutamate kinase  32.81 
 
 
293 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  31.3 
 
 
294 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0179  acetylglutamate kinase  32.05 
 
 
295 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.137233  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0352  acetylglutamate kinase  35.19 
 
 
313 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281091  normal  0.0894286 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1164  acetylglutamate kinase  32.05 
 
 
300 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113745  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0945  acetylglutamate kinase  30.17 
 
 
262 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0376196  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1732  acetylglutamate kinase  32.08 
 
 
289 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2296  acetylglutamate kinase  31.93 
 
 
300 aa  103  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.576653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0341  acetylglutamate kinase  29.52 
 
 
305 aa  103  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2013  acetylglutamate kinase  29.87 
 
 
300 aa  102  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3982  acetylglutamate kinase  30.3 
 
 
305 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1203  acetylglutamate kinase  35.65 
 
 
294 aa  102  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815716 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2288  acetylglutamate kinase  31.48 
 
 
296 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4160  acetylglutamate kinase  31.64 
 
 
261 aa  102  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.03818  normal  0.261646 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1326  acetylglutamate kinase  33.21 
 
 
301 aa  102  7e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0773  acetylglutamate kinase  33.33 
 
 
297 aa  102  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0502  acetylglutamate kinase  34.69 
 
 
245 aa  102  7e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0471681  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1641  acetylglutamate kinase  29.52 
 
 
295 aa  102  7e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0273  acetylglutamate kinase  31.8 
 
 
287 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2653  acetylglutamate kinase  30.26 
 
 
289 aa  102  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.485023 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0350  acetylglutamate kinase  34.47 
 
 
254 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000201879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>