More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0539 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0539  acetylglutamate kinase  100 
 
 		 303 aa  605  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0499  acetylglutamate kinase  86.49 
 
 		 304 aa  527  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.600707 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3479  acetylglutamate kinase  85.76 
 
 		 306 aa  524  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  0.537456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3982  acetylglutamate kinase  85.25 
 
 		 305 aa  524  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1321  acetylglutamate kinase  85.71 
 
 		 296 aa  511  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.463012 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3524  acetylglutamate kinase  84.69 
 
 		 296 aa  511  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0568  acetylglutamate kinase  84 
 
 		 301 aa  513  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4139  acetylglutamate kinase  85.71 
 
 		 296 aa  511  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9539  hitchhiker  0.00000200653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0588  acetylglutamate kinase  85.03 
 
 		 296 aa  508  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0773  acetylglutamate kinase  83.5 
 
 		 297 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1226  acetylglutamate kinase  83.79 
 
 		 296 aa  497  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3717  acetylglutamate kinase  76.33 
 
 		 308 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3394  acetylglutamate kinase  76.33 
 
 		 308 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0033  acetylglutamate kinase  75.67 
 
 		 310 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0338  acetylglutamate kinase  76.61 
 
 		 299 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0064  acetylglutamate kinase  76.35 
 
 		 299 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4385  acetylglutamate kinase  76.61 
 
 		 299 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614022  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3249  acetylglutamate kinase  74.59 
 
 		 299 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219346  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0380  acetylglutamate kinase  74.59 
 
 		 351 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.734124  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2910  acetylglutamate kinase  74.59 
 
 		 351 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.290051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0160  acetylglutamate kinase  74.26 
 
 		 355 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2179  acetylglutamate kinase  74.59 
 
 		 351 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0140  acetylglutamate kinase  73.33 
 
 		 344 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0195  acetylglutamate kinase  74.59 
 
 		 299 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0185  acetylglutamate kinase  74.59 
 
 		 351 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.651482  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3438  acetylglutamate kinase  74.59 
 
 		 299 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3092  acetylglutamate kinase  74.92 
 
 		 321 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.144382 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0180  acetylglutamate kinase  75.79 
 
 		 309 aa  448  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3005  acetylglutamate kinase  74.59 
 
 		 299 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.68107 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6447  acetylglutamate kinase  74.59 
 
 		 299 aa  448  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.635335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3112  acetylglutamate kinase  74.59 
 
 		 299 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.421465 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2482  acetylglutamate kinase  74.59 
 
 		 321 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753356  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3143  acetylglutamate kinase  74.59 
 
 		 344 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.537624  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3096  acetylglutamate kinase  74.59 
 
 		 321 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0983385  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2013  acetylglutamate kinase  74.83 
 
 		 300 aa  447  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1730  acetylglutamate kinase  74.25 
 
 		 300 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0629  acetylglutamate kinase  68.42 
 
 		 295 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.615358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  66.44 
 
 		 294 aa  388  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1164  acetylglutamate kinase  68.42 
 
 		 300 aa  384  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113745  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1116  acetylglutamate kinase  63.01 
 
 		 293 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0084  acetylglutamate kinase  60.8 
 
 		 304 aa  354  1e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0179  acetylglutamate kinase  60.34 
 
 		 295 aa  348  5e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.137233  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2296  acetylglutamate kinase  58.69 
 
 		 300 aa  347  1e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.576653  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3675  acetylglutamate kinase  58.56 
 
 		 300 aa  343  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0797606  normal  0.0933841 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0104  acetylglutamate kinase  59.45 
 
 		 295 aa  341  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2781  acetylglutamate kinase  60.64 
 
 		 300 aa  340  2e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1899  acetylglutamate kinase  57.58 
 
 		 304 aa  338  4e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02900  acetylglutamate kinase  58.25 
 
 		 300 aa  338  8e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5289  acetylglutamate kinase  59.04 
 
 		 301 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.92163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5198  acetylglutamate kinase  59.04 
 
 		 301 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.934726  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5339  acetylglutamate kinase  59.04 
 
 		 301 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.866501  hitchhiker  0.00605357 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2686  N-acetylglutamate kinase  59.17 
 
 		 293 aa  335  5e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  58.74 
 
 		 292 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0182  acetylglutamate kinase  58.36 
 
 		 301 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0306646  hitchhiker  0.000000157401 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2995  acetylglutamate kinase  57.53 
 
 		 301 aa  331  1e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4380  acetylglutamate kinase  58.36 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0433  acetylglutamate kinase  59.22 
 
 		 290 aa  329  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.394347  hitchhiker  0.0000000109203 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0256  acetylglutamate kinase  59.22 
 
 		 290 aa  329  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0082  acetylglutamate kinase  57.24 
 
 		 301 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0218  acetylglutamate kinase  57.24 
 
 		 301 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  56.45 
 
 		 303 aa  328  5.0000000000000004e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6099  acetylglutamate kinase  57.24 
 
 		 301 aa  328  8e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780503  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70280  acetylglutamate kinase  57.24 
 
 		 301 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5543  acetylglutamate kinase  57 
 
 		 301 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0621  acetylglutamate kinase  55.59 
 
 		 302 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000196007 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3560  acetylglutamate kinase  57.89 
 
 		 290 aa  325  7e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0579  acetylglutamate kinase  55.75 
 
 		 303 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.503767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0568  acetylglutamate kinase  55.75 
 
 		 299 aa  312  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2413  acetylglutamate kinase  52.98 
 
 		 296 aa  309  5e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2984  N-acetylglutamate kinase  54.79 
 
 		 306 aa  308  6.999999999999999e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.492788  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0064  acetylglutamate kinase  53.15 
 
 		 298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0225  acetylglutamate kinase  53.68 
 
 		 292 aa  301  6.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21956  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2494  acetylglutamate kinase  52.48 
 
 		 291 aa  300  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3740  acetylglutamate kinase  50.17 
 
 		 292 aa  295  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0150  acetylglutamate kinase  51.93 
 
 		 292 aa  295  7e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3635  acetylglutamate kinase  50.17 
 
 		 292 aa  295  9e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0352  acetylglutamate kinase  50 
 
 		 313 aa  292  5e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281091  normal  0.0894286 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2288  acetylglutamate kinase  49.48 
 
 		 296 aa  291  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0203  acetylglutamate kinase  50.7 
 
 		 292 aa  290  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512987 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0341  acetylglutamate kinase  50.17 
 
 		 305 aa  288  7e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3174  acetylglutamate kinase  48.95 
 
 		 292 aa  286  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.696563  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3682  N-acetylglutamate kinase  49.65 
 
 		 294 aa  286  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2143  acetylglutamate kinase  50.17 
 
 		 336 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3297  acetylglutamate kinase  50.34 
 
 		 303 aa  283  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0415  acetylglutamate kinase  48.97 
 
 		 299 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0188997  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2289  acetylglutamate kinase  48.28 
 
 		 287 aa  282  4.0000000000000003e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.99529  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3095  acetylglutamate kinase  51.23 
 
 		 302 aa  282  5.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0568  acetylglutamate kinase  49.32 
 
 		 295 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00120396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3341  acetylglutamate kinase  54.86 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1078  acetylglutamate kinase  48.95 
 
 		 294 aa  279  4e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0633  acetylglutamate kinase  49.82 
 
 		 285 aa  277  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02840  acetylglutamate kinase  48.25 
 
 		 290 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00137776  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0273  acetylglutamate kinase  47.95 
 
 		 287 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0659  acetylglutamate kinase  48.07 
 
 		 299 aa  275  5e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0550  acetylglutamate kinase  47.54 
 
 		 292 aa  275  6e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0127  acetylglutamate kinase  45.8 
 
 		 294 aa  275  6e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.303702  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1864  acetylglutamate kinase  48.59 
 
 		 304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2015  acetylglutamate kinase  49.3 
 
 		 295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000238351  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1906  acetylglutamate kinase  47.4 
 
 		 291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0488998  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3152  acetylglutamate kinase  48.07 
 
 		 292 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>