More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0981 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0981  acetylglutamate kinase  100 
 
 		 257 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.71344  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00531  acetylglutamate kinase  59.83 
 
 		 267 aa  248  9e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4250  acetylglutamate kinase  50.39 
 
 		 257 aa  245  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.531386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4059  acetylglutamate kinase  50.39 
 
 		 257 aa  244  6.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0196  acetylglutamate kinase  50.78 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3918  acetylglutamate kinase  50.78 
 
 		 257 aa  237  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00042  acetylglutamate kinase  51.17 
 
 		 263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2757  acetylglutamate kinase  49.41 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4363  acetylglutamate kinase  49.61 
 
 		 257 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4332  acetylglutamate kinase  49.22 
 
 		 257 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4527  acetylglutamate kinase  49.22 
 
 		 257 aa  228  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4453  acetylglutamate kinase  49.22 
 
 		 257 aa  228  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116052 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4450  acetylglutamate kinase  49.22 
 
 		 257 aa  228  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178281 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4780  acetylglutamate kinase  50.78 
 
 		 257 aa  228  8e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865282 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4027  acetylglutamate kinase  48.83 
 
 		 257 aa  227  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2219  acetylglutamate kinase  49.03 
 
 		 262 aa  226  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.448521  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0203  acetylglutamate kinase  49.21 
 
 		 261 aa  226  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.515278  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4275  acetylglutamate kinase  49.22 
 
 		 263 aa  226  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000930353  normal  0.309255 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0128  acetylglutamate kinase  50.2 
 
 		 258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3897  acetylglutamate kinase  50.2 
 
 		 258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4088  acetylglutamate kinase  50.2 
 
 		 258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03844  acetylglutamate kinase  49.22 
 
 		 257 aa  225  6e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4027  acetylglutamate kinase  49.22 
 
 		 258 aa  225  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4498  acetylglutamate kinase  49.22 
 
 		 257 aa  225  6e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.890825  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4193  acetylglutamate kinase  49.22 
 
 		 257 aa  225  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5419  acetylglutamate kinase  49.22 
 
 		 257 aa  225  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4057  acetylglutamate kinase  49.22 
 
 		 257 aa  225  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.650697 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03793  hypothetical protein  49.22 
 
 		 257 aa  225  6e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002313  acetylglutamate kinase  49.61 
 
 		 263 aa  225  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824681  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4445  acetylglutamate kinase  49.22 
 
 		 257 aa  225  6e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4406  acetylglutamate kinase  50.19 
 
 		 257 aa  224  8e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0773031 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0229  acetylglutamate kinase  48.64 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0059376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0330  acetylglutamate kinase  48.83 
 
 		 261 aa  221  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0461  acetylglutamate kinase  50.39 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0228  acetylglutamate kinase  45.85 
 
 		 267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.636422  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3716  acetylglutamate kinase  47.04 
 
 		 260 aa  208  5e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0276  acetylglutamate kinase  46.64 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3708  acetylglutamate kinase  47.04 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0237  acetylglutamate kinase  47.04 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3904  acetylglutamate kinase  46.25 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.285866 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4094  acetylglutamate kinase  46.25 
 
 		 260 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4123  acetylglutamate kinase  46.25 
 
 		 260 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4013  acetylglutamate kinase  46.25 
 
 		 260 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.673186 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4212  acetylglutamate kinase  46.25 
 
 		 260 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0251  acetylglutamate kinase  46.25 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0192  acetylglutamate kinase  45.45 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0257  acetylglutamate kinase  47.24 
 
 		 262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0179  acetylglutamate kinase  37.78 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.137233  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  36.98 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0190  acetylglutamate kinase  38.58 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  33.62 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0633  acetylglutamate kinase  35.68 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3005  acetylglutamate kinase  33.33 
 
 		 299 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.68107 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0738  acetylglutamate kinase  35.77 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0640766  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3143  acetylglutamate kinase  33.33 
 
 		 344 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.537624  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0579  acetylglutamate kinase  32.33 
 
 		 303 aa  121  9e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.503767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1899  acetylglutamate kinase  33.09 
 
 		 304 aa  121  9e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0568  acetylglutamate kinase  33.08 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3249  acetylglutamate kinase  32.95 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219346  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0773  acetylglutamate kinase  36.09 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6447  acetylglutamate kinase  32.95 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.635335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3438  acetylglutamate kinase  32.95 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0195  acetylglutamate kinase  32.95 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2482  acetylglutamate kinase  32.95 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3096  acetylglutamate kinase  32.95 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0983385  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3112  acetylglutamate kinase  32.95 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.421465 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0568  acetylglutamate kinase  36.47 
 
 		 301 aa  119  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0380  acetylglutamate kinase  32.95 
 
 		 351 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.734124  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0499  acetylglutamate kinase  35.07 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.600707 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2179  acetylglutamate kinase  32.95 
 
 		 351 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0185  acetylglutamate kinase  32.95 
 
 		 351 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.651482  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2910  acetylglutamate kinase  32.95 
 
 		 351 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.290051  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0588  acetylglutamate kinase  36.47 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0160  acetylglutamate kinase  32.95 
 
 		 355 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1730  acetylglutamate kinase  32.95 
 
 		 300 aa  119  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2296  acetylglutamate kinase  34.08 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.576653  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3092  acetylglutamate kinase  32.58 
 
 		 321 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.144382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0338  acetylglutamate kinase  32.58 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0464  acetylglutamate kinase  33.09 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0539  acetylglutamate kinase  31.03 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000417739  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4385  acetylglutamate kinase  32.58 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0380  acetylglutamate kinase  33.46 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0629  acetylglutamate kinase  35.06 
 
 		 295 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.615358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1226  acetylglutamate kinase  35.71 
 
 		 296 aa  116  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0180  acetylglutamate kinase  31.82 
 
 		 309 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4139  acetylglutamate kinase  35.34 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9539  hitchhiker  0.00000200653 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0064  acetylglutamate kinase  32.58 
 
 		 299 aa  115  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1595  acetylglutamate kinase  37.29 
 
 		 258 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3479  acetylglutamate kinase  35.71 
 
 		 306 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  0.537456 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2995  acetylglutamate kinase  32.34 
 
 		 301 aa  115  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  33.46 
 
 		 295 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2013  acetylglutamate kinase  31.82 
 
 		 300 aa  115  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3297  acetylglutamate kinase  33.84 
 
 		 303 aa  115  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  34.47 
 
 		 294 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0104  acetylglutamate kinase  35.42 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0140  acetylglutamate kinase  31.44 
 
 		 344 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0301  acetylglutamate kinase  35.68 
 
 		 286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.84379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0352  acetylglutamate kinase  34.12 
 
 		 313 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281091  normal  0.0894286 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3982  acetylglutamate kinase  35.71 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0539  acetylglutamate kinase  34.59 
 
 		 303 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>