More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0196 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0196  acetylglutamate kinase  100 
 
 
257 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3918  acetylglutamate kinase  93.77 
 
 
257 aa  475  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4059  acetylglutamate kinase  93 
 
 
257 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4250  acetylglutamate kinase  92.61 
 
 
257 aa  472  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.531386  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4780  acetylglutamate kinase  89.49 
 
 
257 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865282 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0128  acetylglutamate kinase  85.1 
 
 
258 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3897  acetylglutamate kinase  85.1 
 
 
258 aa  426  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4088  acetylglutamate kinase  85.1 
 
 
258 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03844  acetylglutamate kinase  85.21 
 
 
257 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4027  acetylglutamate kinase  85.21 
 
 
258 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4445  acetylglutamate kinase  85.21 
 
 
257 aa  415  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03793  hypothetical protein  85.21 
 
 
257 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4193  acetylglutamate kinase  85.21 
 
 
257 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5419  acetylglutamate kinase  85.21 
 
 
257 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4498  acetylglutamate kinase  85.21 
 
 
257 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.890825  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4057  acetylglutamate kinase  85.21 
 
 
257 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.650697 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4027  acetylglutamate kinase  84.82 
 
 
257 aa  416  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4406  acetylglutamate kinase  85.21 
 
 
257 aa  413  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0773031 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4453  acetylglutamate kinase  84.05 
 
 
257 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116052 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4450  acetylglutamate kinase  84.05 
 
 
257 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000178281 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4527  acetylglutamate kinase  84.05 
 
 
257 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4332  acetylglutamate kinase  84.05 
 
 
257 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4363  acetylglutamate kinase  84.05 
 
 
257 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2219  acetylglutamate kinase  61.33 
 
 
262 aa  305  5.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.448521  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2757  acetylglutamate kinase  59.29 
 
 
263 aa  293  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00042  acetylglutamate kinase  57.48 
 
 
263 aa  282  4.0000000000000003e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002313  acetylglutamate kinase  57.48 
 
 
263 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824681  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0229  acetylglutamate kinase  52.34 
 
 
260 aa  260  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0059376  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0981  acetylglutamate kinase  50.78 
 
 
257 aa  230  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.71344  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0251  acetylglutamate kinase  48.02 
 
 
260 aa  226  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0203  acetylglutamate kinase  47.43 
 
 
261 aa  226  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.515278  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0228  acetylglutamate kinase  48.41 
 
 
267 aa  226  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.636422  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0192  acetylglutamate kinase  49.21 
 
 
259 aa  225  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0330  acetylglutamate kinase  48.41 
 
 
261 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4275  acetylglutamate kinase  46.06 
 
 
263 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000930353  normal  0.309255 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0237  acetylglutamate kinase  46.27 
 
 
260 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4013  acetylglutamate kinase  47.22 
 
 
260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.673186 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4212  acetylglutamate kinase  47.22 
 
 
260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4094  acetylglutamate kinase  47.22 
 
 
260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4123  acetylglutamate kinase  47.22 
 
 
260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3708  acetylglutamate kinase  45.88 
 
 
260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3716  acetylglutamate kinase  46.43 
 
 
260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3904  acetylglutamate kinase  45.49 
 
 
260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.285866 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0461  acetylglutamate kinase  44.71 
 
 
260 aa  212  5.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0276  acetylglutamate kinase  45.49 
 
 
260 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0257  acetylglutamate kinase  45.24 
 
 
262 aa  202  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00531  acetylglutamate kinase  47.88 
 
 
267 aa  192  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22020  N-acetylglutamate kinase  37.89 
 
 
330 aa  139  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.869961  decreased coverage  0.00246187 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4240  acetylglutamate kinase  39.01 
 
 
255 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0633  acetylglutamate kinase  36.17 
 
 
285 aa  133  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02900  acetylglutamate kinase  34.75 
 
 
300 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0058  acetylglutamate kinase  37.55 
 
 
244 aa  129  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0190  acetylglutamate kinase  36.86 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3963  acetylglutamate kinase  37.22 
 
 
255 aa  129  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00282124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4201  acetylglutamate kinase  36.48 
 
 
255 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4038  acetylglutamate kinase  37.67 
 
 
255 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4353  acetylglutamate kinase  37.67 
 
 
255 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.783439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4154  acetylglutamate kinase  37.67 
 
 
255 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0179  acetylglutamate kinase  34.27 
 
 
295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.137233  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0327  acetylglutamate kinase  35.11 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4380  acetylglutamate kinase  33.9 
 
 
301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3885  acetylglutamate kinase  33.99 
 
 
255 aa  125  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1041  acetylglutamate kinase  35.11 
 
 
282 aa  125  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0274311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4264  acetylglutamate kinase  35.19 
 
 
255 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5289  acetylglutamate kinase  34.32 
 
 
301 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.92163 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  34.19 
 
 
292 aa  125  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5198  acetylglutamate kinase  34.32 
 
 
301 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.934726  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1071  acetylglutamate kinase  35.11 
 
 
282 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0437011  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5339  acetylglutamate kinase  34.32 
 
 
301 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.866501  hitchhiker  0.00605357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0182  acetylglutamate kinase  34.32 
 
 
301 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0306646  hitchhiker  0.000000157401 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0996  acetylglutamate kinase  35.43 
 
 
255 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0104  acetylglutamate kinase  33.58 
 
 
295 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70280  acetylglutamate kinase  33.9 
 
 
301 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6099  acetylglutamate kinase  33.9 
 
 
301 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780503  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5543  acetylglutamate kinase  33.47 
 
 
301 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0082  acetylglutamate kinase  32.21 
 
 
301 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0218  acetylglutamate kinase  32.21 
 
 
301 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0945  acetylglutamate kinase  35.32 
 
 
262 aa  121  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0376196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3877  acetylglutamate kinase  37.07 
 
 
236 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0352  acetylglutamate kinase  38.5 
 
 
313 aa  121  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281091  normal  0.0894286 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1595  acetylglutamate kinase  38.74 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  33.06 
 
 
294 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0568  acetylglutamate kinase  32.84 
 
 
299 aa  120  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2995  acetylglutamate kinase  34.75 
 
 
301 aa  119  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2013  acetylglutamate kinase  30.61 
 
 
300 aa  118  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2494  acetylglutamate kinase  32.72 
 
 
291 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0579  acetylglutamate kinase  32.84 
 
 
303 aa  118  9e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.503767  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2984  N-acetylglutamate kinase  30.93 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.492788  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0180  acetylglutamate kinase  30.61 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1116  acetylglutamate kinase  35.04 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0140  acetylglutamate kinase  30.61 
 
 
344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1730  acetylglutamate kinase  30.2 
 
 
300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1101  acetylglutamate kinase  35.19 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.419485  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0738  acetylglutamate kinase  34.65 
 
 
257 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0640766  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3675  acetylglutamate kinase  30.97 
 
 
300 aa  115  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0797606  normal  0.0933841 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  30.83 
 
 
303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2288  acetylglutamate kinase  36.17 
 
 
296 aa  115  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2296  acetylglutamate kinase  32.09 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.576653  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0500  acetylglutamate kinase  32.95 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3394  acetylglutamate kinase  30.2 
 
 
308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>