More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0192 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0192  acetylglutamate kinase  100 
 
 		 259 aa  508  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0251  acetylglutamate kinase  88.33 
 
 		 260 aa  450  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4212  acetylglutamate kinase  81.71 
 
 		 260 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3716  acetylglutamate kinase  81.71 
 
 		 260 aa  411  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4013  acetylglutamate kinase  81.71 
 
 		 260 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.673186 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4094  acetylglutamate kinase  81.71 
 
 		 260 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4123  acetylglutamate kinase  81.71 
 
 		 260 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3708  acetylglutamate kinase  81.71 
 
 		 260 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0237  acetylglutamate kinase  81.32 
 
 		 260 aa  408  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3904  acetylglutamate kinase  81.32 
 
 		 260 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.285866 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0276  acetylglutamate kinase  81.32 
 
 		 260 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4275  acetylglutamate kinase  77.04 
 
 		 263 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000930353  normal  0.309255 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0203  acetylglutamate kinase  75.58 
 
 		 261 aa  391  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.515278  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0330  acetylglutamate kinase  75.1 
 
 		 261 aa  386  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0228  acetylglutamate kinase  74.22 
 
 		 267 aa  376  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.636422  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0257  acetylglutamate kinase  76.26 
 
 		 262 aa  371  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2219  acetylglutamate kinase  51.95 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.448521  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4250  acetylglutamate kinase  51.19 
 
 		 257 aa  240  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.531386  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00042  acetylglutamate kinase  50.39 
 
 		 263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4059  acetylglutamate kinase  50.79 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002313  acetylglutamate kinase  50.39 
 
 		 263 aa  238  8e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824681  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3918  acetylglutamate kinase  50.99 
 
 		 257 aa  233  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0196  acetylglutamate kinase  49.21 
 
 		 257 aa  232  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4088  acetylglutamate kinase  50.79 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3897  acetylglutamate kinase  50.79 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0128  acetylglutamate kinase  50.79 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4453  acetylglutamate kinase  50.4 
 
 		 257 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116052 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4527  acetylglutamate kinase  50.4 
 
 		 257 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4450  acetylglutamate kinase  50.4 
 
 		 257 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178281 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4363  acetylglutamate kinase  50.4 
 
 		 257 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4332  acetylglutamate kinase  50.4 
 
 		 257 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4780  acetylglutamate kinase  51.19 
 
 		 257 aa  225  7e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865282 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4027  acetylglutamate kinase  49.21 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03844  acetylglutamate kinase  49.21 
 
 		 257 aa  221  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4057  acetylglutamate kinase  49.21 
 
 		 257 aa  221  7e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.650697 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4193  acetylglutamate kinase  49.21 
 
 		 257 aa  221  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4406  acetylglutamate kinase  49.21 
 
 		 257 aa  221  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0773031 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5419  acetylglutamate kinase  49.21 
 
 		 257 aa  221  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4445  acetylglutamate kinase  49.21 
 
 		 257 aa  221  7e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03793  hypothetical protein  49.21 
 
 		 257 aa  221  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4498  acetylglutamate kinase  49.21 
 
 		 257 aa  221  7e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.890825  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4027  acetylglutamate kinase  49.21 
 
 		 258 aa  221  8e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2757  acetylglutamate kinase  49.61 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0229  acetylglutamate kinase  44.44 
 
 		 260 aa  201  8e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0059376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00531  acetylglutamate kinase  47.84 
 
 		 267 aa  198  7.999999999999999e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0461  acetylglutamate kinase  43.48 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0981  acetylglutamate kinase  45.45 
 
 		 257 aa  188  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.71344  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0190  acetylglutamate kinase  36.77 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0539  acetylglutamate kinase  32.47 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000417739  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1081  acetylglutamate kinase  34.68 
 
 		 280 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0152417  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0154  acetylglutamate kinase  32.71 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0128  acetylglutamate kinase  32.14 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0075  acetylglutamate kinase  36.02 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0071  acetylglutamate kinase  35.59 
 
 		 291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.945463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  34.8 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0633  acetylglutamate kinase  32.16 
 
 		 285 aa  108  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  36.02 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4160  acetylglutamate kinase  31.76 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.03818  normal  0.261646 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04991  acetylglutamate kinase  34.4 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0352  acetylglutamate kinase  37.56 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281091  normal  0.0894286 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52011  predicted protein  34.39 
 
 		 334 aa  104  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.367344  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  31.02 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1090  acetylglutamate kinase  31.3 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.171552  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4240  acetylglutamate kinase  32.54 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1496  acetylglutamate kinase  32.29 
 
 		 301 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1831  acetylglutamate kinase  32.06 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.242164  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2653  acetylglutamate kinase  31.23 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.485023 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1641  acetylglutamate kinase  32.22 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4264  acetylglutamate kinase  33.33 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0539  acetylglutamate kinase  29.92 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2288  acetylglutamate kinase  30.51 
 
 		 296 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0273  acetylglutamate kinase  34.35 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0854  acetylglutamate kinase  30.23 
 
 		 283 aa  102  8e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.277534  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0056  acetylglutamate kinase  32.48 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0502  acetylglutamate kinase  33.62 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0471681  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05571  acetylglutamate kinase  32.74 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0678457  normal  0.267137 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22020  N-acetylglutamate kinase  32.16 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.869961  decreased coverage  0.00246187 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3885  acetylglutamate kinase  32.54 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3963  acetylglutamate kinase  33.03 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00282124  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00349  acetylglutamate kinase  33.63 
 
 		 447 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0844355  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2726  acetylglutamate kinase  31.42 
 
 		 442 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1203  acetylglutamate kinase  36.28 
 
 		 294 aa  99.8  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815716 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4038  acetylglutamate kinase  33.49 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4353  acetylglutamate kinase  33.49 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.783439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0996  acetylglutamate kinase  33.33 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2865  acetylglutamate kinase  33.03 
 
 		 292 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4154  acetylglutamate kinase  33.49 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4201  acetylglutamate kinase  32.94 
 
 		 255 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2143  acetylglutamate kinase  31.51 
 
 		 336 aa  99.4  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3717  acetylglutamate kinase  27.87 
 
 		 308 aa  99.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0464  acetylglutamate kinase  34.75 
 
 		 295 aa  99.4  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3394  acetylglutamate kinase  27.87 
 
 		 308 aa  99.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1832  acetylglutamate kinase  32.29 
 
 		 304 aa  99.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.913533  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2778  acetylglutamate kinase  32.89 
 
 		 254 aa  99  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.616506  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1730  acetylglutamate kinase  30.23 
 
 		 300 aa  99  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3330  acetylglutamate kinase  33.78 
 
 		 305 aa  99  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1116  acetylglutamate kinase  30.2 
 
 		 293 aa  99  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  27.31 
 
 		 303 aa  99  7e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2494  acetylglutamate kinase  28.57 
 
 		 291 aa  98.6  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3230  acetylglutamate kinase  30.17 
 
 		 294 aa  98.6  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>