More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0251 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0251  acetylglutamate kinase  100 
 
 		 260 aa  511  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0192  acetylglutamate kinase  88.33 
 
 		 259 aa  433  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3708  acetylglutamate kinase  81.15 
 
 		 260 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0237  acetylglutamate kinase  80.77 
 
 		 260 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3716  acetylglutamate kinase  80.77 
 
 		 260 aa  413  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3904  acetylglutamate kinase  80.77 
 
 		 260 aa  413  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.285866 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0276  acetylglutamate kinase  80.38 
 
 		 260 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4013  acetylglutamate kinase  80 
 
 		 260 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.673186 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4123  acetylglutamate kinase  80 
 
 		 260 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4212  acetylglutamate kinase  80 
 
 		 260 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4094  acetylglutamate kinase  80 
 
 		 260 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0203  acetylglutamate kinase  75.38 
 
 		 261 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.515278  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4275  acetylglutamate kinase  75 
 
 		 263 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000930353  normal  0.309255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0330  acetylglutamate kinase  71.92 
 
 		 261 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0228  acetylglutamate kinase  71.81 
 
 		 267 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.636422  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0257  acetylglutamate kinase  74.23 
 
 		 262 aa  362  3e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2219  acetylglutamate kinase  52.67 
 
 		 262 aa  249  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.448521  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00042  acetylglutamate kinase  51.55 
 
 		 263 aa  248  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002313  acetylglutamate kinase  51.94 
 
 		 263 aa  247  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824681  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4250  acetylglutamate kinase  49.6 
 
 		 257 aa  231  7.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.531386  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4363  acetylglutamate kinase  51.59 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4059  acetylglutamate kinase  49.21 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4453  acetylglutamate kinase  51.59 
 
 		 257 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116052 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4450  acetylglutamate kinase  51.59 
 
 		 257 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178281 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4527  acetylglutamate kinase  51.59 
 
 		 257 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3918  acetylglutamate kinase  50.59 
 
 		 257 aa  229  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4332  acetylglutamate kinase  51.59 
 
 		 257 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2757  acetylglutamate kinase  49.43 
 
 		 263 aa  226  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0196  acetylglutamate kinase  48.02 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4780  acetylglutamate kinase  51.19 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865282 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4027  acetylglutamate kinase  50 
 
 		 258 aa  222  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4406  acetylglutamate kinase  50 
 
 		 257 aa  222  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0773031 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4027  acetylglutamate kinase  50 
 
 		 257 aa  222  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03844  acetylglutamate kinase  50 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4445  acetylglutamate kinase  50 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03793  hypothetical protein  50 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5419  acetylglutamate kinase  50 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4498  acetylglutamate kinase  50 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.890825  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4057  acetylglutamate kinase  50 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.650697 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4193  acetylglutamate kinase  50 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4088  acetylglutamate kinase  49.6 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3897  acetylglutamate kinase  49.6 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0128  acetylglutamate kinase  49.6 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0229  acetylglutamate kinase  46.83 
 
 		 260 aa  211  7.999999999999999e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0059376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00531  acetylglutamate kinase  48.24 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0461  acetylglutamate kinase  44.27 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0981  acetylglutamate kinase  46.25 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.71344  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0190  acetylglutamate kinase  37.1 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  34.07 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1081  acetylglutamate kinase  33.94 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0152417  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  33.33 
 
 		 295 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0075  acetylglutamate kinase  35.44 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0128  acetylglutamate kinase  32.59 
 
 		 281 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22020  N-acetylglutamate kinase  34.98 
 
 		 330 aa  108  8.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.869961  decreased coverage  0.00246187 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0539  acetylglutamate kinase  32.16 
 
 		 288 aa  107  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000417739  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  33.95 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0071  acetylglutamate kinase  34.75 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.945463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4240  acetylglutamate kinase  33.2 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0154  acetylglutamate kinase  32.33 
 
 		 289 aa  106  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2910  acetylglutamate kinase  30.22 
 
 		 351 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.290051  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3249  acetylglutamate kinase  30.22 
 
 		 299 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219346  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0185  acetylglutamate kinase  30.22 
 
 		 351 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.651482  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0380  acetylglutamate kinase  30.22 
 
 		 351 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.734124  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2179  acetylglutamate kinase  30.22 
 
 		 351 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0160  acetylglutamate kinase  30.22 
 
 		 355 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3438  acetylglutamate kinase  30.22 
 
 		 299 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0195  acetylglutamate kinase  30.22 
 
 		 299 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0633  acetylglutamate kinase  31.72 
 
 		 285 aa  105  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0996  acetylglutamate kinase  32.17 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1351  acetylglutamate kinase  32.3 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3092  acetylglutamate kinase  30.22 
 
 		 321 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.144382 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3963  acetylglutamate kinase  32.82 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00282124  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52011  predicted protein  34.84 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.367344  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4160  acetylglutamate kinase  33.47 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.03818  normal  0.261646 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0464  acetylglutamate kinase  34.6 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1326  acetylglutamate kinase  36.89 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2013  acetylglutamate kinase  29.48 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0854  acetylglutamate kinase  31.01 
 
 		 283 aa  102  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.277534  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0064  acetylglutamate kinase  29.85 
 
 		 299 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207968  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4038  acetylglutamate kinase  33.94 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0179  acetylglutamate kinase  30.34 
 
 		 295 aa  102  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.137233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4353  acetylglutamate kinase  33.94 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.783439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4154  acetylglutamate kinase  33.94 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3143  acetylglutamate kinase  29.85 
 
 		 344 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.537624  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3005  acetylglutamate kinase  29.85 
 
 		 299 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.68107 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1090  acetylglutamate kinase  32.17 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.171552  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1496  acetylglutamate kinase  32.29 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4385  acetylglutamate kinase  29.85 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0338  acetylglutamate kinase  29.85 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4264  acetylglutamate kinase  33.2 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3112  acetylglutamate kinase  29.85 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.421465 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6447  acetylglutamate kinase  29.85 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.635335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2482  acetylglutamate kinase  29.85 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3096  acetylglutamate kinase  29.85 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0983385  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2143  acetylglutamate kinase  32.49 
 
 		 336 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04991  acetylglutamate kinase  33.49 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0380  acetylglutamate kinase  34.3 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05571  acetylglutamate kinase  31.39 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0678457  normal  0.267137 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0859  acetylglutamate kinase  34.7 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0273  acetylglutamate kinase  33.48 
 
 		 287 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>