More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0330 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0330  acetylglutamate kinase  100 
 
 
261 aa  512  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4275  acetylglutamate kinase  83.08 
 
 
263 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000930353  normal  0.309255 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3904  acetylglutamate kinase  75.38 
 
 
260 aa  394  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.285866 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0276  acetylglutamate kinase  74.62 
 
 
260 aa  390  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3716  acetylglutamate kinase  75 
 
 
260 aa  391  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4212  acetylglutamate kinase  75 
 
 
260 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0203  acetylglutamate kinase  72.41 
 
 
261 aa  391  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.515278  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4094  acetylglutamate kinase  75 
 
 
260 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4013  acetylglutamate kinase  75 
 
 
260 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.673186 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3708  acetylglutamate kinase  74.62 
 
 
260 aa  391  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4123  acetylglutamate kinase  75 
 
 
260 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0237  acetylglutamate kinase  74.23 
 
 
260 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0228  acetylglutamate kinase  74.9 
 
 
267 aa  388  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.636422  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0251  acetylglutamate kinase  71.92 
 
 
260 aa  376  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0192  acetylglutamate kinase  75.1 
 
 
259 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0257  acetylglutamate kinase  72.8 
 
 
262 aa  363  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00042  acetylglutamate kinase  51.33 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002313  acetylglutamate kinase  50.57 
 
 
263 aa  238  8e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824681  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2219  acetylglutamate kinase  50 
 
 
262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.448521  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3918  acetylglutamate kinase  50.99 
 
 
257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4250  acetylglutamate kinase  50.79 
 
 
257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.531386  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4363  acetylglutamate kinase  51.18 
 
 
257 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4059  acetylglutamate kinase  50.4 
 
 
257 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4453  acetylglutamate kinase  50.79 
 
 
257 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116052 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4527  acetylglutamate kinase  50.79 
 
 
257 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4450  acetylglutamate kinase  50.79 
 
 
257 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000178281 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4332  acetylglutamate kinase  50.79 
 
 
257 aa  228  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4027  acetylglutamate kinase  50.79 
 
 
257 aa  228  6e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0768978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03844  acetylglutamate kinase  50.39 
 
 
257 aa  226  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4027  acetylglutamate kinase  50.39 
 
 
258 aa  226  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4193  acetylglutamate kinase  50.39 
 
 
257 aa  226  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5419  acetylglutamate kinase  50.39 
 
 
257 aa  226  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4406  acetylglutamate kinase  50.39 
 
 
257 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0773031 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03793  hypothetical protein  50.39 
 
 
257 aa  226  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4445  acetylglutamate kinase  50.39 
 
 
257 aa  226  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4498  acetylglutamate kinase  50.39 
 
 
257 aa  226  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.890825  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4057  acetylglutamate kinase  50.39 
 
 
257 aa  226  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.650697 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0196  acetylglutamate kinase  48.41 
 
 
257 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4780  acetylglutamate kinase  50.79 
 
 
257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865282 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0128  acetylglutamate kinase  49.6 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3897  acetylglutamate kinase  49.6 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4088  acetylglutamate kinase  49.6 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0229  acetylglutamate kinase  46.72 
 
 
260 aa  217  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0059376  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2757  acetylglutamate kinase  49.21 
 
 
263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0981  acetylglutamate kinase  48.83 
 
 
257 aa  209  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.71344  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0461  acetylglutamate kinase  45.31 
 
 
260 aa  201  7e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00531  acetylglutamate kinase  48.22 
 
 
267 aa  196  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0128  acetylglutamate kinase  32.17 
 
 
281 aa  125  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  35.66 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  35.29 
 
 
295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3963  acetylglutamate kinase  33.33 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00282124  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  33.21 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1496  acetylglutamate kinase  33.63 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1081  acetylglutamate kinase  32.17 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0152417  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4154  acetylglutamate kinase  32.94 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4240  acetylglutamate kinase  31.75 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4264  acetylglutamate kinase  32.94 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  30.88 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4038  acetylglutamate kinase  32.55 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0190  acetylglutamate kinase  37.67 
 
 
260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4353  acetylglutamate kinase  32.55 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.783439  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2288  acetylglutamate kinase  32.35 
 
 
296 aa  113  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3479  acetylglutamate kinase  30.97 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  0.537456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3982  acetylglutamate kinase  30.22 
 
 
305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0539  acetylglutamate kinase  31.42 
 
 
288 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000417739  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0464  acetylglutamate kinase  34.19 
 
 
295 aa  112  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4201  acetylglutamate kinase  32.54 
 
 
255 aa  112  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0028  acetylglutamate kinase  31.8 
 
 
297 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0075  acetylglutamate kinase  33.46 
 
 
295 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52011  predicted protein  34.08 
 
 
334 aa  111  9e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.367344  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0774  acetylglutamate kinase  31.13 
 
 
286 aa  111  9e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74078  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04991  acetylglutamate kinase  33.18 
 
 
300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3885  acetylglutamate kinase  32.14 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0554  acetylglutamate kinase  34.38 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879034  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2289  acetylglutamate kinase  31.42 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.99529  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0327  acetylglutamate kinase  32.32 
 
 
287 aa  110  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  31.23 
 
 
294 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1641  acetylglutamate kinase  32.09 
 
 
295 aa  110  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3524  acetylglutamate kinase  30.22 
 
 
296 aa  109  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1131  acetylglutamate kinase  32.3 
 
 
309 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1162  acetylglutamate kinase  32.3 
 
 
309 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.174929  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0996  acetylglutamate kinase  31.75 
 
 
255 aa  108  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0568  acetylglutamate kinase  30.97 
 
 
301 aa  108  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2778  acetylglutamate kinase  36.16 
 
 
254 aa  109  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.616506  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1153  acetylglutamate kinase  32.74 
 
 
292 aa  109  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0296435  hitchhiker  0.00582367 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1381  acetylglutamate kinase  30.74 
 
 
304 aa  108  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1614  acetylglutamate kinase  29.15 
 
 
294 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3877  acetylglutamate kinase  33.48 
 
 
236 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0588  acetylglutamate kinase  30.97 
 
 
296 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0629  acetylglutamate kinase  29.85 
 
 
295 aa  108  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.615358  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0568  acetylglutamate kinase  30.15 
 
 
299 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2653  acetylglutamate kinase  32.22 
 
 
289 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.485023 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0579  acetylglutamate kinase  30.15 
 
 
303 aa  108  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.503767  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1854  acetylglutamate kinase  33.63 
 
 
296 aa  107  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1068  acetylglutamate kinase  32.16 
 
 
293 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0854  acetylglutamate kinase  30.62 
 
 
283 aa  107  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.277534  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1226  acetylglutamate kinase  31.34 
 
 
296 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3297  acetylglutamate kinase  32.5 
 
 
303 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0273  acetylglutamate kinase  31.7 
 
 
287 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2865  acetylglutamate kinase  32.55 
 
 
292 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>