78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1810 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1810  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  100 
 
 		 196 aa  394  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2766  response regulator  40.51 
 
 		 198 aa  106  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0580203 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1874  response regulator  43.18 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.393218  hitchhiker  0.00001604 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1508  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.25 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1703  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.93 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.242071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1448  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.4 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2529  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.26 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5014  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.73 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.757534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4961  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.82 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.044252 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4498  ANTAR domain-containing protein  31.82 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3741  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.73 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.109153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2871  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.91 
 
 		 204 aa  62  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372726  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2302  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.91 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.874561 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0829  response regulator receiver:ANTAR  28.97 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018256 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3317  putative response regulator NasT  28.15 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0234612  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0769  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.81 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0679202  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1167  response regulator NasT  27.16 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136185  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0238  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.03 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3266  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.32 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0259  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.03 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2973  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.18 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1415  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.36 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.609776  normal  0.778661 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5900  two component response regulator  25.88 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0333  response regulator NasT  26.88 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169956  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1759  response regulator/ANTAR domain-containing protein  26.54 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0087  response regulator/ANTAR domain-containing protein  26.88 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.792302  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1670  response regulator/ANTAR domain-containing protein  26.88 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1255  response regulator/ANTAR domain-containing protein  26.88 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0422038  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1090  response regulator NasT  26.88 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0331  response regulator receiver:ANTAR  22.68 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0246  response regulator NasT  26.88 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1393  putative response regulator transcription regulator protein  21.93 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1340  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.22 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.579049 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4510  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.61 
 
 		 219 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000166869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3858  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.61 
 
 		 219 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.853052  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0278  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.71 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5794  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.61 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0382  response regulator transcription regulator protein  29.91 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.59 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4144  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.19 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.071014 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3940  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.61 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.590133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2149  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.08 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4403  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.61 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5673  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.3 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.598594 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2821  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  21.64 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.41961  normal  0.477248 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2830  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.1 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1632  response regulator receiver and ANTAR domain protein  23.36 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0623893 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2319  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.1 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1661  transcription antitermination regulatory protein  28.7 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275655 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1086  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  21.26 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1455  response regulator receiver and ANTAR domain protein  23.36 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4528  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  22.63 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0588  response regulator NasT  26.13 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.419145  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2271  response regulator receiver domain-containing protein  26.17 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.187486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2959  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.77 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.793007 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1048  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192908  normal  0.77765 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2589  Fis family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488842 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3445  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.64 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1262  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.79 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2506  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  22.73 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1151  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.02 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23450  response regulator NasT  22.29 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.212044  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1211  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.19 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1968  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.43 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4139  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.85 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.214536 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3038  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.88 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4227  response regulator receiver and ANTAR domain protein  22.46 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0711042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2091  response regulator  23.15 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3764  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.12 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0425638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1762  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  21.58 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48447  normal  0.0125916 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1132  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.13 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4455  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  22.02 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.269789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1784  response regulator receiver  21.97 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1146  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.85 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0615  response regulator receiver protein  27.53 
 
 		 485 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3519  hypothetical protein  22.86 
 
 		 192 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2581  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  21.14 
 
 		 192 aa  41.2  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.298585  hitchhiker  0.00648362 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1506  response regulator receiver and ANTAR domain protein  22.13 
 
 		 220 aa  41.2  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>