More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1979 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1979  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  100 
 
 		 398 aa  806    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0933201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  31.93 
 
 		 368 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1923  transposase IS605 OrfB family  32.8 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.846534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  31.87 
 
 		 373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  28.76 
 
 		 403 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  28.76 
 
 		 403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  28.76 
 
 		 403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  28.76 
 
 		 403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  28.76 
 
 		 403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  32.73 
 
 		 417 aa  146  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  29.35 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  28.23 
 
 		 435 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  33.5 
 
 		 424 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  30.69 
 
 		 381 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4737  IS605 family transposase OrfB  30.4 
 
 		 371 aa  139  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3651  IS605 family transposase OrfB  31.48 
 
 		 380 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166379  normal  0.432603 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0294  IS605 family transposase OrfB  24.46 
 
 		 424 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.414871  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3187  transposase, IS605 OrfB family  31.72 
 
 		 380 aa  139  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.742933 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2181  transposase, IS605 OrfB family  31.17 
 
 		 380 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.538688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  32.35 
 
 		 410 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  28.8 
 
 		 370 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2213  transposase IS605 OrfB family  30.5 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3396  IS605 family transposase OrfB  30.29 
 
 		 385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000848869  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  32.98 
 
 		 406 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  28.18 
 
 		 370 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2076  IS605 family transposase OrfB  32.88 
 
 		 380 aa  133  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  29.95 
 
 		 385 aa  132  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000194492  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  31.82 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  30.96 
 
 		 408 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  29.02 
 
 		 376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0739  transposase, IS605 OrfB family  30.85 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  30.75 
 
 		 381 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  29.68 
 
 		 405 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  29.43 
 
 		 381 aa  129  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  29.31 
 
 		 377 aa  129  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  29.57 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  30.19 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  30.75 
 
 		 381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0289  transposase, IS605 OrfB family  30.38 
 
 		 380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  29.84 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  30.21 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1199  transposase, IS605 OrfB family  30.18 
 
 		 380 aa  126  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000673457  hitchhiker  0.00797435 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  30.59 
 
 		 361 aa  125  9e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  30.08 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  28.61 
 
 		 393 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  26.36 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  29.76 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  29.19 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4459  transposase, IS605 OrfB family  33.11 
 
 		 398 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0155  transposase, IS605 OrfB family  30.33 
 
 		 466 aa  123  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565863  normal  0.100643 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3144  transposase, IS605 OrfB family  33.11 
 
 		 398 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.545249 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  29.95 
 
 		 399 aa  121  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  29.95 
 
 		 399 aa  121  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1755  transposase, IS605 OrfB family  29.95 
 
 		 371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  26.69 
 
 		 367 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  27.32 
 
 		 416 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1309  transposase  27.92 
 
 		 427 aa  119  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.231489  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2543  transposase  27.92 
 
 		 390 aa  119  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  28.5 
 
 		 377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2858  transposase, IS605 OrfB family  28.22 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.551858  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  26.69 
 
 		 367 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0499  transposase  28.02 
 
 		 450 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  28.02 
 
 		 392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  27.71 
 
 		 392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1517  transposase, IS605 OrfB family  29.03 
 
 		 371 aa  116  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2218  transposase  27.15 
 
 		 392 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0679  ISCpe2, transposase orfB  24.55 
 
 		 384 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1513  IS605 family transposase OrfB  27.94 
 
 		 405 aa  115  8.999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0963227  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  28.84 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  27.06 
 
 		 391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  27.42 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0168  ISCpe2, transposase orfB  24.3 
 
 		 384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0772  ISCpe2, transposase orfB  24.04 
 
 		 383 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0126  ISCpe2, transposase orfB  23.48 
 
 		 384 aa  113  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1583  ISCpe2, transposase orfB  23.79 
 
 		 384 aa  113  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0166589  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0641  IS605 family transposase OrfB  29.15 
 
 		 384 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133268  normal  0.392009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1851  IS605 family transposase OrfB  29.15 
 
 		 384 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0177268 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  27.44 
 
 		 363 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0245  ISCpe2, transposase orfB  23.48 
 
 		 384 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  25.54 
 
 		 383 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0723  ISCpe2, transposase orfB  23.23 
 
 		 384 aa  112  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  24.3 
 
 		 384 aa  112  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3554  transposase, IS605 OrfB family  27.44 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  27.44 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3850  transposase, IS605 OrfB family  27.44 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  28.03 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0547  ISCpe2, transposase orfB  23.48 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0626  ISCpe2, transposase orfB  24.3 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.202409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0889  ISCpe2, transposase orfB  24.04 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688854  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3034  transposase, IS605 OrfB family  27.54 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.477564 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0417  transposase, IS605 OrfB family  27.18 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413645  normal  0.0217582 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  28.32 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  28.32 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  27.18 
 
 		 363 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1565  ISCpe2, transposase orfB  24.3 
 
 		 384 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3155  transposase, IS605 OrfB family  29.82 
 
 		 338 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  26.91 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  25.07 
 
 		 373 aa  111  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3802  transposase, IS605 OrfB family  27.18 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  25.27 
 
 		 383 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>