54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0421 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0421  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
280 aa  558  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1844  beta-lactamase domain protein  40.22 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1233  beta-lactamase domain protein  39.36 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0714  beta-lactamase domain protein  35.91 
 
 
284 aa  118  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5541  beta-lactamase domain protein  29.55 
 
 
264 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  26.92 
 
 
328 aa  62  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0424  beta-lactamase domain protein  27.95 
 
 
223 aa  52.4  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.65466  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  29.92 
 
 
341 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  25.6 
 
 
217 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  22.37 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  25.48 
 
 
210 aa  49.7  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  25.52 
 
 
217 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  24.5 
 
 
323 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  21.74 
 
 
253 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  24.18 
 
 
217 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  26.57 
 
 
314 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  31.97 
 
 
342 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  27.56 
 
 
354 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  25.98 
 
 
209 aa  46.6  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  23.56 
 
 
342 aa  46.6  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3131  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 
230 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.833456  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  27.19 
 
 
302 aa  45.8  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  32.18 
 
 
332 aa  45.8  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  29.06 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  24.38 
 
 
343 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  27.91 
 
 
557 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  29.49 
 
 
350 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  24.71 
 
 
217 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  29.11 
 
 
214 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0433  beta-lactamase domain-containing protein  25.62 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151814  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  26.52 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2918  beta-lactamase domain protein  27.69 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 
337 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  25 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  32.61 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  33.64 
 
 
230 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  28.25 
 
 
287 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.57 
 
 
222 aa  43.5  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5314  beta-lactamase domain protein  25.91 
 
 
268 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498114 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  25.63 
 
 
328 aa  43.5  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  26.81 
 
 
347 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  26.63 
 
 
322 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1929  beta-lactamase domain-containing protein  27.75 
 
 
255 aa  43.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.298264 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2870  metal-dependent hydrolase  27.91 
 
 
285 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  21.24 
 
 
324 aa  43.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  24.74 
 
 
209 aa  42.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  26.34 
 
 
365 aa  42.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 
568 aa  42.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2866  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 
298 aa  42.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  23.4 
 
 
486 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  28.79 
 
 
286 aa  42.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.91 
 
 
357 aa  42.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  28.66 
 
 
212 aa  42.4  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 
321 aa  42  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>