17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1233 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1233  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
284 aa  535  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1844  beta-lactamase domain protein  46.1 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0421  beta-lactamase domain-containing protein  40.49 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0714  beta-lactamase domain protein  40.38 
 
 
284 aa  92  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  27.49 
 
 
212 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5541  beta-lactamase domain protein  31.45 
 
 
264 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  26.51 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  22.9 
 
 
310 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  28.25 
 
 
210 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4155  beta-lactamase domain protein  22.97 
 
 
212 aa  46.6  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  27.22 
 
 
213 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3402  beta-lactamase domain-containing protein  32.75 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433473  normal  0.430357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3131  beta-lactamase domain-containing protein  30.59 
 
 
230 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.833456  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  23.39 
 
 
209 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  28.22 
 
 
213 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  28.51 
 
 
562 aa  42.7  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 
204 aa  42.4  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>