37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0714 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0714  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
284 aa  540  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1844  beta-lactamase domain protein  40.08 
 
 
268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0421  beta-lactamase domain-containing protein  35.91 
 
 
280 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1233  beta-lactamase domain protein  40.45 
 
 
284 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5541  beta-lactamase domain protein  34.3 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
304 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  36.47 
 
 
321 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.27 
 
 
352 aa  49.3  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  19.21 
 
 
249 aa  48.9  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  32.63 
 
 
342 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  29.01 
 
 
333 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  26.29 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  23.44 
 
 
317 aa  46.6  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  35.42 
 
 
310 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3131  beta-lactamase domain-containing protein  27.11 
 
 
230 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.833456  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1871  Beta-lactamase-like  38.81 
 
 
309 aa  46.6  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  22.97 
 
 
317 aa  46.2  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  22.08 
 
 
299 aa  46.2  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2731  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 
307 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  34.52 
 
 
438 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0336  beta-lactamase domain-containing protein  23.22 
 
 
330 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  38.3 
 
 
323 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0671  beta-lactamase domain protein  26.72 
 
 
302 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461585  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  27.43 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2056  Beta-lactamase  36.51 
 
 
246 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.53906 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 
263 aa  43.5  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  27.36 
 
 
313 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  25.11 
 
 
293 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 
315 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 
272 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  30.73 
 
 
310 aa  43.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
298 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 
275 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  38.36 
 
 
311 aa  42.7  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5378  beta-lactamase domain protein  28.47 
 
 
293 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13255  normal  0.647715 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  26.36 
 
 
302 aa  42.7  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000315394  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  24 
 
 
302 aa  42.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>