75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1098 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1098  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 		 195 aa  408  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.487645  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1635  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  72.31 
 
 		 195 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.119612  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1822  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  71.79 
 
 		 195 aa  304  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0660  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  72.59 
 
 		 199 aa  297  7e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.562884  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0622  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  72.59 
 
 		 199 aa  297  7e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3767  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  73.44 
 
 		 199 aa  296  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672652  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2145  hypothetical protein  71.79 
 
 		 195 aa  295  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2828  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  69.79 
 
 		 198 aa  278  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0739962  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03010  conserved hypothetical protein  42.86 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182163  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1657  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  47.28 
 
 		 193 aa  185  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2895  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.67 
 
 		 189 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.114863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49782  predicted protein  39.89 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0427  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.09 
 
 		 186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.69 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.97 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.77 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  30.17 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.28 
 
 		 152 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  31 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0188  hypothetical protein  36.99 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1744  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.59 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  28.95 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  26.04 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.06 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_006686  CND05970  cytosine deaminase, putative  28.79 
 
 		 225 aa  53.9  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.35 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  27.91 
 
 		 147 aa  53.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.84 
 
 		 183 aa  51.6  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  23.23 
 
 		 151 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.07 
 
 		 157 aa  51.2  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  29.55 
 
 		 152 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.19 
 
 		 155 aa  51.2  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.29 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  30.59 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  28 
 
 		 157 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30 
 
 		 158 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  22.22 
 
 		 151 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  29.73 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30 
 
 		 163 aa  48.9  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.08 
 
 		 161 aa  48.5  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.82 
 
 		 159 aa  48.5  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.24 
 
 		 161 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.73 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.4 
 
 		 153 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.53 
 
 		 158 aa  48.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2685  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.81 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.109845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.38 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.37 
 
 		 153 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  25.88 
 
 		 161 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  27.91 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3135  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.37 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.065238 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  25.23 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  29.77 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1083  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  26.67 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25.6 
 
 		 158 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2203  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  22.99 
 
 		 153 aa  45.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282185  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  24.71 
 
 		 141 aa  45.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  26.83 
 
 		 158 aa  45.1  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2500  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.11 
 
 		 190 aa  44.7  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.59246 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.03 
 
 		 145 aa  44.7  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  26.15 
 
 		 164 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2118  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.46 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  29.37 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  29.67 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.174881  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1137  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.49 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  26.09 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  24.72 
 
 		 161 aa  42.4  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4330  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  29.35 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.278025  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1447  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.57 
 
 		 150 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  26.03 
 
 		 186 aa  42  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04200  expressed protein  30.43 
 
 		 224 aa  41.6  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3970  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.59 
 
 		 176 aa  41.2  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1042  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.68 
 
 		 155 aa  41.2  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0184  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  28.57 
 
 		 204 aa  41.2  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>