76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2895 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2895  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 		 189 aa  397  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.114863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1657  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  61.38 
 
 		 193 aa  265  2e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0660  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  49.73 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.562884  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0622  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  49.73 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3767  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.27 
 
 		 199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672652  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1098  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.67 
 
 		 195 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.487645  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1635  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.26 
 
 		 195 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.119612  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2828  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.49 
 
 		 198 aa  174  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0739962  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2145  hypothetical protein  44.15 
 
 		 195 aa  173  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1822  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.39 
 
 		 195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03010  conserved hypothetical protein  40.61 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182163  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0427  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.2 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49782  predicted protein  39.23 
 
 		 227 aa  134  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.96 
 
 		 152 aa  62  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1744  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.52 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  30.63 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0184  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  31.25 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.52 
 
 		 160 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.21 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0205  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  30.47 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  29.91 
 
 		 151 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.57 
 
 		 157 aa  52  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.77 
 
 		 163 aa  52  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  28.97 
 
 		 151 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  33.75 
 
 		 148 aa  50.1  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0188  hypothetical protein  31.51 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.21 
 
 		 153 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.21 
 
 		 153 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1700  tRNA-adenosine deaminase  34.12 
 
 		 148 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448042  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.46 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  27.66 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.42 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.58 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103435  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  31.25 
 
 		 152 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3870  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.84 
 
 		 147 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619986 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3135  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.21 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.065238 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2203  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.88 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282185  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.71 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  29.49 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.23 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.11 
 
 		 147 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.79 
 
 		 147 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.36 
 
 		 155 aa  45.8  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  31.91 
 
 		 155 aa  45.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.87 
 
 		 158 aa  45.1  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2323  tRNA-adenosine deaminase  31.82 
 
 		 150 aa  45.1  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.034799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3292  Guanine deaminase  27.14 
 
 		 188 aa  44.7  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.650383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.12 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.62 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00262263 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9319  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  31.58 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.61 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1355  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.76 
 
 		 148 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.939679  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1748  tRNA-adenosine deaminase  31.52 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00208224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0449  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  27.03 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0908  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30 
 
 		 148 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2730  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  29.25 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.17 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  26.6 
 
 		 150 aa  43.1  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.77 
 
 		 159 aa  43.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6056  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.67 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0183859  normal  0.29725 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  25.47 
 
 		 161 aa  43.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.58 
 
 		 162 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05970  cytosine deaminase, putative  32.56 
 
 		 225 aa  42.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1170  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.41 
 
 		 148 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.358945 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.1 
 
 		 211 aa  42  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3172  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.76 
 
 		 148 aa  42.4  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0411701  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  28.4 
 
 		 141 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0427  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.43 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1211  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding protein  31.08 
 
 		 148 aa  42  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0208856  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0521  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.43 
 
 		 145 aa  41.6  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  29.87 
 
 		 163 aa  41.6  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0573  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  27.03 
 
 		 139 aa  41.2  0.009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1272  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.77 
 
 		 148 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2127  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.93 
 
 		 168 aa  41.2  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>