71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2145 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2145  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  407  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1822  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  75.9 
 
 		 195 aa  326  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1635  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  76.92 
 
 		 195 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.119612  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1098  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  71.79 
 
 		 195 aa  295  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.487645  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0660  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  70.47 
 
 		 199 aa  291  4e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.562884  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0622  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  70.47 
 
 		 199 aa  291  4e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3767  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  70.05 
 
 		 199 aa  288  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672652  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2828  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  64.1 
 
 		 198 aa  263  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0739962  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03010  conserved hypothetical protein  44.66 
 
 		 210 aa  187  7e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182163  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1657  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  46.24 
 
 		 193 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2895  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.15 
 
 		 189 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.114863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49782  predicted protein  43.23 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0427  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.43 
 
 		 186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.83 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.69 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0188  hypothetical protein  38.89 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1744  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  24.81 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.27 
 
 		 152 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  31.73 
 
 		 150 aa  54.3  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  28.45 
 
 		 163 aa  52.8  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.13 
 
 		 157 aa  52  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.9 
 
 		 163 aa  52.4  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  27.35 
 
 		 153 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.3 
 
 		 161 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.41 
 
 		 155 aa  50.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2685  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.81 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.109845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.85 
 
 		 155 aa  49.7  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.29 
 
 		 155 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05970  cytosine deaminase, putative  32.71 
 
 		 225 aa  48.5  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  29.41 
 
 		 154 aa  48.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  29 
 
 		 157 aa  48.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.4 
 
 		 153 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1137  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.43 
 
 		 171 aa  48.1  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.4 
 
 		 153 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.29 
 
 		 223 aa  47.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  22.86 
 
 		 151 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  29.21 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.174881  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.23 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.05 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.36 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25.22 
 
 		 161 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3135  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.4 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.065238 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.18 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1083  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.61 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  23.47 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0415  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.72 
 
 		 149 aa  45.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.605346 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  25 
 
 		 156 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  26.73 
 
 		 161 aa  45.8  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2500  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.88 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.59246 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  22.22 
 
 		 147 aa  45.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  25.74 
 
 		 152 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  30.17 
 
 		 148 aa  45.1  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04200  expressed protein  32.61 
 
 		 224 aa  45.1  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  28.44 
 
 		 176 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  24.56 
 
 		 158 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  27.91 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  28.74 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.95 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.57 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0911  cytidine and deoxycytidylate deaminase  28.3 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.312122  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.24 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.44 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.77 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.61 
 
 		 145 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25.19 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  24.42 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2203  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  24.18 
 
 		 153 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282185  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  29.25 
 
 		 155 aa  43.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4330  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  25.84 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.278025  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3095  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.92 
 
 		 147 aa  42.4  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.786655  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.5 
 
 		 164 aa  41.2  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>