57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2828 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2828  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 		 198 aa  410  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0739962  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0660  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  68.34 
 
 		 199 aa  290  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.562884  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0622  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  68.34 
 
 		 199 aa  290  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3767  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  68.21 
 
 		 199 aa  288  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672652  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1098  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  69.79 
 
 		 195 aa  278  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.487645  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1635  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  63.27 
 
 		 195 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.119612  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1822  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.47 
 
 		 195 aa  264  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2145  hypothetical protein  64.1 
 
 		 195 aa  263  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03010  conserved hypothetical protein  45.54 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182163  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1657  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  49.45 
 
 		 193 aa  186  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2895  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.49 
 
 		 189 aa  174  8e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.114863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49782  predicted protein  37.31 
 
 		 227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0427  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.64 
 
 		 186 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1744  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.89 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25.53 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  34.48 
 
 		 154 aa  53.9  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.6 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_006686  CND05970  cytosine deaminase, putative  29.55 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.26 
 
 		 155 aa  52.4  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  30.21 
 
 		 150 aa  52  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.89 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  26.72 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.98 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.7 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.87 
 
 		 157 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  25 
 
 		 151 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.72 
 
 		 157 aa  48.9  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  31.31 
 
 		 163 aa  48.5  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  26.6 
 
 		 163 aa  48.5  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  26.21 
 
 		 151 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0188  hypothetical protein  31.68 
 
 		 153 aa  48.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  30.51 
 
 		 148 aa  47.8  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.87 
 
 		 158 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  26.44 
 
 		 161 aa  47  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.89 
 
 		 160 aa  46.6  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.06 
 
 		 153 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  27.47 
 
 		 152 aa  45.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2203  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.09 
 
 		 153 aa  45.1  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282185  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.06 
 
 		 153 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.89 
 
 		 158 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.44 
 
 		 183 aa  45.1  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  31.15 
 
 		 147 aa  45.1  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3135  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.68 
 
 		 153 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.065238 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1211  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding protein  29.82 
 
 		 148 aa  44.3  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0208856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0310  putative cytosine/adenosine deaminase  27.62 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.6846099999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2685  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.46 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.109845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.82 
 
 		 145 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  26.37 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.23 
 
 		 159 aa  43.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.03 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2498  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.27 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25.53 
 
 		 156 aa  42.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25.18 
 
 		 161 aa  42.4  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.82 
 
 		 163 aa  42  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1094  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.05 
 
 		 166 aa  41.2  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  26.32 
 
 		 157 aa  41.6  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>