27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0427 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0427  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  100 
 
 
186 aa  387  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2895  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.2 
 
 
189 aa  156  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.114863  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1657  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.11 
 
 
193 aa  147  8e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1635  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.8 
 
 
195 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.119612  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0622  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  38.8 
 
 
199 aa  141  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0660  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  38.8 
 
 
199 aa  141  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.562884  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1822  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.8 
 
 
195 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2145  hypothetical protein  37.43 
 
 
195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3767  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.86 
 
 
199 aa  134  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672652  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1098  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.09 
 
 
195 aa  125  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.487645  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49782  predicted protein  34.39 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2828  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.64 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0739962  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03010  conserved hypothetical protein  32.65 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182163  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1744  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32 
 
 
186 aa  53.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.12 
 
 
160 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.12 
 
 
160 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  31.43 
 
 
152 aa  48.1  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  25.25 
 
 
151 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31 
 
 
155 aa  47  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_006686  CND05970  cytosine deaminase, putative  32.56 
 
 
225 aa  46.6  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  25.25 
 
 
151 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.26 
 
 
152 aa  42.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  29.31 
 
 
147 aa  42  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  24.74 
 
 
156 aa  41.6  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0188  hypothetical protein  26 
 
 
153 aa  41.6  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.71 
 
 
153 aa  41.2  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>