69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3767 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3767  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
199 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672652  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0660  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  88.94 
 
 
199 aa  373  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.562884  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0622  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  88.94 
 
 
199 aa  373  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1098  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  73.44 
 
 
195 aa  296  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.487645  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2828  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  68.21 
 
 
198 aa  288  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0739962  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2145  hypothetical protein  70.05 
 
 
195 aa  288  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1635  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  68.25 
 
 
195 aa  275  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.119612  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1822  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  66.67 
 
 
195 aa  274  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03010  conserved hypothetical protein  45.45 
 
 
210 aa  206  2e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182163  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1657  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50.27 
 
 
193 aa  191  5e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2895  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.27 
 
 
189 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.114863  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49782  predicted protein  37.76 
 
 
227 aa  138  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0427  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.86 
 
 
186 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.45 
 
 
160 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.02 
 
 
157 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.71 
 
 
152 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.16 
 
 
160 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1744  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.87 
 
 
186 aa  55.8  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  29.52 
 
 
150 aa  53.5  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  27.1 
 
 
151 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  25 
 
 
163 aa  52.4  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  29.79 
 
 
153 aa  52  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0188  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  52  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  23.76 
 
 
147 aa  50.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  28.16 
 
 
152 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  26.73 
 
 
151 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.71 
 
 
161 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.46 
 
 
158 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05970  cytosine deaminase, putative  29.91 
 
 
225 aa  49.7  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.71 
 
 
153 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.69 
 
 
155 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2685  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.08 
 
 
190 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.109845  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.71 
 
 
153 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  28.12 
 
 
163 aa  48.1  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.96 
 
 
155 aa  48.5  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3135  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.71 
 
 
153 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.065238 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.37 
 
 
155 aa  47  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.02 
 
 
183 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.77 
 
 
157 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1083  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.53 
 
 
169 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1137  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.58 
 
 
171 aa  45.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  27.27 
 
 
164 aa  45.8  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  26.45 
 
 
176 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.89 
 
 
158 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  28.74 
 
 
154 aa  45.4  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.38 
 
 
160 aa  45.1  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25.76 
 
 
158 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.43 
 
 
223 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.45 
 
 
214 aa  44.7  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2203  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  23.6 
 
 
153 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282185  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0911  cytidine and deoxycytidylate deaminase  30.23 
 
 
149 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.312122  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  21.21 
 
 
156 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2500  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.56 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.59246 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.27 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.82 
 
 
145 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  26.47 
 
 
157 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.38 
 
 
161 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  26.73 
 
 
211 aa  42.4  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  23.86 
 
 
141 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  23.3 
 
 
161 aa  42.4  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1480  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.84 
 
 
145 aa  42  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.23 
 
 
159 aa  42  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  28.81 
 
 
148 aa  42  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  24.73 
 
 
163 aa  41.6  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0160  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.48 
 
 
112 aa  41.6  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  25.88 
 
 
158 aa  41.2  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0700  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  23.71 
 
 
157 aa  41.2  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192591  normal  0.865877 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  28.3 
 
 
155 aa  41.2  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  24.77 
 
 
161 aa  41.2  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>