76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0160 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0160  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 		 112 aa  231  3e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2498  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  60.36 
 
 		 197 aa  141  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2842  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  50 
 
 		 194 aa  116  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0340  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.77 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000331543  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1808  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.45 
 
 		 191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.607751  normal  0.0647304 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0072  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.4 
 
 		 204 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0660  cytosine/adenosine deaminase  46.73 
 
 		 193 aa  103  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2685  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.4 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.109845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2500  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.47 
 
 		 190 aa  96.7  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.59246 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0379  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.23 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00104836  normal  0.131748 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04619  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  40.57 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0239  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  43.12 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000722464  hitchhiker  0.0000000000000386131 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0679  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.57 
 
 		 186 aa  77  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.602428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  45.83 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.77 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_7208  predicted protein  43.94 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.472899  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.75 
 
 		 183 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  45 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49924  predicted protein  49.12 
 
 		 564 aa  50.4  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0700  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.7 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192591  normal  0.865877 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  48 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.28 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  29.52 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  29.52 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.88 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  32.32 
 
 		 157 aa  47.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.88 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.44 
 
 		 160 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  42.86 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0797  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.28 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  42.62 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  36.51 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.25 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1920  tRNA-adenosine deaminase  35.71 
 
 		 196 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277263  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3003  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.160793  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1525  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.35 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.68 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.906022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  42.55 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.98 
 
 		 461 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  31.86 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.29 
 
 		 164 aa  43.5  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.06 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1573  tRNA-adenosine deaminase  40.98 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1744  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.9 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1141  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.44 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.935538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.94 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04155  putative cytosine/adenosine deaminase  33.33 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.411988  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1066  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.67 
 
 		 188 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  56.76 
 
 		 146 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0991  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  43.75 
 
 		 539 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0298578 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.34 
 
 		 231 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0981147 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  38.64 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1272  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.73 
 
 		 148 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3767  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.48 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672652  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0184  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  31.33 
 
 		 204 aa  41.6  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2065  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  56.67 
 
 		 240 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448828  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1094  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.14 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0205  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  31.33 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.18 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00354903  normal  0.0468884 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.66 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1968  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.7 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6109  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.7 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1447  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.88 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5283  tRNA-adenosine deaminase  37.7 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1992  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.7 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1883  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.7 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.839631  normal  0.641763 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1657  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4636  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.11 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  38.3 
 
 		 153 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0798  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 		 168 aa  40.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1956  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.7 
 
 		 193 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.3 
 
 		 161 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03340  tRNA-adenosine deaminase  52.78 
 
 		 162 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1302  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.38 
 
 		 187 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0817948 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2127  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.91 
 
 		 168 aa  40  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>