259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0679 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0679  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
186 aa  384  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.602428 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04619  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  74.73 
 
 
186 aa  288  5.0000000000000004e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2842  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  41.8 
 
 
194 aa  142  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0340  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.89 
 
 
196 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000331543  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2500  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.56 
 
 
190 aa  132  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.59246 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2685  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.59 
 
 
190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.109845  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0072  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.89 
 
 
204 aa  127  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2498  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.66 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0660  cytosine/adenosine deaminase  39.89 
 
 
193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0239  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  37.84 
 
 
186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000722464  hitchhiker  0.0000000000000386131 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0379  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.57 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00104836  normal  0.131748 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1808  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.7 
 
 
191 aa  115  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.607751  normal  0.0647304 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_7208  predicted protein  41.03 
 
 
123 aa  89.4  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.472899  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0160  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.57 
 
 
112 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.42 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.03 
 
 
158 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  33.33 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  31.03 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  31.03 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.16 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  36.13 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  34.84 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.64 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  38.89 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5084  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.81 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.326252  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  31.68 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  34.31 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.07 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  32 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0518  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.35 
 
 
158 aa  63.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.79 
 
 
156 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.68 
 
 
163 aa  62.4  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  34.35 
 
 
157 aa  62  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  33.13 
 
 
164 aa  61.6  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.43 
 
 
211 aa  61.2  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
155 aa  61.2  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  40.91 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  31.58 
 
 
158 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  29.55 
 
 
154 aa  60.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.03 
 
 
160 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  30.67 
 
 
148 aa  60.1  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.76 
 
 
159 aa  58.9  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  36.54 
 
 
156 aa  58.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.19 
 
 
164 aa  58.2  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.1 
 
 
164 aa  58.2  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.49 
 
 
160 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.08 
 
 
159 aa  57.8  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  33.03 
 
 
153 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.09 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426066  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.96 
 
 
155 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.81 
 
 
161 aa  56.6  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.87 
 
 
183 aa  56.6  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.82 
 
 
163 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  38.82 
 
 
167 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.82 
 
 
158 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0624  tRNA-adenosine deaminase  39.76 
 
 
153 aa  54.7  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2030  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.57 
 
 
146 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000721347  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  30.19 
 
 
176 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.705581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.38 
 
 
223 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0798  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.89 
 
 
168 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0608  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.76 
 
 
154 aa  53.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.740984  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8163  guanine deaminase  37.21 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.241917 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  38.2 
 
 
144 aa  53.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3324  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.76 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1229  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.92 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  33.09 
 
 
158 aa  52.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.94 
 
 
157 aa  52  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32 
 
 
163 aa  52.4  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2065  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  29.58 
 
 
240 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448828  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3893  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.55 
 
 
161 aa  52  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0668  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.5 
 
 
156 aa  52  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  35.4 
 
 
151 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0471  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.9 
 
 
154 aa  51.6  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  37.35 
 
 
158 aa  51.6  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1609  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.93 
 
 
165 aa  51.6  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0448042  normal  0.295189 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1137  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.61 
 
 
171 aa  51.6  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1942  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.55 
 
 
152 aa  50.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3974  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.71 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3292  Guanine deaminase  27.67 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.650383  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.58 
 
 
161 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1083  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.58 
 
 
169 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0777  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.76 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0797  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.07 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0280  tRNA-adenosine deaminase  35.64 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0136  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  34.74 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9319  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.21 
 
 
154 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3536  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.17 
 
 
152 aa  49.3  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0501  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.77 
 
 
149 aa  49.3  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1491  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  34.78 
 
 
180 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0201643  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1066  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25.79 
 
 
188 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.75 
 
 
178 aa  49.3  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.36 
 
 
174 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2012  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.73 
 
 
178 aa  48.9  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.168679  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4568  cytosine/adenosine deaminase  33.62 
 
 
141 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0674269 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1429  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.46 
 
 
161 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000748458 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2778  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  32.06 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.95 
 
 
153 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  42.35 
 
 
200 aa  48.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>