More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2685 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2685  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
190 aa  386  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.109845  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2500  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  79.47 
 
 
190 aa  310  7.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.59246 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0239  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  53.85 
 
 
186 aa  197  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000722464  hitchhiker  0.0000000000000386131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0340  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.41 
 
 
196 aa  181  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000331543  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0660  cytosine/adenosine deaminase  48.91 
 
 
193 aa  181  7e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0072  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.59 
 
 
204 aa  167  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2498  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.81 
 
 
197 aa  164  9e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2842  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  47.28 
 
 
194 aa  162  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1808  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.65 
 
 
191 aa  149  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.607751  normal  0.0647304 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0379  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.21 
 
 
201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00104836  normal  0.131748 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04619  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  41.11 
 
 
186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0679  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.59 
 
 
186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.602428 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_7208  predicted protein  40.65 
 
 
123 aa  109  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.472899  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0160  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.4 
 
 
112 aa  102  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  47.01 
 
 
155 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  32.1 
 
 
159 aa  97.4  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  32.1 
 
 
159 aa  97.4  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.56 
 
 
158 aa  95.9  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.32 
 
 
160 aa  93.2  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.59 
 
 
150 aa  91.3  7e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  34.18 
 
 
157 aa  89.4  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  34.23 
 
 
163 aa  88.2  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.76 
 
 
158 aa  87.8  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.91 
 
 
157 aa  87.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.36 
 
 
155 aa  86.7  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.45 
 
 
161 aa  86.7  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.38 
 
 
163 aa  87  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.22 
 
 
158 aa  85.9  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  29.14 
 
 
149 aa  85.5  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.16 
 
 
164 aa  85.1  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.51 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  28.47 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.5 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.24 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.42 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  43.22 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.4 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.91 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.91 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  32.7 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  38.27 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  31.21 
 
 
157 aa  72  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.13 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  31.21 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.54 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.75 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1141  guanine deaminase  43.7 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172316  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  29.94 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.37 
 
 
155 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.29 
 
 
163 aa  67.4  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  32.52 
 
 
161 aa  67.8  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.06 
 
 
161 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2436  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.21 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  31.58 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.85 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  32.2 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2814  cytidine/deoxycytidylate deaminase  30.38 
 
 
155 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  29.45 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1744  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.65 
 
 
186 aa  61.6  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1447  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.94 
 
 
150 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1129  hypothetical protein  29.17 
 
 
154 aa  60.1  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1134  hypothetical protein  29.17 
 
 
154 aa  60.1  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  39.25 
 
 
168 aa  60.1  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0280  tRNA-adenosine deaminase  34.06 
 
 
176 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.26 
 
 
157 aa  59.3  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  30.66 
 
 
151 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.04 
 
 
168 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0608  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.67 
 
 
154 aa  57.4  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.740984  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.59 
 
 
176 aa  57.4  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.705581 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.43 
 
 
155 aa  57.8  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  32 
 
 
147 aa  56.6  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.7 
 
 
145 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8163  guanine deaminase  36.3 
 
 
157 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.241917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4858  cytidine/deoxycytidylate deaminase  31.3 
 
 
167 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  29.63 
 
 
150 aa  56.2  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00940  cytosine/adenosine deaminase  30.25 
 
 
175 aa  56.2  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  27.34 
 
 
141 aa  56.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2730  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  32.48 
 
 
169 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1429  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.78 
 
 
161 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000748458 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  33.64 
 
 
148 aa  55.8  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  29.93 
 
 
151 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  33.64 
 
 
148 aa  55.8  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2323  tRNA-adenosine deaminase  36.28 
 
 
150 aa  55.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.034799 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0136  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  32.71 
 
 
157 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0668  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.48 
 
 
156 aa  54.7  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.89 
 
 
484 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.04 
 
 
161 aa  54.7  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.04 
 
 
363 aa  54.7  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1712  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.57 
 
 
167 aa  54.7  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.344098  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  40.62 
 
 
137 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0141  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.71 
 
 
157 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1942  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.48 
 
 
152 aa  53.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  31.93 
 
 
152 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1093  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.85 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00512356  hitchhiker  0.0000000000228725 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  35.19 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1655  guanine deaminase  37.97 
 
 
298 aa  53.5  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0523  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.97 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.11 
 
 
150 aa  53.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.906022  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6533  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.42 
 
 
185 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.82 
 
 
461 aa  52.4  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>