29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49782 on replicon NC_011692
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011692  PHATRDRAFT_49782  predicted protein  100 
 
 
227 aa  475  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2145  hypothetical protein  43.23 
 
 
195 aa  152  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1635  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.27 
 
 
195 aa  148  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.119612  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1822  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.1 
 
 
195 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1098  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.89 
 
 
195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.487645  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3767  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.76 
 
 
199 aa  138  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672652  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0660  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.37 
 
 
199 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.562884  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0622  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.37 
 
 
199 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2895  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.23 
 
 
189 aa  134  8e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.114863  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1657  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.87 
 
 
193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2828  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.31 
 
 
198 aa  126  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0739962  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03010  conserved hypothetical protein  34.31 
 
 
210 aa  124  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182163  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0427  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.39 
 
 
186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1744  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.48 
 
 
186 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  43.21 
 
 
158 aa  50.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1083  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.61 
 
 
169 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0660  cytosine/adenosine deaminase  31.65 
 
 
193 aa  45.8  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  34.52 
 
 
153 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0944  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  28.28 
 
 
160 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.91853  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0310  putative cytosine/adenosine deaminase  21.25 
 
 
221 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.6846099999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.61 
 
 
223 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1137  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.55 
 
 
171 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2685  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.63 
 
 
190 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.109845  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1141  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.17 
 
 
174 aa  43.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.935538  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.42 
 
 
161 aa  43.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0188  hypothetical protein  27.45 
 
 
153 aa  42.4  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.91 
 
 
155 aa  42  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2500  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35 
 
 
190 aa  42  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.59246 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2127  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  21.17 
 
 
168 aa  41.6  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>