More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3580 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3580  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
373 aa  760    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.874879  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0733  glycosyl transferase group 1  41.51 
 
 
375 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4457  glycosyl transferase group 1  42.55 
 
 
373 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4395  glycosyl transferase group 1  41.11 
 
 
384 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3087  glycosyl transferase, group 1  40.75 
 
 
381 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5077  glycosyl transferase, group 1  41.11 
 
 
410 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5783  glycosyl transferase, group 1  41.11 
 
 
410 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
409 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 
409 aa  89.7  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  25.73 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2477  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.82 
 
 
394 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333211  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0910  putative glycosyltransferase  27.82 
 
 
394 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464467  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2615  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.82 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0551  glycosyltransferase  27.94 
 
 
394 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.268857  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1461  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 
362 aa  80.5  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 
377 aa  79.3  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 
426 aa  78.2  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
378 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 
371 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
377 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
377 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 
389 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  23.7 
 
 
745 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 
411 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  32.68 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4911  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
394 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.527182  hitchhiker  0.000729533 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 
394 aa  73.2  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0791  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
364 aa  72.8  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  28.84 
 
 
401 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 
364 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  28.68 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0851  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
416 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 
394 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  23.1 
 
 
367 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  28.14 
 
 
426 aa  70.1  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 
507 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  30.59 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  23.94 
 
 
426 aa  67  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
395 aa  67  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 
377 aa  66.6  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 
399 aa  66.6  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1641  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
390 aa  66.2  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  27.84 
 
 
419 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
371 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
398 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 
389 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1613  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
409 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  hitchhiker  0.00171863 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 
398 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 
375 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  22.68 
 
 
367 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
404 aa  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
399 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
403 aa  63.5  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
393 aa  63.9  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  27.67 
 
 
439 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
381 aa  63.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0798  glycosyl transferase, group 1  24.21 
 
 
372 aa  63.2  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3376  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 
432 aa  62.8  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
403 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1806  glycosyl transferase group 1  22.19 
 
 
359 aa  62.4  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  21.19 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
371 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  24.77 
 
 
380 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  22.97 
 
 
364 aa  62  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
369 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  20.26 
 
 
355 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5356  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
418 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.119029 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
392 aa  62  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  26.51 
 
 
371 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
360 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  25.73 
 
 
468 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
381 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  23.32 
 
 
387 aa  61.2  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 
403 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
374 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  21.28 
 
 
369 aa  60.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  25.31 
 
 
406 aa  61.2  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  29.05 
 
 
411 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  27.35 
 
 
379 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  23.29 
 
 
385 aa  60.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1742  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
371 aa  60.5  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.711443  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
389 aa  60.5  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.46 
 
 
390 aa  60.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5198  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
426 aa  60.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.603506  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  24.76 
 
 
371 aa  60.1  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 
400 aa  60.5  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
387 aa  60.1  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  34.23 
 
 
350 aa  60.1  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>