More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5783 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3087  glycosyl transferase, group 1  90.81 
 
 
381 aa  711    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5077  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
410 aa  838    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5783  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
410 aa  838    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4395  glycosyl transferase group 1  98.96 
 
 
384 aa  776    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4457  glycosyl transferase group 1  59.24 
 
 
373 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0733  glycosyl transferase group 1  43.65 
 
 
375 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3580  glycosyl transferase group 1  41.11 
 
 
373 aa  225  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.874879  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
406 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  31.79 
 
 
401 aa  100  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  26.08 
 
 
371 aa  96.3  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
371 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  23.99 
 
 
361 aa  90.5  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 
394 aa  90.1  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 
398 aa  86.7  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
377 aa  86.3  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  27.04 
 
 
371 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 
399 aa  85.9  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  33.33 
 
 
411 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  30.86 
 
 
379 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5356  glycosyl transferase group 1  38.96 
 
 
418 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.119029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  24.13 
 
 
378 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 
382 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  26.35 
 
 
745 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
439 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
438 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0112  UDP-sugar hydrolase  27.42 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  25.8 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 
439 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 
439 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
438 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 
438 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
453 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
437 aa  79.7  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
437 aa  79.7  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 
413 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  28.21 
 
 
468 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  30.45 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2139  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  28.53 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 
389 aa  77.8  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  33.93 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.45 
 
 
359 aa  77  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 
402 aa  77  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1675  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 
366 aa  77  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.447182  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  21.95 
 
 
350 aa  77  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  21.95 
 
 
350 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.98 
 
 
365 aa  76.6  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
364 aa  76.3  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 
369 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  34.29 
 
 
353 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  24.67 
 
 
371 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4843  glycosyl transferase, group 1  21.88 
 
 
395 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000641905  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 
389 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  22.53 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
405 aa  73.9  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
388 aa  73.9  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  21.47 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  32.67 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.09 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  27 
 
 
427 aa  73.2  0.000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2027  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  29.22 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  27 
 
 
430 aa  73.2  0.000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 
398 aa  73.2  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  37.76 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
365 aa  73.2  0.000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
412 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  31.21 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  21.68 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
383 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  28.02 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 
387 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  33.57 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1349  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 
433 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
389 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  23.43 
 
 
745 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3098  glycosyl transferase group 1  21.61 
 
 
363 aa  70.1  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 
382 aa  69.7  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
421 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  23.98 
 
 
356 aa  68.9  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
378 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>