More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2940 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2940  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 		 170 aa  357  6e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.51791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  49.4 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  55.56 
 
 		 146 aa  151  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  59.06 
 
 		 155 aa  150  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  50.94 
 
 		 171 aa  148  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  51.97 
 
 		 177 aa  148  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  47.7 
 
 		 174 aa  148  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  52.94 
 
 		 136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  53.54 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  56 
 
 		 185 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  57.26 
 
 		 167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  54.41 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  52.34 
 
 		 139 aa  143  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1907  protein-methionine-S-oxide reductase  56.1 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  53.38 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  51.94 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1480  methionine sulfoxide reductase B  52.94 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538813  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5959  methionine-R-sulfoxide reductase  56.45 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109162  normal  0.856375 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5715  methionine-R-sulfoxide reductase  56.45 
 
 		 171 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967491  normal  0.285245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  52.55 
 
 		 165 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  47.47 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1522  methionine-R-sulfoxide reductase  44.83 
 
 		 167 aa  141  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1586  protein-methionine-S-oxide reductase  49.33 
 
 		 176 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338285  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6721  methionine-R-sulfoxide reductase  49.33 
 
 		 176 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6245  methionine-R-sulfoxide reductase  49.33 
 
 		 176 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  0.670436 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  48.17 
 
 		 176 aa  140  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  51.97 
 
 		 133 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  51.2 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  51.61 
 
 		 134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  53.17 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  51.09 
 
 		 165 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  52.71 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  51.18 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  56.45 
 
 		 183 aa  139  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  54.55 
 
 		 137 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  51.97 
 
 		 135 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  46.25 
 
 		 166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  54.62 
 
 		 138 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3504  methionine-R-sulfoxide reductase  54.03 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2552  methionine-R-sulfoxide reductase  50.36 
 
 		 148 aa  137  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  48.44 
 
 		 148 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  52 
 
 		 134 aa  137  6e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  48.85 
 
 		 142 aa  137  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  44.64 
 
 		 174 aa  137  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  55.65 
 
 		 166 aa  137  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  50.39 
 
 		 131 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1902  methionine-R-sulfoxide reductase  54.84 
 
 		 135 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2396  protein-methionine-S-oxide reductase  50 
 
 		 140 aa  136  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.121368  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2709  peptide methionine sulfoxide reductase  45.61 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1612  methionine-R-sulfoxide reductase  49.21 
 
 		 130 aa  137  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0472443  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  53.17 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  53.17 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 159 aa  136  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4430  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1695  methionine-R-sulfoxide reductase  45.03 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2617  peptide methionine sulfoxide reductase  53.08 
 
 		 134 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0781659  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  49.22 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  51.59 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1275  methionine-R-sulfoxide reductase  53.08 
 
 		 134 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285091  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  50.79 
 
 		 136 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  50.81 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  51.61 
 
 		 166 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  44.3 
 
 		 164 aa  135  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  51.49 
 
 		 167 aa  134  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33670  methionine-R-sulfoxide reductase  51.22 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  52 
 
 		 131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  53.23 
 
 		 161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  49.61 
 
 		 131 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  54.03 
 
 		 198 aa  134  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  52.71 
 
 		 163 aa  133  9e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  50.38 
 
 		 138 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  51.64 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  51.59 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5357  methionine-R-sulfoxide reductase  53.91 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240425  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  49.6 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  51.59 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  52.42 
 
 		 190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  49.6 
 
 		 140 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0221  protein-methionine-S-oxide reductase  53.6 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  39.77 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  50.79 
 
 		 137 aa  132  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3781  protein-methionine-S-oxide reductase  50 
 
 		 151 aa  132  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  52.42 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  50.76 
 
 		 141 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  51.2 
 
 		 131 aa  131  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  47.24 
 
 		 140 aa  130  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17826  predicted protein  54.17 
 
 		 130 aa  131  6e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000128698  normal  0.029614 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  50.4 
 
 		 131 aa  130  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 138 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 128 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2749  methionine-R-sulfoxide reductase  52.42 
 
 		 154 aa  130  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0381303 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  51.13 
 
 		 136 aa  130  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  49.24 
 
 		 137 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 128 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  48.41 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  50.39 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  48.82 
 
 		 136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  50.4 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  50.39 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1817  methionine sulfoxide reductase B  51.64 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>