More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2740 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2740  serine dehydratase alpha chain  100 
 
 		 460 aa  948    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000127179  hitchhiker  0.000000403127 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2251  serine dehydratase alpha chain  51.54 
 
 		 454 aa  423  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.472865  normal  0.778553 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0011  serine dehydratase alpha chain  50.22 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1086  serine dehydratase alpha chain  44.97 
 
 		 502 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.787533 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1725  L-serine ammonia-lyase  42.76 
 
 		 458 aa  349  6e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0395889 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3047  L-serine dehydratase 1  43.19 
 
 		 460 aa  349  7e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2295  L-serine ammonia-lyase  42.76 
 
 		 458 aa  348  9e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0854  hypothetical protein  44.94 
 
 		 458 aa  348  1e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1538  L-serine dehydratase 1  42.98 
 
 		 458 aa  347  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00324731  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1325  L-serine ammonia-lyase  43.2 
 
 		 458 aa  347  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.138393 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2248  L-serine dehydratase 1  42.55 
 
 		 458 aa  347  3e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0828  hypothetical protein  44.94 
 
 		 458 aa  347  3e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0920  L-serine ammonia-lyase  45.96 
 
 		 458 aa  347  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1625  L-serine dehydratase 1  42.8 
 
 		 457 aa  347  3e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1804  L-serine ammonia-lyase  42.55 
 
 		 458 aa  347  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01946  L-serine dehydratase 1  44.16 
 
 		 457 aa  346  4e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0568801  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01684  L-serine ammonia-lyase  43.24 
 
 		 468 aa  346  4e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.737007  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0527  L-serine dehydratase 1  46.11 
 
 		 459 aa  347  4e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1084  L-serine dehydratase 1  44.06 
 
 		 472 aa  346  5e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2402  L-serine dehydratase 1  42.74 
 
 		 458 aa  345  1e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000825911  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1806  L-serine dehydratase 1  42.58 
 
 		 458 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0897  L-serine dehydratase 1  44.85 
 
 		 450 aa  343  5e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266509  normal  0.482369 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1942  L-serine dehydratase 1  42.67 
 
 		 458 aa  342  8e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0383387  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2524  L-serine dehydratase 1  42.67 
 
 		 458 aa  342  8e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.418304  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2406  L-serine dehydratase 1  42.67 
 
 		 458 aa  342  8e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2417  L-serine dehydratase 1  42.67 
 
 		 458 aa  342  8e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1946  L-serine dehydratase 1  42.24 
 
 		 458 aa  342  1e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3503  L-serine dehydratase 1  45.07 
 
 		 461 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2838  L-serine ammonia-lyase  41.85 
 
 		 458 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.947815  hitchhiker  0.0000107679 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2171  L-serine dehydratase 1  42.27 
 
 		 458 aa  340  4e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.633035  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0329  L-serine dehydratase 1  44.21 
 
 		 463 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0485  L-serine ammonia-lyase  44.86 
 
 		 461 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1625  L-serine dehydratase 1  42.89 
 
 		 458 aa  335  9e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0594859  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1024  L-serine dehydratase 1  42.31 
 
 		 458 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.846352 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3333  L-serine ammonia-lyase  43.31 
 
 		 458 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3215  L-serine dehydratase 1  44.47 
 
 		 529 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5127  L-serine dehydratase 1  44.44 
 
 		 461 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5152  L-serine dehydratase 1  44.44 
 
 		 461 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0987  L-serine dehydratase 1  42.31 
 
 		 458 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3251  L-serine ammonia-lyase  43.91 
 
 		 462 aa  333  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1429  L-serine ammonia-lyase  44.61 
 
 		 463 aa  333  4e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0423  L-serine dehydratase 1  44.17 
 
 		 470 aa  333  5e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4231  L-serine dehydratase 1  41.77 
 
 		 458 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4547  L-serine dehydratase 1  44.03 
 
 		 461 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5070  L-serine dehydratase 1  44.03 
 
 		 461 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2711  L-serine dehydratase 1  43.01 
 
 		 458 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.468733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2892  L-serine dehydratase 1  43.01 
 
 		 458 aa  330  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3483  L-serine ammonia-lyase  43.51 
 
 		 458 aa  329  6e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2900  L-serine dehydratase 1  42.86 
 
 		 458 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0992  L-serine dehydratase 1  42.41 
 
 		 458 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0082  L-serine ammonia-lyase  43.34 
 
 		 489 aa  329  8e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2991  L-serine ammonia-lyase  43.7 
 
 		 462 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3056  L-serine ammonia-lyase  43.7 
 
 		 462 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.541658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4002  L-serine ammonia-lyase  43.7 
 
 		 462 aa  328  9e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3314  L-serine ammonia-lyase  43.7 
 
 		 462 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.544154  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1546  L-serine ammonia-lyase  43.7 
 
 		 462 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0131  L-serine ammonia-lyase  43.7 
 
 		 462 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3931  L-serine ammonia-lyase  43.7 
 
 		 462 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.706313  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3144  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, single chain form  42.19 
 
 		 458 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3700  L-serine ammonia-lyase  42.15 
 
 		 457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1803  L-serine dehydratase 1  43.41 
 
 		 456 aa  327  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1955  L-serine ammonia-lyase  43.98 
 
 		 504 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6165  L-serine dehydratase  44.19 
 
 		 485 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4831  L-serine ammonia-lyase  43.61 
 
 		 462 aa  326  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0982  L-serine ammonia-lyase  43.97 
 
 		 459 aa  325  7e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2570  L-serine dehydratase 1  42.23 
 
 		 458 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3296  L-serine dehydratase  43.7 
 
 		 458 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0045  L-serine dehydratase  43.58 
 
 		 461 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.388959 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1863  L-serine ammonia-lyase  43.98 
 
 		 504 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3490  L-serine dehydratase 1  42.95 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0396  L-serine ammonia-lyase  44.19 
 
 		 545 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0995  L-serine ammonia-lyase  44.19 
 
 		 490 aa  324  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0292  L-serine dehydratase 1  43.74 
 
 		 459 aa  324  2e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.247697 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71060  L-serine dehydratase  43.86 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3334  L-serine dehydratase 1  43.84 
 
 		 462 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3591  L-serine dehydratase 1  41.82 
 
 		 475 aa  324  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1196  L-serine ammonia-lyase  43.55 
 
 		 477 aa  322  6e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.741628  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6540  L-serine dehydratase 1  41.79 
 
 		 459 aa  322  6e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00743621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0518  L-serine dehydratase 1  42.7 
 
 		 457 aa  323  6e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1601  L-serine ammonia-lyase  42.92 
 
 		 464 aa  322  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0155  L-serine dehydratase 1  43.63 
 
 		 462 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5047  L-serine dehydratase 1  43.22 
 
 		 464 aa  322  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.533739  normal  0.269496 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3321  L-serine ammonia-lyase  43.63 
 
 		 462 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3884  L-serine dehydratase 1  42.77 
 
 		 462 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3164  L-serine dehydratase 1  42.74 
 
 		 458 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0141  L-serine dehydratase 1  43.84 
 
 		 462 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4393  L-serine ammonia-lyase  41.77 
 
 		 458 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1195  L-serine dehydratase 1  43.55 
 
 		 477 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.197277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2913  L-serine dehydratase 1  43.63 
 
 		 462 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0129  L-serine dehydratase 1  43.84 
 
 		 462 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0142  L-serine dehydratase 1  43.63 
 
 		 462 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1754  L-serine ammonia-lyase  43.56 
 
 		 458 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.244789 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4369  L-serine ammonia-lyase  42.83 
 
 		 464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0215032  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4265  L-serine ammonia-lyase  43.37 
 
 		 460 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3015  L-serine dehydratase 1  42.95 
 
 		 462 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0740  L-serine dehydratase 1  42.89 
 
 		 455 aa  320  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0871  L-serine dehydratase 1  43.13 
 
 		 448 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5237  L-serine ammonia-lyase  42.83 
 
 		 458 aa  320  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0233321 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2603  L-serine dehydratase 1  42.55 
 
 		 473 aa  320  3e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26040  L-serine dehydratase  42.47 
 
 		 458 aa  320  5e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>