More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3753 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3753  peptidase U32  100 
 
 
343 aa  700    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  30.69 
 
 
439 aa  95.5  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  23.26 
 
 
783 aa  95.1  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  27.14 
 
 
838 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2182  peptidase U32  29.78 
 
 
805 aa  94.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0246456  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  22.26 
 
 
826 aa  92.8  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  25.58 
 
 
746 aa  92.4  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  26.58 
 
 
767 aa  92  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1022  peptidase U32  23.82 
 
 
471 aa  92  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3561  peptidase U32  24.26 
 
 
450 aa  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  25.81 
 
 
835 aa  90.1  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  25.07 
 
 
422 aa  89.7  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  30.05 
 
 
817 aa  89  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  24.49 
 
 
783 aa  88.6  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  24.49 
 
 
783 aa  88.6  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1033  collagenase  26.01 
 
 
667 aa  88.6  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.771528  normal  0.0721423 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  24.76 
 
 
406 aa  87.4  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1711  peptidase U32  23.44 
 
 
433 aa  87  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  23.88 
 
 
422 aa  87  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  24.92 
 
 
836 aa  86.7  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  27.32 
 
 
420 aa  86.7  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  25.67 
 
 
422 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  25.67 
 
 
422 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6230  putative peptidase  23.93 
 
 
464 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.327372  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3754  peptidase U32  27.27 
 
 
747 aa  86.3  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00540  Peptidase, U32 family  23.78 
 
 
453 aa  85.9  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.210117  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  22.48 
 
 
783 aa  86.3  8e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71820  putative peptidase  25.32 
 
 
464 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  25.9 
 
 
435 aa  86.3  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01986  predicted peptidase  22.91 
 
 
453 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1150  peptidase, U32 family  22.91 
 
 
453 aa  85.1  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.565411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1575  peptidase U32  22.91 
 
 
453 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004387  putative protease  26.18 
 
 
466 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4463  U32 family peptidase  24.4 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0393784  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2375  U32 family peptidase  22.91 
 
 
453 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4501  peptidase, U32 family  24.18 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260528  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01978  hypothetical protein  22.91 
 
 
453 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4277  U32 family peptidase  24.4 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4114  U32 family peptidase  24.4 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4125  U32 family peptidase  24.4 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0882  peptidase U32  26.62 
 
 
652 aa  85.1  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4609  U32 family peptidase  24.4 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.856132  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0977  U32 family peptidase  22.91 
 
 
453 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.51078 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3021  peptidase, U32 family  22.91 
 
 
453 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0605791 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0735  peptidase, U32 family  24.4 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0258645  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1560  peptidase U32  22.91 
 
 
453 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.657213  normal  0.902837 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4514  peptidase, U32 family  24.4 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000161437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4461  peptidase, U32 family  24.4 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643994 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  24.75 
 
 
653 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  24.75 
 
 
667 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  25.32 
 
 
839 aa  84  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4228  peptidase U32  24.4 
 
 
426 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  24.29 
 
 
873 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3718  peptidase U32  24.92 
 
 
442 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  24.75 
 
 
667 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2466  peptidase  24.05 
 
 
462 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  24.75 
 
 
667 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01024  protease  24.93 
 
 
466 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  24.75 
 
 
667 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  24.75 
 
 
653 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  24.75 
 
 
653 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  23.84 
 
 
886 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  24.41 
 
 
411 aa  84  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1983  peptidase U32  24.09 
 
 
654 aa  83.6  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  24.75 
 
 
653 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1208  U32 family peptidase  23.12 
 
 
464 aa  83.2  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000479963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2976  peptidase U32  22.51 
 
 
453 aa  83.2  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.470288  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1829  peptidase U32  23.1 
 
 
444 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3218  peptidase U32  27.53 
 
 
757 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000467027 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  21.69 
 
 
722 aa  82.8  0.000000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1301  peptidase U32  22.41 
 
 
748 aa  82.8  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.506544  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1304  peptidase U32  26.78 
 
 
453 aa  82.4  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0753  protease  25.17 
 
 
635 aa  82.4  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  24.18 
 
 
422 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3094  peptidase U32  23.81 
 
 
426 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.585219  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1325  peptidase U32  22.83 
 
 
464 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3532  peptidase U32  22.78 
 
 
444 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  23.55 
 
 
412 aa  82  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1323  collagenase prtC  22.35 
 
 
458 aa  82.4  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.768171  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3096  U32 family peptidase  22.83 
 
 
464 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00144888  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  21.94 
 
 
411 aa  82.4  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3150  peptidase U32  22.94 
 
 
440 aa  82.4  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0559462  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  24.01 
 
 
406 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  24.42 
 
 
654 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  24.42 
 
 
654 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  25.25 
 
 
790 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  23.55 
 
 
411 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2414  peptidase U32  23.41 
 
 
672 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215421  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  26.1 
 
 
872 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2698  peptidase U32  21.81 
 
 
453 aa  81.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  24.42 
 
 
654 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1050  putative protease  25.93 
 
 
418 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.861242  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  23.91 
 
 
792 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  24.19 
 
 
407 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  21.33 
 
 
427 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  24.42 
 
 
654 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4099  peptidase U32  23.19 
 
 
435 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  24.42 
 
 
654 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2321  peptidase, U32 family  22.49 
 
 
453 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  23.89 
 
 
818 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>