More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0698 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0698  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 		 306 aa  625  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468385  normal  0.685309 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2151  thioredoxin reductase, putative  37.37 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0912  Thioredoxin-disulfide reductase  35.76 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0542  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.13 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1622  thioredoxin-disulfide reductase  36.79 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.987193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0260  Thioredoxin-disulfide reductase  36.05 
 
 		 318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0215312 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  35.92 
 
 		 323 aa  158  9e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  35.18 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  35.95 
 
 		 312 aa  155  8e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1150  thioredoxin-disulfide reductase  35.53 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  35.05 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1531  Thioredoxin-disulfide reductase  36.18 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.22031  normal  0.0207408 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1945  thioredoxin-disulfide reductase  31.61 
 
 		 297 aa  145  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367983  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1503  thioredoxin-disulfide reductase  30.1 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.60655  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  33.77 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0360  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.98 
 
 		 291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000662719  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1300  thioredoxin-disulfide reductase  33.33 
 
 		 287 aa  139  7e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  34.84 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  34.53 
 
 		 326 aa  136  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  33.45 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  33.55 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  34.12 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2762  thioredoxin-disulfide reductase  32.48 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117857  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  34.44 
 
 		 318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  31.61 
 
 		 310 aa  132  5e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.22 
 
 		 316 aa  132  7.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  31.01 
 
 		 311 aa  132  9e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  34.54 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  32.01 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3874  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.32 
 
 		 548 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.697389  normal  0.0433305 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  33.64 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  32.04 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  35.35 
 
 		 327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.56 
 
 		 551 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  34.52 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  34.52 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  34.52 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2606  Thioredoxin-disulfide reductase  31.1 
 
 		 309 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234008  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  31.94 
 
 		 304 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  35.03 
 
 		 321 aa  129  8.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  30.62 
 
 		 306 aa  128  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  30 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  34.52 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  33.97 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  33.97 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  30.38 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  34.52 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0223  thioredoxin reductase  31.65 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  29.75 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  33.65 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  32.9 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  35.83 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00892  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  33.33 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  33.33 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00899  hypothetical protein  33.33 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1050  thioredoxin reductase  33.33 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000235297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0992  thioredoxin reductase  33.33 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000016798  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  33.33 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000099736  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  33.33 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  31.95 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0211  thioredoxin reductase  32.97 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  32.69 
 
 		 353 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  30.19 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2441  thioredoxin reductase  33.33 
 
 		 321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000126981  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0626  thioredoxin-disulfide reductase  31.41 
 
 		 320 aa  126  5e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.45 
 
 		 321 aa  126  6e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  30.77 
 
 		 318 aa  126  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1412  thioredoxin reductase  33.33 
 
 		 322 aa  125  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00718409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2475  Thioredoxin-disulfide reductase  32.67 
 
 		 293 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000395489  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  33.87 
 
 		 320 aa  125  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  31.49 
 
 		 313 aa  125  9e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  32.69 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  29.17 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  33.33 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  32.23 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  33.33 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  34.2 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  29.73 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  34.1 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  32.69 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  32.79 
 
 		 310 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  31.65 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0991  thioredoxin reductase  32.5 
 
 		 322 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0766  thioredoxin reductase  30.06 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0341299  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1023  thioredoxin reductase  32.5 
 
 		 322 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00170984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.2 
 
 		 427 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  32.47 
 
 		 361 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1057  thioredoxin reductase  32.5 
 
 		 322 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00951777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0632  thioredoxin reductase (NADPH)  33.23 
 
 		 323 aa  123  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00998267  normal  0.636604 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0963  thioredoxin reductase  32.5 
 
 		 322 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000679645  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  33.44 
 
 		 331 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1072  thioredoxin reductase  32.5 
 
 		 322 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00976208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  31.7 
 
 		 326 aa  123  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  30.84 
 
 		 310 aa  123  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0901  Thioredoxin-disulfide reductase  33.44 
 
 		 313 aa  123  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0321  thioredoxin-disulfide reductase  30.28 
 
 		 319 aa  122  5e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.101036  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  31.99 
 
 		 402 aa  122  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0776  thioredoxin-disulfide reductase  31.41 
 
 		 321 aa  122  7e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.624753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  34.46 
 
 		 308 aa  122  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  31.73 
 
 		 311 aa  122  8e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>