More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0912 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0912  Thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 		 305 aa  613  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0542  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.31 
 
 		 302 aa  396  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1622  thioredoxin-disulfide reductase  65.31 
 
 		 309 aa  388  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.987193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2151  thioredoxin reductase, putative  63.45 
 
 		 297 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0260  Thioredoxin-disulfide reductase  64.83 
 
 		 318 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0215312 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1945  thioredoxin-disulfide reductase  41.98 
 
 		 297 aa  225  8e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367983  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1503  thioredoxin-disulfide reductase  42.18 
 
 		 292 aa  223  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.60655  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0360  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.52 
 
 		 291 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000662719  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1252  Thioredoxin-disulfide reductase  41.98 
 
 		 327 aa  205  9e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0698  thioredoxin-disulfide reductase  35.76 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468385  normal  0.685309 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1150  thioredoxin-disulfide reductase  36.54 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  36.04 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  36.16 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.16 
 
 		 306 aa  158  9e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  34.55 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  33.22 
 
 		 313 aa  155  7e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.06 
 
 		 551 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  33.44 
 
 		 302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0766  thioredoxin reductase  37.5 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0341299  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  37.7 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  34.01 
 
 		 319 aa  149  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  33.66 
 
 		 396 aa  149  8e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  35.43 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0204  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.67 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.642537  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0782  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.55 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  36.07 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  32.8 
 
 		 318 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  31.48 
 
 		 304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  33.65 
 
 		 346 aa  145  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  33.33 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3874  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.33 
 
 		 548 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.697389  normal  0.0433305 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1749  thioredoxin-disulfide reductase  35.67 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1696  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  32.55 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  33.11 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  33.44 
 
 		 327 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  31.51 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  33.45 
 
 		 402 aa  143  5e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  34.87 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0151  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.86 
 
 		 302 aa  142  5e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000739303  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0210  AhpF family protein/thioredoxin reductase  32.9 
 
 		 550 aa  142  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.018  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  33.56 
 
 		 322 aa  142  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  31.38 
 
 		 339 aa  142  6e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  33.45 
 
 		 313 aa  142  8e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25100  thioredoxin reductase  32.05 
 
 		 552 aa  142  8e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  34.2 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  34.81 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  34.43 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  32.35 
 
 		 310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1300  thioredoxin-disulfide reductase  31.63 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1134  thioredoxin reductase  34.3 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.788555 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  30.13 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.97 
 
 		 316 aa  139  4.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  33.55 
 
 		 310 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  35.37 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  33.9 
 
 		 325 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  33 
 
 		 319 aa  139  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  31.07 
 
 		 310 aa  139  6e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  35.1 
 
 		 311 aa  139  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  34.77 
 
 		 320 aa  139  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  34.09 
 
 		 311 aa  139  7.999999999999999e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  34.92 
 
 		 304 aa  138  8.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  33.89 
 
 		 306 aa  138  8.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  35.02 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  34.13 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  32.91 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  34.31 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  31.19 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  32.76 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  30.72 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  32.2 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  33.22 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.23 
 
 		 427 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  34.55 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  30.42 
 
 		 344 aa  136  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.61 
 
 		 579 aa  136  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  33.56 
 
 		 334 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  30.94 
 
 		 318 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  30.94 
 
 		 318 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  30.94 
 
 		 318 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  31.86 
 
 		 333 aa  135  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  30.94 
 
 		 318 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  30.94 
 
 		 321 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  30.94 
 
 		 321 aa  135  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  30.94 
 
 		 321 aa  135  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  31.88 
 
 		 326 aa  135  9e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  30.62 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  32.56 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  31.16 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  32.88 
 
 		 311 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  32.85 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  31.68 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  32.56 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  30.94 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  31.08 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  30.94 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  33.33 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  33.01 
 
 		 316 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  35.18 
 
 		 321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  30.29 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>